Cosmid ve Phagemid Arasındaki Fark

temel fark Cosmid ve Phagemid arasında içerdiği sekansların tipi bulunur. Bir Cosmid, bir cos bölgesi ve bir plazmid içerir. Bu nedenle, bir hibem vektörü, bir Phagemid, F1 fajının F1 orijinallerini içeren bir plazmittir.

Kozmidler ve Phagemidler klonlama amacıyla, özellikle daha büyük DNA parçalarını klonlamak için kullanılır. Bunlar özellikle çeşitli proteinlerin üretiminden sorumlu genlerin klonlanmasında yaygın olarak kullanılmaktadır. Kozmidler ve Phagemidler ya tek başına plazmidler olarak replike edilir veya viral partiküller halinde paketlenir ve sonra replike edilir.

İÇİNDEKİLER

1. Genel Bakış ve Temel Fark
2. Kozmid nedir
3. Phagemid nedir
4. Cosmid ve Phagemid Arasındaki Benzerlikler
5. Yan Yana Karşılaştırma - Tablo Şeklinde Cosmid vs Phagemid
6. Özet

Bir Cosmid nedir?

Bir hibrid plazmid olarak adlandırılan bir Cosmid, Lambda faj partiküllerinden ekstrakte edilen cos bölgelerini ve bir plazmidi içerir. Bu cos sahaları 200 temelli uzun DNA parçalarıdır. Dolayısıyla, plazmidin viral DNA'ya sığmasını sağlayan yapışkan veya yapışkan uçları vardır. Bu nedenle, cos yerleri DNA'nın paketlenmesi için hayati önem taşır.

Üç tane cos sitesi var;

• cosN bölgesi - DNA zincirinin terminaz aktivitesi ile kesilmesinde rol oynar
• cosB sitesi - terminazı tutmakla meşgul.
• cosQ bölgesi - DNA'nın DNazlar tarafından bozulmasını önlemede rol oynar.

Resim 01: Kozmid

Ayrıca, Kozmidler uygun bir replikasyon kaynağı kullanılarak tek sarmallı DNA veya çift sarmallı DNA'yı çoğaltabilir. Kozmidler genellikle transformantların seçiminde belirteç olarak antibiyotik direnç genleri içerir. Böylece, bir kozmidin vektör olarak kullanılması klonlamayı kolaylaştırabilir ve vektörün kısıtlama enzimi sindirimi daha sonra bu fragmanları ekstrakte edebilir.

Phagemid nedir (fazmit)?

Phagemid, aynı zamanda fazmit, aynı zamanda bir hibrid vektör türüdür. Phagemid, f1 replikasyon kaynağı olarak adlandırılan özel bir replikasyon kaynağı içerir. F1 replikasyon kaynağı bir f1 fajından özütler.

Phagemid hem tek sarmallı hem de çift sarmallı DNA'yı çoğaltabilir. Çoğaltma, bağımsız çoğaltma yapılırken bir plazmid olarak gerçekleşebilir veya faj partiküllerine paketlenebilir ve son olarak bakteriyel konakçıya bulaşabilir E coli. Enfekte ederken E coli hücreleri, f1 faj bir pilus varlığını gerektirir. Bu nedenle, seks pili sırasında önemlidir laboratuvar ortamında Phagemidlerin ambalajlanması.

Cosmid ve Phagemid Arasındaki Benzerlikler Nelerdir??

• Hem Cosmid hem de Phagemid, rekombinant DNA teknolojisinde kullanılan klonlama vektörleridir.
• Cosmid ve Phagemid tek sarmallı ve çift sarmallı DNA'yı çoğaltabilir.
• Her ikisi de plazmidlere benzer bağımsız replikasyona uğrayabilir.
• Cosmid ve Phagemid geçebilir laboratuvar ortamında bakteriyel hücrelerin paketlenmesi ve enfekte edilmesi.
• Hem Cosmid hem de Phagemid klonlama için uygun bir replikasyon kaynağı gerektirir.

Cosmid ve Phagemid Arasındaki Fark Nedir??

Cosmid ve Phagemid
Cosmid, bir cos bölgesi ve bir plazmid içeren hibrit bir vektördür.	Phagemid, F1 fajının F1 orijinli replikasyonunu içeren bir plazmiddir.
Cos Sitelerinin Varlığı
Cos sahaları cosmid içinde bulunur ve in vitro paketleme için gereklidir.	Çünkü fajmidlerde cos siteleri yoktur.
F1 Çoğaltma Kökeni Varlığı
Kozmidde fi replikasyon kaynağı mevcut olabilir veya olmayabilir.	Phagemid'de F1 replikasyon orijini bulunur.
Antibiyotik Dirençli Genlerin Varlığı
Dönüştürücü olmayanlardan transformantları tanımlamak için kozmidlerde antibiyotik dirençli genler bulunur.	Fajemidlerde antibiyotiğe dirençli genler yoktur.
İn Vitro Ambalajlama Gereksinimi
Cos sitesi gerektirir.	Seks pili gerektirir.

özet - Cosmid vs Fajemid

Cosmid ve Phagemid, rekombinant DNA teknolojisinde kullanılan klonlama vektörleridir. Kozmidler, cos siteleri olarak bilinen özel yapışkan uçlar içeren hibrit vektörlerdir. laboratuvar ortamında ambalaj bu cos siteleri gerektirir. Fajmidler, f1 fajından ekstre edilen bir f1 replikasyon kaynağı içeren plazmidlerdir. Hem kozmid hem de fajemid bağımsız replikasyona girebilir veya laboratuvar ortamında bakteri hücrelerine ambalajlama. Bunlar kozmid ve fajmid arasındaki önemli farklardır..

Referans:

1.Qi, H, vd. “Faj Ekranı için Fajemid Vektörleri: Özellikler, Özellikler ve İnşaat.” Moleküler Biyoloji Dergisi., ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi, 30 Mart 2012. Buradan ulaşabilirsiniz 
2.Kolinler, J ve B Hohn. “Kozmidler: Bakteriyofaj Lambda Kafalarında Vitro Olarak Paketlenebilen Bir Tip Plazmid Gen Klonlama Vektörü.” Amerika Birleşik Devletleri Ulusal Bilimler Akademisi Bildirileri, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi, Eylül 1978. Buradan erişilebilir  

Görünüm inceliği:

1.'Cosmid (İngilizce) 'Zlir'a (CC0) Commons Wikimedia üzerinden