DNA Ligaz ve DNA Polimeraz Arasındaki Fark
Share
Anahtar Fark - DNA Ligaz ve DNA Polimeraz
DNA ligazı ve DNA polimeraz, organizmaların DNA replikasyonu ve DNA onarım mekanizmalarında yer alan önemli enzimlerdir. DNA ligazı, nükleotitler arasında fosfodiester bağlarının oluşumunu katalize ederek DNA fragmanlarının birleştirilmesinden sorumludur. DNA polimeraz, şablon DNA kullanarak yapı taşlarından (nükleotitler) DNA'nın sentezinden sorumludur. Bu DNA ligazı ve DNA polimeraz arasındaki temel farktır.
İÇİNDEKİLER
1. Genel Bakış ve Temel Fark
2. DNA Ligaz nedir
3. DNA Polimeraz nedir
4. Yan Yana Karşılaştırma - DNA Ligaz vs DNA Polimeraz
5. Özet
DNA Ligaz nedir?
DNA ligazı, 3 '- OH ve 5'-PO arasında fosfodiester bağı oluşumunu katalize eden bir enzimdir4 nükleotit grupları ve DNA fragmanlarının birleştirilmesini kolaylaştırır. Moleküler dikiş olarak da bilinir. Bu yetenek DNA boşluklarının veya çentiklerinin doldurulmasını ve DNA replikasyonu sırasında oluşan Okazaki parçalarının birleştirilmesini sağlar. DNA ligazları, rekombinant DNA moleküllerinin üretimi için rekombinant DNA teknolojisinde oldukça faydalıdır. DNA ligazı ilgili DNA'yı vektör DNA ile birleştirir. Bu nedenle organizmalar için önemli bir enzimdir.
DNA ligaz enzimi bir kofaktör ve Mg2'ye bağlıdır+ işlevi için iyonlar. DNA ligazlarına yardımcı olan iki kofaktör vardır. NAD+ ATP sıklıkla bir kofaktör virüsü ve ökaryotik DNA ligazları gibi davranırken bakteriyel DNA ligazları için bir kofaktör görevi görür. Ökaryotik DNA ligaz etkisi üç ana adımla tamamlanır.
Adım 01. DNA ligazı ATP molekülüne saldırır ve pirofosfat (iki fosfat grubu) ve AMP'yi serbest bırakır ve sonuçtaki AMP ile kovalent olarak bağlanarak ligaz-adenilat ara maddesi oluşturur.
Adım 02: Oluşturulan enzim AMP ara maddesi AMP'yi nikelin 5 'fosfata aktarır ve DNA oluşturur - adenilat (DNA ipliğinin 5'-fosfat oksijeni, ligaz-adenilat ara maddesinin fosforuna saldırır).
Adım 03: DNA ligazı, polinükleotidlere katılmak için nickin 3'-OH'sinin DNA-adenilat üzerine saldırısını katalize eder ve AMP'yi serbest bırakır.
DNA ligazları genellikle T4 bakteriyofajdan izole edilir ve rekombinant DNA teknolojisinde yaygın olarak kullanılır.
Şekil 01: Nick onarımında DNA ligazı
DNA Polimeraz nedir?
DNA polimeraz, DNA sentezi ve genom replikasyonunda yer alan tüm organizmalarda bulunan her yerde bulunan bir enzimdir. Genetik bilgi DNA polimerazlarının yardımıyla ebeveynlerden yavrulara geçer. Mevcut DNA için tamamlayıcı yeni DNA sentezini katalize eder. DNA polimeraz, primer sekansının 3 'OH grubuna nükleotitler (nükleik asitlerin yapı taşları) ekler ve iplikçik oluşumunu 5' yönünde sürdürür. DNA polimerazlann çoğunun prova okuma için 5 'ila 3' polimeraz aktivitesi ve 3 'ila 5' ekzonükleaz aktivitesi vardır.
Prokaryotik DNA polimerazlar beş ana grup altında tarif edilmektedir. Ökaryotlar en az 16 farklı DNA polimerazı içerir. Tüm bu DNA polimerazlar A, B, C, D, X, Y ve RT (Ters transkriptaz) olarak yedi aileye ayrılmıştır..
Şekil 02: DNA polimerazla çalışan DNA replikasyonu
DNA Ligaz ve DNA Polimeraz arasındaki fark nedir?
DNA Ligaz ve DNA Polimeraz | |
| DNA ligazı, nükleotitler arasında fosfodiester bağlarının oluşumunu katalize eden ve DNA fragmanlarını birbirine bağlayan bir enzimdir. | DNA polimeraz, nükleotidler kullanarak DNA sentezini katalize eden bir enzimdir. |
| DNA Çoğaltmadaki Rolü | |
| DNA ligazı, DNA replikasyonunda Okazaki fragmanlarına katılan ek bir enzimdir. | DNA polimeraz, DNA replikasyonunda ana enzimdir. |
| Gereksinimler | |
| Mg'e bağlıdır2+ iyonları ve ATP / NAD+ kofaktörler | Bir şablona, nükleotitlere, primerlere ve Mg'ye bağlıdır.2+. |
| Fonksiyonlar | |
| DNA ligazı DNA rekombinasyonu, DNA onarımı ve DNA replikasyonu için önemlidir. | DNA polimeraz, DNA replikasyonu, DNA onarımı ve DNA rekombinasyon teknolojisi için önemlidir. |
Özet - DNA Ligaz vs DNA Polimeraz
DNA ligazı, DNA fragmanlarının fosfodiester bağlarıyla birleştirilmesi için gerekli olan önemli bir enzimdir. DNA polimeraz, yeni DNA sentezi için önemli olan ana enzimdir. DNA ligazı ve DNA polimeraz arasındaki temel fark onların işlevidir. Bununla birlikte, her iki enzim DNA onarımı, DNA replikasyonu ve rekombinant DNA teknolojisi için gereklidir.
Referans:
Rossi, R., A. Montecucco, G. Ciarrocchi ve G. Biamonti. “T4 DNA ligazının fonksiyonel karakterizasyonu: etki mekanizmasına yeni bir bakış.” Nükleik Asit Araştırmaları. ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi, 01 Haziran 1997. Web. 11 Mart 2017
Martin, Ina V. ve Stuart A. MacNeill. “ATP'ye bağımlı DNA ligazları.” Genom Biyolojisi. BioMed Central, 2002. Web. 11 Mart 2017
Garcia-Diaz, Miguel ve Katarzyna Bebenek. “DNA polimerazların çoklu fonksiyonları.” Bitki bilimlerinde eleştirel incelemeler. ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi, Mart 2007. Web. 11 Mart 2017
Görünüm inceliği:
1. “Ligase nick onarım mekanizması” Jrmcnall tarafından - Commons Wikimedia üzerinden ChemDraw (CC BY-SA 3.0)
2. “Phage T7 replikasyon makineleri” Danykl tarafından - Commons Wikimedia üzerinden kendi çalışması (CC BY-SA 4.0)
