DNA, ökaryotik organizmaların çekirdeğinde bulunur ve bir sonraki kuşağa aktarılan kalıtım bilgisini içerir. Öneminden dolayı DNA, histon proteinlerinin etrafına sıkıca sarılır ve hasardan korumak için ökaryotik hücrelerin kromozomları içinde oldukça kararlı bir yapıya yoğuşturulur. Histon proteinleri ile DNA'nın bu yoğunlaşmış, karmaşık yapısı kromatin olarak bilinir. Kromatin, nükleozom adı verilen temel yapısal birimlerden oluşur. Nükleozom, sekiz histon proteinine sarılı küçük bir DNA uzunluğu olarak tanımlanabilir. Kromatin ve nükleozom arasındaki temel fark, kromatin karmaşık DNA ve proteinlerin bütün bir yapısıdır süre nükleozom, kromatinin temel bir birimidir.
İÇİNDEKİLER
1. Genel Bakış ve Temel Fark
2. Kromatin nedir
3. Nükleozom nedir
4. Yan Yana Karşılaştırma - Chromatin vs Nucleosome
5. Özet
Çekirdekteki DNA, serbest doğrusal iplikçik formunda mevcut değildir. Histon adı verilen proteinlerle ilişkilidir ve kromatin adı verilen bir yapıya yoğunlaşır. Dolayısıyla, kromatin histon proteinleri ile yüksek derecede yoğunlaşmış DNA formu olarak tanımlanabilir. Mikroskop altında, kromatin, şekil 01'de gösterildiği gibi boncuklardan oluşan bir dizi olarak görünür. Bir boncuk nükleozom olarak bilinir ve kromatinin temel yapısal birimidir. Kromatin, ökaryotik organizmaların kromozomlarını oluşturur ve çekirdeğin içinde paketlenir. Kromatinin yapısı sadece mikroskop altında hücre bölünmesi sırasında görülebilir.
Ökromatin ve heterokromatin olmak üzere iki tür kromatin vardır. Euchromatin, ekspresyon sırasında RNA'ya kopyalanabilen daha az yoğunlaştırılmış kromatindir. Heterokromatin, normalde RNA'ya kopyalanmayan yüksek derecede yoğunlaştırılmış kromatindir. Kromatin formunda yoğunlaştırılmış süper sargılı DNA, küçük bir hacme sahip olan çekirdeğin içine paketlenmek için en uygunudur.
Kromatinin ana işlevi, çok küçük bir hacme sahip olan çekirdeğin içinde DNA'yı verimli bir şekilde paketlemektir. Kromatinler ayrıca DNA yapısını ve dizisini korumak, mitoza ve mayoz bölünmeye izin vermek, kromozomal kırılmaları önlemek, gen ekspresyonunu düzenlemek ve DNA replikasyonu gibi ek işlevler de yerine getirir..
Resim 01: Kromatin
Nükleozom, çekirdek histon proteini etrafına sarılan küçük bir kromatindir. Bir dizede bir boncuk gibi görünüyor. Çekirdek histon proteini, sekiz histon proteininden oluşan bir oktamerdir. Her histon proteinden iki kopya çekirdek oktamerde bulunur. Çekirdek oktamerdeki histon protein bileşimi H2A, H2B, H3 ve H4'tür. Çekirdek DNA, globüler çekirdek histon oktamerini sıkıca sarar ve bir nükleozom yapar. Nükleozomlar daha sonra zincir benzeri bir yapıya yerleştirilir ve kromozomlardaki kromatini yapmak için ek histon proteinlerinin etrafına sıkıca sarılır.
Nükleozomda histon oktamer etrafına sarılan çekirdek DNA dizisinin uzunluğu yaklaşık 146 baz çiftidir. Nükleozomun yaklaşık çapı 11 nm'dir ve kromatin (solenoid) içindeki nükleozom spirali 30 nm'lik bir çapa sahiptir. Nükleozomlar, nükleolus içindeki sıkıca sarılmış yapıya paketlenmek için ek histon proteinleri tarafından desteklenir.
Resim 02: Nükleozom
Chromatin ve Nükleozom | |
Kromatin, histon proteinleri ile yüksek derecede yoğunlaşmış DNA formudur. | Nükleozom çekirdekte temel bir kromatindir. |
Kompozisyon | |
Kromatin DNA ve histon proteinlerinden oluşur. | Nükleozom 147 baz çifti uzunluğunda DNA ve sekiz histon proteininden oluşur. |
Görünüm | |
Kromatin süper sarmal lif yapısına benziyor. | Nükleozom bir dizede bir boncuk gibi görünüyor |
Kromatin, DNA ve histon proteinlerinin bir kompleksidir. Histon proteinleri ile sarılmış bir nükleozom zincirinden oluşur. Nükleozom, 147 baz çifti uzunluğunda DNA ve sekiz histon proteininden oluşan kromatinin temel birimidir. Bir nükleozom zinciri, histon proteinleri ile sarılır ve çekirdeğin içinde paketlenecek en kararlı DNA formu olan oldukça organize bir kromatin yapısına yoğunlaşır. Bu kromatin ve nükleozom arasındaki farktır.
Referanslar
1. “Kromatin yapısı ve işlevi: bir kılavuz.” Kromatin Yapısı ve Fonksiyonu: Abcam tarafından bir rehber. N.p., 20 Nisan 2017. Web. 20 Nisan 2017
2. Luger, Karolin, Mekonnen L. Dechassa ve David J. Tremethick. “Nükleozom ve kromatin yapısına yeni bakışlar: düzenli bir durum mu yoksa düzensiz bir durum mu?” Doğa yorumları. Moleküler hücre biyolojisi. ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi, 22 Haziran 2012. Web. 20 Nisan 2017
Görünüm inceliği:
1. Commons Wikimedia üzerinden OpenStax (CC BY 4.0) tarafından “0321 DNA Makro Yapısı”
2. “Nucleosome” Spellcheck tarafından varsayılmıştır. Commons Wikimedia üzerinden kendi çalışması (telif hakkı taleplerine dayanarak) (Kamusal Alan)