Alfa ve Beta Helix Arasındaki Fark

temel fark Alfa ve beta sarmalı arasındaki bu yapıların geliştirilmesinde oluşturdukları Hidrojen bağlarının türüne dayanır.. Alfa sarmalları moleküler hidrojen bağları, beta sarmalları moleküller arası hidrojen bağları oluşturur.

Karmaşık proteinler dört yapısal organizasyon seviyesine sahiptir - birincil, ikincil, üçüncül ve kuaterner. Proteinlerin sekonder yapıları farklı yönlerde peptit zincirlerini oluşturur. Peptit zincirleri, peptit bağlarıyla bağlanan amino asit sekanslarından oluşur. Bu nedenle, proteinlerde alfa sarmalı ve beta sarmalı olarak iki ana ikincil yapı vardır. Ek olarak, beta dönüş ve saç tokası yapıları olarak adlandırılan diğer ikincil yapılar da vardır. Temel olarak, bu makale alfa ve beta sarmalı arasındaki farka odaklanmaktadır..

İÇİNDEKİLER

1. Genel Bakış ve Temel Fark
2. Alfa Sarmalı nedir
3. Beta Sarmalı nedir
4. Alfa ve Beta Helix Arasındaki Benzerlikler
5. Yan Yana Karşılaştırma - Tablo Şeklinde Alfa ve Beta Helix
6. Özet

Alpha Helix nedir?

Proteinler dört yapısal organizasyon seviyesine sahiptir. Bunlardan alfa sarmalı, proteinlerin en yaygın ikincil yapısıdır. Ve bu yapı, merkezi bir eksen etrafına sarılmış bir çubuk olarak görünür. Ayrıca, alfa sarmalı sağlak bir sarmaldır. Ancak solak helisler de mevcut olabilir. Burada peptit bağları, amino terminalden karboksi terminaline oluşur. Amino asitler, bu peptit bağları yoluyla birbirine bağlanır. Molekül içi hidrojen bağları, alfa sarmalının oluşturulmasının ana nedenidir.

Şekil 01: Alfa Sarmalı

Alfa sarmalının düzenlenmesi, proteinin hidrofilik ve hidrofobik doğasına bağlıdır. Amino asit sekansı yüksek sayıda hidrofilik R (değişken) gruptan oluşuyorsa, R grupları sulu faza yönelir. Değişken gruplar hidrofobik ise, çevrenin hidrofobik fazına sıçrayacaklardır. Her iki senaryoda da, R gruplarının sarmal yapıdan dışarı çıktığı görülmektedir. Bu yapısal özellikler nedeniyle, alfa sarmalı mutasyonlara karşı daha dirençlidir. Böylece, Hidrojen bağlarının varlığı alfa sarmalının yapısını stabilize eder. Bir alfa sarmalında dönüş başına ortalama 3.6 tortu vardır, çünkü hidrojen bağlarının gelişmesi için 3.6 tortu gerekir. Kollajen ve keratin gibi bazı yapısal proteinler alfa helisleri bakımından zengindir.

Beta Sarmalı nedir?

Bir beta sarmalı, bir proteinin ikinci en yaygın ikincil yapısıdır. Alfa sarmalı kadar yaygın olmasa da, beta sarmallarının varlığı protein yapısında da önemli bir rol oynar. Beta sarmalının oluşumu, paralel veya anti-paralel bir şekilde düzenlenmiş iki beta sayfası aracılığıyla gerçekleşir. Bu tabakalar daha sonra sarmal bir yapı oluşturur. İki tabaka ipliği arasındaki moleküller arası Hidrojen bağları bir beta sarmalının oluşumuna yardımcı olur.

Resim 02: Beta Sarmalı

Beta helisleri, bağlanma modellerine bağlı olarak hem sağ elle hem de sol elle olabilir. Bir beta sarmalı oluştururken, iki beta yaprağının değişken grupları sarmalın çekirdeği içinde düzenlenir. Bu nedenle, beta yaprakları oluşturan grupların çoğunluğunun hidrofobik işlevleri vardır.

Alfa sarmalının aksine, 17 kalıntı Beta sarmallarında bir dönüş oluşturur. Metal iyonları Beta sarmalının oluşumunu aktive etme yeteneğine sahiptir. Alfa sarmalına benzer şekilde, Hidrojen bağları Beta sarmalının yapısını korumaya yardımcı olur. Karbonik anhidraz enzimi ve pektat liyazı beta sarmalları açısından zengin iki proteindir.

Alfa ve Beta Helix Arasındaki Benzerlikler Nelerdir??

• Alfa ve Beta Sarmalı proteinlerin ikincil yapılarıdır.
• Amino asitler her iki ikincil yapının monomerleridir.
• Ayrıca, alfa ve beta helislerin kimyasal bileşenleri karbon, hidrojen, oksijen, azot ve kükürttür.
• Ayrıca, her iki ikincil yapı da daha üst düzey bir organizasyon haline gelir.
• Ayrıca, her ikisi de hidrojen bağları ile stabilize edilir.
• Her iki yapıda da hidrofobiklik, amino asitlerin R gruplarının varlığı ile belirlenir..

Alfa ve Beta Helix Arasındaki Fark Nedir??

Alfa ve beta sarmalı arasındaki temel fark, gösterdikleri hidrojen bağı tipidir. Alfa sarmalı moleküler hidrojen bağı gösterirken, beta sarmalı moleküller arası hidrojen bağı gösterir. Ek olarak, alfa sarmalı sağ elle sarmal oluştururken, beta sarmalı hem sağ hem de sol elle sarmal oluşturabilir. Yani, bu alfa ve beta sarmalı arasında da önemli bir fark..

Ayrıca, alfa ve beta sarmalı arasındaki diğer bir fark, alfa sarmalı formasyonunun amino asit sekansının bükülmesi ile gerçekleşmesidir, oysa beta sarmalı formasyonunda, paralel veya anti-paralel iki beta tabakası sarmal yapıyı oluşturmak üzere bağlanır.

Aşağıdaki bilgi grafiği, alfa ve beta sarmalı arasındaki farkla ilgili daha fazla bilgi sunar.

Özet - Alpha vs Beta Helix

Hem alfa helisleri hem de beta helisleri, karmaşık protein yapılarını tanımlamak ve çıkarmak için önemlidir. Her iki tip de proteinlerin ikincil yapılarıdır. Bununla birlikte, alfa sarmalı amino asit dizilerinin sarmal bir bükümüdür. Aksine, beta sarmalı oluşumu paralel veya anti-paralel beta tabakalarının Hidrojen bağlanması ile olur. Ayrıca, Hidrojen bağı alfa sarmal formunda moleküller arasıdır, hidrojen bağı beta sarmalı formda moleküller arasıdır. Ayrıca, her iki yapı da proteinin hidrofobikliğini belirleyen bir R grubuna sahiptir. Böylece, bu alfa ve beta sarmalı arasındaki farkı özetler.

Referans:

1. “Protein Yapısı Emirleri.” Khan Academy, Khan Academy, Burada mevcut.
2. “Protein İkincil Yapısı: α-Helisler ve β-Levhalar.” Yapısal Biyoinformatik: Pratik Kılavuz, Buradan ulaşabilirsiniz.

Görünüm inceliği:

1. “Alfa beta yapısı (2)” Thomas Shafee tarafından - Commons Wikimedia üzerinden kendi çalışması (CC BY-SA 4.0)
2. “1m8n Choristoneura fumiferana” WillowW tarafından Commons Wikimedia üzerinden Vikipedi Vikipedi (CC BY-SA 3.0)