FISH ve CGH Arasındaki Fark

temel fark FISH ve CGH arasında FISH floresan etiketli problar kullanarak bir kromozom üzerindeki spesifik DNA dizisini tespit eden moleküler bir tekniktir, CGH ise genomik DNA'daki değişiklikleri tespit eden başka bir moleküler sitogenetik tekniktir.

Sitogenetik analiz, anöploidiler, delesyonlar, kopyalar ve yeniden düzenlemeler vb.Gibi kromozomal anormallikleri tespit ederken tıpta önemli bir rol oynar. Yukarıda belirtilen kusurları ve hastalıkları tespit etmek için çeşitli moleküler sitogenetik yöntemler vardır. Bunlar arasında, FISH (floresan yerinde hibridizasyon) ve CGH (karşılaştırmalı genomik hibridizasyon) iki güçlü hibridizasyon tekniğidir. Ancak, her iki yöntemin de artıları ve eksileri vardır.

İÇİNDEKİLER

1. Genel Bakış ve Temel Fark
2. BALIK nedir 
3. CGH nedir
4. BALIK ve CGH Arasındaki Benzerlikler
5. Yan Yana Karşılaştırma - Tablo şeklinde Formda FISH vs CGH
6. Özet

BALIK nedir?

FISH, tüm doku veya hücrelerde, dokunun bir kısmı veya bölümü üzerinde gerçekleştirilen bir nükleik asit hibridizasyon tekniğidir. Prob tabanlı bir yöntemdir. Teknik, Watson Crick tamamlayıcı baz eşleştirme teorisine bağlıdır, bu da mutasyona uğramış genleri tespit edebilen veya ilgili geni tanımlayabilen DNA - DNA hibritleri veya DNA - RNA hibritleri ile sonuçlanır. Ayrıca, bu teknik, ilgilenilen gen sekanslarını tamamlayıcı problar olarak nick translasyonu kullanılarak hazırlanan tek zincirli DNA dizilerini, çift zincirli DNA dizilerini, tek zincirli RNA dizilerini veya sentetik oligonükleotidi kullanır. Ayrıca, bu tekniğin en önemli özelliği probların floresan boyalarla etiketlenmesidir. Böylece, problar kromozomun tamamlayıcı kısımlarına bağlanır ve tespit edilmesini kolaylaştırır.

Dahası, FISH son derece hassas ve spesifik bir yöntemdir. Bu nedenle, hematolojik malignitelerin ve katı tümörlerin hem araştırılmasında hem de tanısında yaygın bir tekniktir. Ancak, FISH düşük çözünürlük gösterir. Ayrıca prob dizilerini tasarlamak için hedef anormallik hakkında önceden bilgi gerektirir.

Resim 01: BALIK

FISH'in, çoğunlukla bulaşıcı hastalıkların moleküler teşhisinde, patojenlerin varlığını tanımlamak ve patojeni moleküler teşhis yoluyla doğrulamak için birçok uygulaması vardır. Ayrıca FISH, gelişim biyolojisi, karyotipleme ve filogenetik analiz ve kromozomların fiziksel haritalanması alanlarında yaygın olarak kullanılan bir tekniktir..

CGH nedir?

Karşılaştırmalı genomik hibridizasyon (CGH), genomik DNA dizilerinin değişikliklerini tespit edebilen başka bir DNA bazlı moleküler sitogenetik tekniktir. Yöntem, genomik DNA dizilerindeki değişiklikleri veya değişiklikleri tespit etmek için kromozom ve gen modifikasyonlarını analiz edebilen gelişmiş bir yöntemdir. Ayrıca CGH, deney numunesinden ve referans numuneden DNA'nın izolasyonunu ve parçalanmasını gerektirir. Daha sonra, numuneler iki farklı floresan boya (genellikle kırmızı ve yeşil) kullanılarak etiketlenmelidir. Daha sonra her iki numune karıştırılır ve rekabetçi hibridizasyona izin verilir. Son adım, gen replikasyonu, gen kaybı vb. Gibi DNA'daki değişiklikler için numunelerin analizidir. Özellikle, test numunesi ve kontrol numunesi arasındaki DNA kopya sayısı farklılıklarını ölçer..

Resim 02: CGH

CGH'nin başka bir sürümü şimdi mevcut; normal CGH'den daha gelişmiş bir yöntemdir. Dizi tabanlı CGH veya aCGH adı verilen bir tekniktir. aCGH, tek bir deneyde binlerce sekanstaki gen veya sekans silme işlemlerinin kesin olarak tanımlanmasını sağlar.

FISH ve CGH Arasındaki Benzerlikler Nelerdir??

• FISH ve CGH iki moleküler tekniktir.
• Hem FISH hem de CGH, nükleik asit hibridizasyonuna güveniyor.
• Ayrıca, her iki teknik de spesifik DNA hedeflerini tespit etmek için tasarlanmış problara ihtiyaç duyar.
• Onları genetik hastalıkların doğum öncesi ve doğum sonrası tanısı için kullanıyoruz.
• Ayrıca, hem FISH hem de CGH genomik değişiklikleri incelemek için çok güçlü araçlardır.
• Probları etiketlemek için floresan boyalar kullanırlar.

FISH ve CGH Arasındaki Fark Nedir??

BALIK bir yerinde CGH, genomik DNA dizilerinin değişikliklerini tespit eden moleküler bir hibridizasyon tekniğidir; Yani, bu FISH ve CGH arasındaki temel fark.

Dahası, FISH, prob sekanslarını tasarlamak için hedef anormallik hakkında önceden bilgi gerektirirken CGH, önceden bilgi gerektirmez. Ayrıca, FISH ve CGH arasındaki bir başka fark, FISH'in yüksek çözünürlük göstermesi, FISH'in ise yüksek çözünürlük göstermesidir..

Aşağıdaki Infographic FISH ve CGH arasındaki farkı özetler.

Özet - FISH vs CGH

FISH ve CGH, ilgilenilen gen dizilerinin saptanmasını kolaylaştıran iki moleküler sitogenetik tekniktir. FISH, floresan etiketli problar kullanarak bir kromozom üzerindeki spesifik DNA sekansının saptanmasını kolaylaştırırken CGH, genomik DNA'daki değişikliklerin saptanmasını kolaylaştırır. Yani, bu FISH ve CGH arasındaki temel fark.

Referans:

1. “Situ Hibridizasyonunda Floresan (FISH)” Nature News, Nature Publishing Group, Buradan ulaşabilirsiniz.
2. Hester, Susan D, vd. “Mikroarray Platformlarında Karşılaştırmalı Genomik Hibridizasyon Teknolojilerinin Karşılaştırılması.” Biyomoleküler Teknikler Dergisi: JBT, Biyomoleküler Kaynak Tesisleri Birliği, Nisan 2009, Buradan ulaşabilirsiniz.

Görünüm inceliği:

1. “Jurkat ve HeLa hücrelerinde Multipleks ViewRNA FISH Testi” Ryan Jeffs tarafından - Commons Wikimedia üzerinden kendi çalışması (CC BY-SA 3.0)
2. “CGH şeması” By Mbaudis (tartışma) (Yüklemeler) - Commons Wikimedia üzerinden kendi çalışması (CC BY 2.5)