1D ve 2D Jel Elektroforezi Arasındaki Fark

temel fark 1D ve 2D jel elektroforezi arasında jel elektroforezi üzerinde proteinlerin ayrılması için kullanılan özelliklerdir. 1D jel elektroforezi proteinleri sadece moleküler ağırlığa göre ayırırken, 2D jel elektroforezi proteinleri izo-elektrik noktasına ve moleküler ağırlığına göre ayırır.

Jel elektroforezi ile protein ayrılması proteinleri karakterize etmek için önemli bir tekniktir. Proteinler değişen özelliklere sahiptir; bu nedenle ayırma, Agarose jel elektroforezi ile DNA ayrılmasına kıyasla daha karmaşıktır.

İÇİNDEKİLER

1. Genel Bakış ve Temel Fark
2. 1D Jel Elektroforezi Nedir
3. 2D Jel Elektroforezi Nedir
4. 1D ve 2D Jel Elektroforezi Arasındaki Benzerlikler
5. Yan Yana Karşılaştırma - Tablo Şeklinde 1D ve 2D Jel Elektroforez
6. Özet

1D Jel Elektroforezi Nedir?

Bir boyutlu jel elektroforezi olarak da bilinen 1D Jel Elektroforezi, moleküler ağırlığa dayanan bir protein ayırma yöntemidir. Protein ayırma esas olarak poliakrilamid jel elektroforezi kullanılarak gerçekleştirilir. Jel elektroforezi kavramına dayanarak moleküller, moleküler ağırlık ve yük özelliklerinden ayrılırlar..

Bu nedenle, proteinlere düzgün bir yük vermek için, jel elektroforezinden önce Sodyum dodesil sülfat (SDS) tedavisi yapılır. SDS proteinleri denatüre eder ve protein üzerinde düzgün bir negatif yük sağlar; elektrik alanının uygulanması gerçekleştiğinde, proteinler moleküler ağırlıklarına göre pozitif terminale geçer. Böylece, ayrılıkta, sadece bir özellik dikkate alınır. Bu yüzden bu yöntem 1D jel elektroforezi olarak adlandırılır.

Şekil 01: 1D Jel Elektroforezi

1D jel elektroforezi sırasında proteinler moleküler ağırlıklarına göre ayrılır. Bu bağlamda, düşük molekül ağırlıklı moleküller jelde yüksek molekül ağırlıklı proteinlere kıyasla daha hızlı göç ederler. Böylece, yüksek ağırlıklı proteinler kuyulara yakın kalır.

2D Jel Elektroforezi Nedir?

2D jel elektroforezi veya iki boyutlu jel elektroforezi, proteinleri iki özelliğe göre ayırır. İki özellik, proteinin izo-elektrik noktası ve molekül ağırlığıdır. Bu protein ayırma yöntemi, protein ayırmanın çözünürlüğünü arttırır. Proteinin izoelektrik noktası, proteinin nötr olduğu pH'a bağlıdır.

Resim 02: 2D Jel Elektroforezi

Böylece, 2D jel elektroforezinde, proteinin birinci boyutta sabit bir pH gradyanı üzerinde çalışmasına izin verilir. İkinci boyutta, proteinler dikey veya yatay poliakrilamid jel elektroforezi kullanılarak ayrılır. Böylece, proteinler ikinci boyuttaki moleküler ağırlıklarına göre ayrılırlar..

Ayrıca, bu jel elektroforezi yöntemi, protein ayrılmasının çözünürlüğünü arttırır. Bu nedenle, ayrılmış proteinler daha saftır. Bununla birlikte, tekniğin maliyeti bir boyut jel elektroforezinden çok daha yüksektir.

1D ve 2D Jel Elektroforezi Arasındaki Benzerlikler Nelerdir??

• Her iki teknik de proteinleri ayırır.
• Bu nedenle proteinleri karakterize etmede önemlidirler.

1D ve 2D Jel Elektroforezi Arasındaki Fark Nedir??

1D ve 2D jel elektroforezi arasındaki temel fark, 1D jel elektroforezinin proteinleri sadece moleküler ağırlığa göre ayırması, 2D jel elektroforezinin proteinleri hem izo-elektrik noktası hem de moleküler ağırlığa göre ayırmasıdır. 1D ve 2D jel elektroforezi arasındaki bu temel farktan dolayı, proteinlerin ayrılmasının çözünürlüğü ve iki tekniğin maliyeti de değişir. 2D jel elektroforezi, 1D jel elektroforezinden daha yüksek çözünürlük gösterir. Bununla birlikte, 2D jel elektroforezi 1D jel elektroforezinden daha maliyetlidir.

Aşağıdaki infografik 1D ve 2D jel elektroforezi arasındaki farkı özetler.

Özet - 1D ve 2D Jel Elektroforezi

Proteinlerin ayrılması birçok faktöre dayanır. 1D jel elektroforezi proteinleri sadece moleküler ağırlığa göre ayırır. Bununla birlikte, iki boyutlu veya 2D jel elektroforezi, protein ayrılmasının çözünürlüğünü arttırır. Ayrıca 2D jel elektroforezi, proteinleri izo-elektrik noktasına ve moleküler ağırlığa göre ayırır. Bu nedenle, bu veriler proteinlerin akış aşağısında işlenmesi ve proteomik alanında önemlidir. Böylece, bu 1D ve 2D jel elektroforezi arasındaki farkın özeti.

Referans:

1. Galeva, Nadezhda ve MichailAltermann. “Sıçan Karaciğer Mikrozomlarının Proteomik Analizi için Bir Ayırma Aracı Olarak Tek Boyutlu ve İki Boyutlu Jel Elektroforezinin Karşılaştırılması: Sitokromlar P450 ve Diğer Membran Proteinleri.” Proteomik, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi, Haziran 2002, Buradan ulaşabilirsiniz.

Görünüm inceliği:

1. “Elektroforez - 1D jel kuyucuklarının protein karışımı ile doldurulması” Jean-Etienne Poirrier - 1D jel kuyucuklarının protein karışımı ile doldurulması (CC BY-SA 2.0) Commons Wikimedia üzerinden
2. Ulusal Sağlık Enstitüsü tarafından “2D elektroforez” - Kanser Araştırmaları Nanobiyoloji Programı Merkezi, Commons Wikimedia üzerinden Ulusal Sağlık Enstitüsü (Kamusal Alan)