temel fark ferredoxin ve Rubredoxin arasında ferredoxin, Rubredoxin'e kıyasla çok daha düşük bir redoks potansiyeline sahiptir.
Hem ferredoxin hem de Rubredoxin demir içeren proteinlerdir. Bununla birlikte, ferredoksini bakteriyel formlarda ve bitkilerde bulabiliriz, çünkü bir kloroplast proteinidir. Bununla birlikte, Rubredoxin sadece bakteri ve arkada oluşan bir proteindir. Bu iki bileşik birbirine çok benzer bir yapıya sahiptir.
1. Genel Bakış ve Temel Fark
2. Ferredoxin nedir
3. Rubredoxin nedir
4. Yan Yana Karşılaştırma - Tablo Şeklinde Ferredoxin vs Rubredoxin
5. Özet
Ferredoxin demir-kükürt içeren bir proteindir. Çeşitli metabolik reaksiyonlarda elektron transferine aracılık etmede rol oynar. Bunlar suda çözünür küçük proteinlerdir ve kloroplastlarda bulunurlar. Bu proteindeki demir ve sülfür atomları demir-sülfür kümelerinde düzenlenmiştir. Elektronları kabul ederek ve deşarj ederek biyolojik kapasitörler olarak görev yapabilirler. Burada demir atomlarının oksidasyon durumu +2'den +3'ye değişir. Bu nedenle, biyolojik bir ortamda meydana gelen redoks reaksiyonlarında elektron transfer edici ajan olarak işlev görürler. Nispeten, bu proteinin redoks potansiyeli düşüktür. Bir ferredoksin protein molekülü, protein molekülü başına iki, üç veya dört demir atomu içerebilir. Üç yaygın ferredoxin türü vardır: Fe2S2 ferredoksinler, Fe4S4 ferredoksinler ve Fe3S4 ferredoxins.
Ferredoksinin ana rolü, kloroplastta yüksek enerjili elektronlar tahsis etmektir ve bu proteinler, karbondioksit fiksasyonu, nitril indirgeme, sülfit indirgeme, glutamat sentezi, siklik elektron akışı vb. İçin gerekli elektronların dağıtılmasında rol oynar..
Rubredoxin, bakteri ve arkada bulunabilen demir içeren bir proteindir. Düşük moleküler ağırlıklı bir protein türüdür (genellikle proteinler yüksek moleküler ağırlıklı bileşiklerdir). Bununla birlikte, ferredoksinin aksine, Rubredoxin proteini inorganik sülfitler içermez. Rubredoxin'in en önemli rolü, biyolojik sistemlerde meydana gelen redoks reaksiyonlarında elektron transfer mekanizmalarına katılmasıdır..
Rubredoxin yapısı göz önüne alındığında, neredeyse tetrahedral geometriye sahip merkezi bir demir atomu içerir. Bu demir atomuna bağlı dört grup sistein kalıntılarıdır. Rubredoxin proteinlerinin çoğu suda çözünür kimyasal türlerdir. Bununla birlikte, membrana bağlı proteinler olarak var olan bazı çözünmeyen türler vardır. Örneğin. Rubredoxin-A.
Elektron transfer mekanizması sırasında, merkezi demir atomunun oksidasyon durumu +2'den +3'ye değişir. Oksidasyon durumundaki bu değişikliği kolayca tanıyabiliriz çünkü renk kırmızıdan renksiz hale gelir. Bu değişim sırasında, metal iyonu yüksek dönüş durumunda kalır, çünkü proteinin yapısal değişikliklerini en aza indirmeye yardımcı olur. Tipik olarak, Rubredoxin'in azaltma potansiyeli ferredoksinden daha yüksektir; +50 mV ila -50 mV aralığındadır.
Ferredoxin ve Rubredoxin, bileşen olarak hem demir hem de kükürt içeren protein bileşikleridir. Ferredoxin ve Rubredoxin arasındaki temel fark, ferredoxin'in Rubredoxin'e kıyasla önemli ölçüde daha düşük redoks potansiyeline sahip olmasıdır. Ferredoksinin redoks potansiyeli yaklaşık -420 mV'dir ve Rubredoxin'in redoks potansiyeli -50 ila +50 mV arasındadır. Ayrıca, ferredoxin protein molekülü başına iki, üç veya dört demir atomu içerebilir, ancak Rubredoxin'de bir merkezi demir atomu vardır. Bununla birlikte, bu moleküllerin her ikisi de demir atomlarının çevresinde benzer bir dört yüzlü geometriye sahiptir..
Ayrıca ferredoksin, protein molekülünde bir bileşen olarak inorganik sülfür içerir, ancak Rubredoxin'de inorganik sülfür yoktur. Oluşumu göz önüne alırken, ferredoxin hem bakteriyel formlarda hem de bitkilerde ortaya çıkabilir, ancak Rubredoxin bakteri ve arkalarda ortaya çıkar.
Aşağıdaki tablo ferredoxin ve Rubredoxin arasındaki farkı özetler.
Ferredoxin ve Rubredoxin, bileşen olarak hem demir hem de kükürt içeren protein bileşikleridir. Ferredoxin ve Rubredoxin arasındaki temel fark, ferredoxinin Rubredoxin'e kıyasla çok daha düşük bir redoks potansiyeline sahip olmasıdır..
1. Chipperfield, J.r. “DEMİR | Özellikler ve Kararlılık. ” Gıda Bilimleri ve Beslenme Ansiklopedisi, 2003, s. 3367-3373., Doi: 10.1016 / b0-12-227055-x / 00650-7.
1. “3P1M.pdb1” Jmol Geliştirme ekibi - Jmol (CC0) Commons Wikimedia üzerinden
2. “PDB 1s24 EBI” Avrupa Biyoinformatik Enstitüsü - (Kamusal Alan) Comwa Wikimedia üzerinden Jawahar Swaminathan ve MSD personeli tarafından