temel fark DNA ve cDNA arasında DNA hem eksonları hem de intronları içerirken cDNA sadece eksonları içerir.
DNA ve cDNA, deoksiribonükleotitlerden oluşan iki tip nükleik asittir. DNA, genomu yapan canlı organizmaların en önemli makromoleküllerinden biridir. Genom, bir organizmanın genel genetik bilgisini içerir. Kodlayıcı sekanslar olan eksonlar ve kodlayıcı olmayan sekanslar olan intronlar dahil olmak üzere farklı sekans türleri oluşturur. Öte yandan, cDNA veya tamamlayıcı DNA, bilim adamları tarafından yapay olarak mRNA moleküllerinden sentezlenen başka bir DNA formudur. CDNA mRNA şablonlarından türetildiğinden, kodlamayan diziler veya intronlar içermez.
1. Genel Bakış ve Temel Fark
2. DNA nedir
3. cDNA nedir
4. DNA ve cDNA Arasındaki Benzerlikler
5. Yan Yana Karşılaştırma - Tablo Şeklinde DNA vs cDNA
6. Özet
Deoksiribonükleik asit veya DNA, bakteriler de dahil olmak üzere birçok canlı organizmanın genetik materyali olarak işlev görür. Genetik bilgi, DNA moleküllerinde nükleotit sekansları ve genleri formunda bulunur. Üreme sırasında ebeveyn DNA, gametlerle yavru nesline aktarır. Yapısal olarak DNA, deoksiribonükleotitlerin monomerlerinden oluşan bir makromoleküldür. Deoksiribonükleotidin üç bileşeni vardır; deoksiriboz şeker, azotlu bir baz (adenin, guanin, sitozin ve timin) ve bir fosfat grubu. Ayrıca DNA molekülleri, tamamlayıcı azotlu bazlar arasındaki hidrojen bağları ile bağlanan iki tamamlayıcı DNA dizisinden yapılmış çift sarmal olarak bulunur. Buna göre, adenin ve timin arasında iki hidrojen bağı varken sitozin ve guanin arasında üç hidrojen bağı vardır..
Resim 01: DNA
DNA sarmalında, fosfat ve şeker kısımları sarmalın dışında bulunurken, bazlar sarmalın içinde kalır. İki DNA dizisi zıt yönlerde ilerler. Ayrıca, DNA molekülleri histon proteinleri ile sıkıca sarılır ve ökaryotlarda kromozom adı verilen iplik benzeri yapılar yapar. DNA'nın önemli bir özelliği, kendi kendini kopyalamasıdır, yani kendi kendini kopyalayabilir veya kopyalayabilir. Ayrıca canlı organizmaların protein sentezinde de önemli bir rol oynar..
cDNA, tamamlayıcı DNA'yı temsil eder. Ters transkriptaz enzimi varlığında bir şablon görevi gören haberci RNA (mRNA) tarafından yapay olarak sentezlenen bir DNA formudur. Çoğu ökaryotta, genomik DNA, eksonlardan ve intronlardan oluşan birçok gen içerir. Eksonlar kodlayıcı dizilerken intronlar kodlamayan genomun bir parçası haline gelir. Genel olarak, gen ekspresyonu sırasında, duyu DNA dizisi bir protein üretmeden önce bir mRNA dizisine transkripsiyon yapar. Olgun bir mRNA yaparken, bir ekleme mekanizması tüm intron sekanslarını kaldırır. Bu nedenle, olgun mRNA intronları veya kodlamayan dizileri içermez.
Ayrıca ökaryotik hücrelerin mRNA'sı, cDNA yapmak için ekstre edilebilir ve saflaştırılabilir. Enzim; ters transkriptaz, bu saflaştırılmış ökaryotik mRNA'dan cDNA sentezini katalize eder. MRNA'dan cDNA oluşturulduktan sonra cDNA kütüphaneleri yapmak için bir bakteri hücresine klonlanabilir veya heterolog ekspresyon çalışmalarını gerçekleştirmek için kullanılabilir.
Resim 02: cDNA
Genellikle, cDNA, prokaryotlarda ökaryotik genlerin klonlanmasında büyük bir değere sahiptir. Prokaryotlar intron içermediğinden, intronları ökaryotik DNA'dan çıkaramaz ve fonksiyonel mRNA yapamazlar. Bu nedenle, tüm ökaryotik genleri prokaryotlara klonlamadan önce, intronları çıkarmak ve mRNA'dan cDNA yapmak ve prokaryotlara klonlamak gerekir..
DNA, nükleik asidin doğal bir formudur, cDNA ise yapay olarak oluşturulmuş bir nükleik asit formudur. Bu nedenle, bu DNA ve cDNA arasındaki bir farktır. Dahası, DNA birçok canlı organizmanın genomunu temsil eder. Kodlayıcı ve kodlayıcı olmayan dizileri oluşturur. Bununla birlikte, mRNA yapılırken, proteinlerin oluşumu için önemli olmadıkları için tüm intron sekansları eksize edilir. Bu nedenle, mRNA dizileri intron içermez. Bu mRNA dizileri, cDNA'yı sentezlerken şablonlar olarak işlev görür. Bu nedenle, cDNA intron içermez. Buna göre, DNA intron içerir, ancak cDNA intron içermez. Bunu DNA ve cDNA arasındaki temel fark olarak söyleyebiliriz.
Ayrıca, cDNA sadece eksonlar içerdiğinden, cDNA'lar DNA'dan çok daha kısadır. DNA, binlerce baz çiftini kapsayan bazı intronlar içerir. Bu DNA ve cDNA arasındaki farktır. Ayrıca, DNA doğal olarak çift sarmallı sarmal olarak meydana gelirken, cDNA tek sarmallı sıralar halinde ortaya çıkar. DNA polimeraz, DNA sentezini veya replikasyonunu katalize eden enzimken, ters transkriptaz laboratuarda cDNA sentezini katalize eden enzimdir.
DNA ve cDNA arasındaki farkla ilgili aşağıdaki infografik, bu farklar hakkında daha fazla ayrıntı sağlar.
DNA, genomumuzu yapan önemli bir polimerdir. Öte yandan cDNA, cDNA kütüphaneleri yapmak ve zor ifade edilen proteinler üretmek için önemli olan başka bir DNA formudur. mRNA, cDNA yapmak için kullanılır. Bu nedenle, cDNA intron içermez. Ancak DNA intron içerir. Bu nedenle, DNA ve cDNA arasındaki temel farktır. CDNA, cDNA kitaplıklarının oluşturulması için DNA, genomik DNA kitaplıklarının oluşturulması için yararlıdır. CDNA intron içermediğinden, cDNA DNA'dan daha kısadır. En önemlisi, DNA çift sarmallı iken cDNA tek sarmallıdır. Bu DNA ve cDNA arasındaki farkı özetler.
1. “Tamamlayıcı DNA.” Vikipedi, Wikimedia Vakfı, 7 Aralık 2018. Buradan erişebilirsiniz
2. “DNA Nedir? - Genetik Ev Referansı - NIH. ” ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi, Ulusal Sağlık Enstitüleri. Burada mevcut
1. ”Eukaryote DNA-tr” Magnus Manske, Dietzel65, LadyofHats, Radio89 (CC BY-SA 3.0) Commons Wikimedia üzerinden
2. Commons Wikimedia üzerinden PhD Dre (CC BY-SA 3.0) tarafından “cDNA Kütüphanesinin Oluşumu”