Prokaryotlarda Gen Ekspresyonu ve Ökaryotlar
Gen ekspresyonu hem prokaryotlarda hem de ökaryotlarda yer alan önemli bir süreçtir. Hem ökaryotlarda hem de prokaryotlarda sonuçların aynı olmasına rağmen, aralarında önemli farklılıklar vardır. Gen ekspresyonu genel olarak tartışılır ve prokaryotik ve ökaryotik süreçler arasındaki farklar özellikle bu makalede vurgulanır.
Gen İfadesi
Bir genin bilgisi yapısal biçimlere dönüştürüldüğünde, belirli genin ifade edildiği söylenir. Gen ekspresyonu biyolojik olarak önemli moleküller yapan bir işlemdir ve bunlar genellikle makromoleküllerdir. Genler çoğunlukla proteinler şeklinde ifade edilir, ancak RNA aynı zamanda bu sürecin bir ürünüdür. Gen ekspresyonu süreci gerçekleşmeden yaşam formu olamaz.
Transkripsiyon, RNA işleme ve translasyon olarak bilinen gen ekspresyonunda üç ana adım vardır. Çeviri sonrası protein modifikasyonu ve kodlamayan RNA olgunlaşması, gen ekspresyonu ile ilgili diğer işlemlerden bazılarıdır. Transkripsiyon aşamasında, DNA ipliği içindeki genin nükleotit dizisi, DNA ipliği DNA helisaz enzimi ile parçalandıktan sonra RNA'ya kopyalanır. Yeni oluşturulan RNA ipliği (mRNA), kodlayıcı olmayan dizilerin çıkarılması ve genin nükleotit dizisinin ribozomlara alınmasıyla yeniden düzenlenir. Sitoplazmada ilgili amino asitleri tanıyan spesifik tRNA (transfer RNA) molekülleri vardır. Bundan sonra, tRNA molekülleri spesifik amino asitlere bağlanır. Her tRNA molekülünde, üç nükleotit dizisi vardır. MRNA dizisine sitoplazmada bir ribozom eklenir ve başlangıç kodonu (promotör) tanımlanır. MRNA dizisi için karşılık gelen nükleotidlere sahip tRNA molekülleri, ribozomun büyük alt birimine taşınır. TRNA molekülleri ribozom içerisine geldiğinde, karşılık gelen amino asit bir peptit bağı vasıtasıyla sırayla bir sonraki amino asit ile bağlanır. Bu peptit bağı, son kodon ribozomda okunana kadar devam eder. Protein zincirindeki amino asitlerin dizisine dayanarak, şekil ve fonksiyon her protein molekülü için değişir. Bu şekil ve fonksiyon, DNA molekülündeki nükleotit sekansının sonucudur. Böylece, farklı genlerin farklı proteinleri değişken şekil ve işlevlerle kodladığı açıktır..
Prokaryotlarda ve Eukaryotlarda Gen İfadesi arasındaki fark nedir?
• Prokaryotlarda nükleer bir zarf bulunmadığından, ribozomlar mRNA ipliği oluştukça proteini sentezlemeye başlayabilir. Bu, mRNA dizisinin ribozomların buna bağlanması için sitoplazmaya taşınması gereken ökaryotik süreçle oldukça zıttır. Ek olarak, prokaryotik gen ekspresyonunda ana adım sayısı ikidir, ökaryotik süreçte üç ana adım vardır.
• Ökaryotik DNA'da intron dizileri vardır, böylece mRNA dizisi de bunlara sahip olacaktır. Bu nedenle RNA eklenmesi, ökaryotlarda çekirdeğin içindeki mRNA ipliğinin sonlandırılmasından önce yapılmalıdır. Bununla birlikte, genetik materyallerinde intron eksikliği nedeniyle prokaryotlarda RNA işleme adımı yoktur..
• Prokaryotik işlemde eş zamanlı olarak kümelenmiş genleri (operonlar olarak bilinir) ifade etme olasılığı mevcuttur. Bununla birlikte, ökaryotlarda bir kerede sadece bir tanesi eksprese edilir ve müteakip mRNA ipliği ekspresyondan sonra da bozulur..