Jel Elektroforezi ve SDS Sayfası Arasındaki Fark

Temel Fark - Jel Elektroforezi ve SDS Sayfası
 

Jel elektroforezi, bir elektrik alanında makromolekülleri ayıran bir tekniktir. Moleküler biyolojide DNA, RNA ve proteinleri moleküler boyutlarına göre karışımlardan ayırmak yaygın bir yöntemdir. SDS Sayfası, proteinleri boyutlarına göre bir protein karışımından ayırmak için kullanılan bir tür jel elektroforezidir. Jel elektroforezi, DNA, RNA ve protein ayrımı için uygulanan normal tekniğe atıfta bulunmak için kullanılan bir terimdir. süre SDS Sayfası bir tür jel elektroforezidir. Bu jel elektroforezi ve SDS arasındaki temel farktır..

İÇİNDEKİLER
1. Genel Bakış ve Temel Fark
2. Jel Elektroforezi Nedir
3. SDS Sayfası nedir
4. Yan Yana Karşılaştırma - Jel Elektroforezi ve SDS Sayfası
5. Özet

Jel Elektroforezi Nedir?

Jel elektroforezi, DNA, RNA, proteinler vb. Yüklü molekülleri karışımlarından ayırmak için laboratuvarlarda kullanılan yaygın bir tekniktir. Jel elektroforezinde bir jel kullanılır. Moleküler elek görevi görür. Jel elektroforezinde agaroz ve poliakrilamid olarak kullanılan iki tip jel vardır. Bir jel ve jel preparatının seçimi, jel elektroforezlerinde dikkate alınması gereken önemli faktörlerdir, çünkü jelin gözenek boyutu, moleküllerin jel elektroforezi yoluyla iyi bir şekilde ayrılması için dikkatlice manipüle edilmelidir. Jel elektroforezi, jelin iki ucuna bağlı bir elektrik alanına sahiptir. Jelin bir ucu pozitif bir yük gösterirken diğer ucu negatif yüklü.

DNA ve RNA negatif yüklü moleküllerdir. Jelin negatif ucundan jele yüklendikten ve elektrik alanına uygulandıktan sonra jel gözeneklerinden jelin pozitif yüklü ucuna doğru göç ederler. Göçün hızı, molekülün yüküne ve büyüklüğüne bağlıdır. Daha küçük moleküller jel gözeneklerinden daha büyük moleküllere göre kolayca göç eder. Bu nedenle, daha küçük moleküller jel boyunca uzun bir mesafe katlanırlar ve daha büyük moleküller kısa bir mesafe kat ederler. Moleküllerin jel üzerinde hareketini gözlemlemek için özel tip boyalar kullanılır. Elektrik alanı belirli bir süre uygulanır ve moleküllerin kaybını önlemek ve molekülleri hareket ettikleri pozisyonda tutmak için durdurulur. Jelde farklı bantlar görülebilir. Bu bantlar farklı boyutlardaki molekülleri temsil eder. Bu nedenle, jel elektroforezi molekülleri boyutlarına göre ayırt etmek için yararlıdır.

Jel elektroforezi, PCR, RFLP, klonlama, DNA dizileme, güney lekeleme, genom haritalama vb.Gibi Moleküler biyolojide hazırlayıcı bir teknik olarak çeşitli tekniklere dahil edilir..

Resim 01: Agaroz jel elektroforezi

SDS Sayfası nedir?

Sodyum dodesil sülfat poliakrilamid jel elektroforezi (SDS Sayfası) proteinleri ayırmak için kullanılan bir tür jel elektroforezidir. Proteinleri ayırmak için jel elektroforezi kullanıldığında, proteinler DNA ve RNA gibi negatif yüklü olmadıkları ve pozitif veya negatif sona doğru göç etmedikleri için özel tedavilere ihtiyaç vardır. Bu nedenle, proteinler denatüre edilir ve jel elektroforezinden önce negatif bir yük ile kaplanır. Sodyum dodesil sülfat (SDS) adı verilen bir deterjan kullanılarak yapılır. SDS ve destekleyici ortam için bir poliakrilamid jel kullanan jel elektroforezi SDS olarak bilinir. Bu teknik biyokimya, genetik, adli tıp ve moleküler biyolojide yaygın olarak kullanılmaktadır..

SDS Sayfası sırasında proteinler SDS ile karıştırılır. SDS proteinleri doğrusal bir şekle sokar ve moleküler kütleleriyle orantılı negatif bir yük ile kaplar. Negatif yük nedeniyle, protein molekülleri jelin pozitif yük ucuna doğru göç eder ve moleküler kütlelerine göre ayrılır. SDS Sayfasında, poliakrilamid jel için katı destek olarak kullanılır. Proteinlerin gerçek ayrılması esas olarak jelin özelliklerine bağlıdır. Bu nedenle poliakrilamid jel hazırlığı dikkatle yapılmalı ve poliakrilamid konsantrasyonları doğru kullanılmalıdır. Poliakrilamid jeller, agaroz jellerinden daha yüksek çözünürlük gösterir. Bu nedenle, SDS Sayfa protein ayırma için yüksek çözünürlüklü bir teknik olarak kabul edilir.

SDS Sayfası bir tür denatüre edici jel elektroforezidir. Protein analizinde büyük bir sınırlama vardır. SDS proteinleri ayrılmadan önce denatüre ettiğinden, enzimatik aktivitenin, protein bağlayıcı etkileşimlerin, protein kofaktörlerinin, vb. Saptanmasına izin vermez..

Şekil 02: SDS sayfası

Jel Elektroforezi ve SDS arasındaki fark nedir?

Jel Elektroforezi ve SDS Sayfası
Jel elektroforezi, bir elektrik alanı kullanarak makromolekülleri ayırmak için yapılan bir yöntemdir.	SDS Page, proteinleri kütlelerine göre ayırmak için kullanılan yüksek çözünürlüklü jel elektroforez tekniğidir.
Jel Koşusu
Yatay veya dikey olarak yapılabilir.	SDS Sayfası her zaman dikey çalışır.
Ayrılma Esası
Ayırma, yüke ve boyuta göre gerçekleşir.	Protein ayrılması kütle ve yüke göre gerçekleşir.
çözüm
Agaroz jel elektroforezi düşük çözünürlüğe ve poliakrilamid jel elektroforezi daha yüksek çözünürlüğe sahiptir	SDS Sayfası daha iyi bir çözünürlüğe sahiptir.
Denatürasyon
Jel elektroforezi hem denatüre edici hem de denatüre edici olmayan teknikleri içerir.	SDS Sayfası ayrılmadan önce proteinleri denatüre eder.

Özet - Jel Elektroforezi ve SDS Sayfası

Jel elektroforezi DNA, RNA ve proteinlerin boyutlarına ve yüklerine göre ayrılması ve analizi için kullanılan yaygın bir tekniktir. Agaroz jel elektroforezi ve poliakrilamid jel elektroforezi olmak üzere iki ana jel elektroforezi vardır. Agaroz jelleri esas olarak nükleik asit ayrımı için kullanılır; daha yüksek çözünürlük gerektiğinde poliakrilamid jeller kullanılır. SDS Sayfası, proteinlerin karmaşık karışımlarını ayırmak için yaygın olarak kullanılan bir jel elektroforez türüdür. Yüksek çözünürlüklü bir protein ayırma tekniği olarak kabul edilir. Bu jel elektroforezi ve SDS arasındaki farktır..

Referanslar:
1. Nowakowski, Andrew B., William J. Wobig ve David H. Petering. “Doğal SDS-PAGE: Bağlı Metal İyonları Dahil Doğal Özelliklerin Korunmasıyla Proteinlerin Yüksek Çözünürlüklü Elektroforetik Ayrılması. www.ncbi.nlm.nih.gov. N.p., Mayıs 2014. Web. 7 Nisan 2017
2. Stellwagen, Nancy C. “Agaroz jellerde, poliakrilamid jellerde ve serbest çözelti içinde DNA'nın elektroforezi.” Elektroforez. ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi, Haziran 2009. Web. 07 Nisan 2017

Görünüm inceliği:
1. Commons Wikimedia üzerinden “Gelelektroforez uygulaması” (CC BY-SA 3.0)
2. Ann Arbor'dan Doğal Kaynaklar Okulu'ndan “DNA Agarose jel elektroforezi” - Commons Wikimedia üzerinden DNA laboratuvarı (CC BY 2.0)