Ekzom ve Transkriptom Arasındaki Fark

Anahtar Fark - Exome vs Transcriptome
 

Bir gen, içinde kodlayıcı ve kodlayıcı olmayan bölgeler içerir. Kodlama dizileri eksonlar olarak bilinir ve kodlamayan diziler intronlar olarak bilinir. Bir genin eksonlarının nükleotit sekansı, spesifik proteini sentezlemek için genin genetik kodunu temsil eder. Dolayısıyla eksonlar mRNA molekülünde kalır. Genomun toplam ekson bölgesi, ekzom olarak bilinir ve genomun önemli bir parçasıdır. Genlerin genetik kodu, protein üretimi için gerekli olan mRNA molekülünün genetik koduna dönüştürülür. Bir seferde bir hücreye veya hücre popülasyonuna kopyalanan mRNA moleküllerinin tamamı, transkriptom olarak bilinir. Ekzom ve transkriptom arasındaki en önemli fark ekzom genomun ekson bölgelerinin dizilerini temsil eder süre transkriptom, belirli bir zamanda bir hücrenin veya dokunun toplam mRNA'sını temsil eder.

İÇİNDEKİLER
1. Genel Bakış ve Temel Fark
2. Exome nedir
3. Transkriptom nedir
4. Yan Yana Karşılaştırma - Exome vs Transcriptome
5. Özet

Exome nedir?

Genler eksonlar, intronlar ve düzenleyici sekanslardan oluşur. Eksonlar, transkripsiyon sırasında mRNA sekansına transkripte edilen gen bölgeleridir. İntronlar ve diğer kodlamayan bölgeler transkripsiyon sırasında çıkarılır. Eksonların nükleotit sekansı, kodladığı spesifik proteini sentezleyen genin genetik kodunu belirler. Bir proteinin mRNA'sında sadece eksonlar kalır. Genomdaki eksonların toplanması bir organizmanın eksozu olarak bilinir. Genomun gen olarak ifade edilen bir kısmını temsil eder. İnsanlarda, egzom genomdan% 1 oranında oluşur. İnsan genomunun protein kodlayan kısmıdır.

Resim 01: Egome

Transkriptom nedir?

Transkriptom, belirli bir dokudaki tüm protein kodlayan ve kodlamayan transkriptlerin (RNA) toplanmasıdır. Transkriptom, bir hücre veya dokudaki genler tarafından eksprese edilen toplam mRNA moleküllerinin toplanmasını temsil eder. Bir hücrenin transkriptomu, başka bir hücre tipinin transkriptomu ile değiştirilebilir. Transkriptom da dinamiktir - hem iç hem de dış uyaranlara yanıt olarak zamanla değişir. Aynı doku içinde veya aynı hücre tipi içinde bile, transkriptom birkaç dakika sonra değişebilir.

Transkriptom, bir organizmanın ekzodan farklıdır. Transkriptom sadece eksprese edilen ekzom sekanslarını içerir. Bir hücrenin ekzomu aynı kalmasına rağmen, gen ekspresyonu tüm hücreler veya dokular için aynı olmadığından transkriptom hücreler arasında farklılık gösterir. Farklı hücreler ve dokularda sadece esansiyel genler eksprese edilir. Gen ekspresyonu doku veya hücre tipine özgü bir işlemdir. Çevresel faktörler de dahil olmak üzere çeşitli faktörler tarafından düzenlenir. Bu nedenle, transkriptom dış çevre koşullarına göre değişebilir.

Transkriptom proteomik çalışmalar için bir öncü olarak kullanılır. Tüm proteinler mRNA dizilerinden türetilir. Çeviri değişiklikleri proteinlerde değişikliklere neden olabilir. Bununla birlikte transkriptom, proteomik çalışmalar için önemli temel bilgiler sağlar.

Resim 02: Embriyonik kök hücrelerin transkriptomu

Exome ve Transcriptome arasındaki fark nedir?

Exome ve Transkriptom
Exome, genlerin protein kodlama bölgesinin toplanmasıdır.	Transkriptom, mRNA dahil tüm kopyalanmış RNA'nın toplanmasıdır.
Örneklem
Eksome DNA örneği kullanılarak incelenir.	Transkriptom bir RNA örneği kullanılarak incelenir.
Çalışma Yöntemi
Tüm ekzom dizilemesi ekzom çalışma yöntemidir.	RNA dizilemesi, transkriptomu inceleme yöntemidir.

Özet - Exome vs Transcriptome

Eksonlar, genlerin kodlayıcı dizileridir ve proteinlerin mRNA dizilerini belirler. Bu kodlama dizilerinin (eksonlar) toplanması, bir organizmanın ekzoması olarak bilinir. Genler, proteinler üretilmeden önce mRNA moleküllerine kopyalanır. Herhangi bir zamanda bir hücrenin veya dokunun toplam mRNA molekülleri transkriptom olarak bilinir. Transkriptom, herhangi bir zamanda aktif olarak mRNA'ya eksprese edilen genleri temsil eder. Transkriptom hücre ve dokuya özgüdür ve çevresel koşulları etkiler. Bu exome ve transkriptom arasındaki farktır.

Referanslar:
1.Sarah ve ark., “On İki İnsan Egomunun Hedefli Yakalanması ve Devasa Paralel Sıralaması.” Doğa. ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi, 10 Eylül 2009. Web. 01 Nisan 2017
2.Mutz ve diğ. “Yeni nesil sekanslama kullanarak transkriptom analizi.” Elsevier: Makale Bulucu. N.p., Eylül 2012. Web. 01 Nisan 2017

Görünüm inceliği:
1. ”Pluripotent hücrelerin transkriptomu” Grskovic, M. ve Ramalho-Santos, M., Pluripotent transkriptom (10 Ekim 2008), StemBook, ed. Kök Hücre Araştırma Topluluğu, StemBook, doi / 10.3824 / stembook.1.24.1, http://www.stembook.org. - [1] DirectStemBook Şekil 2 Pluripotent hücrelerin transkriptomu.Grskovic, M. ve Ramalho-Santos, M., Pluripotent transkriptom (10 Ekim 2008), StemBook, ed. Kök Hücre Araştırma Topluluğu, StemBook, doi / 10.3824 / stembook.1.24.1, (CC BY 3.0) Commons Wikimedia üzerinden