Transkripsiyon faktörleri, RNA polimerazı tarafından mRNA'nın sentezlenmesinde DNA şablonu dizisi üzerinde etki etmek için gereklidir. Farklı transkripsiyon faktörleri vardır. Bu transkripsiyon faktörleri, DNA zinciriyle bir kompleks oluşturur. Ya şablon iplikçikinin onayını değiştirirler ya da RNA polimeraz enziminin transkripsiyon denilen süreçte mRNA sentezine karşı afinitesini arttırırlar. İki ana transkripsiyon faktörü türü vardır. Bunlar Genel veya Bazal transkripsiyon faktörleri ve Spesifik Transkripsiyon faktörleridir. Genel transkripsiyon faktörleri, transkripsiyon işlemi sırasında başlangıç öncesi kompleksi oluşturmak için kullanılan faktörlerdir. Hemen hemen tüm ökaryotlarda bulunurlar ve prokaryotlarda daha az karmaşık bir kompleks oluştururlar. Spesifik transkripsiyon faktörleri, genel transkripsiyon işlemini aktive eden veya baskılayan spesifik DNA sekansları olan güçlendiriciler veya baskılayıcılardır. Bazı spesifik transkripsiyon faktörleri DNA sekansının kendisini değiştirebilir. temel fark genel transkripsiyon faktörleri ile spesifik transkripsiyon faktörleri arasındaki fonksiyonellik. Genel transkripsiyon faktörleri, transkripsiyon işleminin bir başlangıç öncesi kompleksinin oluşumunda yer alırken, spesifik transkripsiyon faktörleri, transkripsiyon sürecinin etkinleştirilmesine veya bastırılmasına katılır..
1. Genel Bakış ve Temel Fark
2. Genel Transkripsiyon Faktörleri nelerdir
3. Özel Transkripsiyon Faktörleri nelerdir
4. Genel ve Özel Transkripsiyon Faktörleri Arasındaki Benzerlikler
5. Yan Yana Karşılaştırma - Tablo Tabanlı Genel ve Spesifik Kopyalama Faktörleri
6. Özet
Genel veya Bazal transkripsiyon faktörleri transkripsiyon sırasında başlatma kompleksinin oluşumunda rol oynayan faktörlerdir. Transkripsiyon işlemi için gereklidirler, bu nedenle başarılı transkripsiyonda hayati bir rol oynarlar. Altı anahtar genel transkripsiyon faktörü vardır. Onlar; TFIID, TFIIB, TFIIH, TFIIE, TFIIF ve TFIIA. İnisiyasyon kompleksinin oluşumu sırasında farklı roller oynarlar.
Şekil 01: Genel Transkripsiyon Faktörleri
Yukarıda belirtilen genel transkripsiyon faktörleri, mRNA ipliğini uzatan RNA polimeraz tipi olan RNA polimeraz II için spesifiktir. RNA polimeraz I ve III ile ilgili genel transkripsiyon faktörleri vardır. Genel transkripsiyon faktörleri, üzerinde çalıştığı hücre tipine göre de değişebilir.
Spesifik Transkripsiyon Faktörleri, DNA sekanslarında da bulunan bölgelerdir. Çoğunlukla ya güçlendiriciler ya da baskılayıcılardır. Spesifik transkripsiyon faktörleri, şablon DNA şeridinde transkripsiyona tabi tutulan spesifik cis etkili elementlerdir. Bu spesifik güçlendiricilerin ve baskılayıcıların aktivasyonu, DNA molekülünün yönünü değiştirerek veya sinyalleme bölgeleri olarak hareket ederek enzimin afinitesini arttırmaya katılır. DNA transkripsiyon dizisinde modifikasyonları indüklemek için spesifik transkripsiyon faktörleri de kullanılır. Bu modifikasyonlar esas olarak metilasyon gibi kovalent modifikasyonları içerir. Böylece, metillenmiş DNA bölgeleri, transkripsiyon işleminin özel güçlendiricileri veya baskılayıcıları olarak işlev görür..
Şekil 02: Özel Transkripsiyon Faktörleri
Özel Transkripsiyon faktörleri türlerin türüne bağlıdır ve tüm ökaryotlarda yaygın olarak bulunmaz. Bu transkripsiyon faktörleri, sinyal transdüksiyon yolları yoluyla farklı metabolik koşullar tarafından aktive edilir. Aktivasyon üzerine, genin ekspresyonunu transkripsiyonel bir seviyede düzenlerler.
Genel ve Özel Transkripsiyon | |
Genel transkripsiyon faktörleri, transkripsiyon işlemi sırasında başlangıç öncesi kompleksi oluşturmak için kullanılan faktörlerdir. | Spesifik transkripsiyon faktörleri, genel transkripsiyon işlemini aktive eden veya baskılayan spesifik DNA sekansları olan güçlendiriciler veya baskılayıcılardır.. |
Molekül Türü | |
Genel transkripsiyon faktörleri protein tabanlıdır. | Spesifik transkripsiyon faktörleri nükleotid dizileridir. |
formasyon | |
Transkripsiyon başlatma sırasında genel transkripsiyon faktörleri, başlatma öncesi kompleksi oluşturur. | Spesifik transkripsiyon faktörleri, transkripsiyonun arttırıcıları veya baskılayıcıları olarak işlev görür.. |
Türleri | |
Altı ana tip vardır; TFIID, TFIIB, TFIIH, TFIIF, TFIIE ve genel transkripsiyon faktörlerinin TFIIA'sı. | Spesifik transkripsiyon faktörleri temel olarak güçlendiriciler ve baskılayıcılar olarak kategorize edilir. |
Transkripsiyon faktörleri, transkripsiyonel düzenleme için gereklidir ve işlemin artan verimliliği ve doğruluğu için gereklidir. Transkripsiyon faktörleri iki ana tiptir; Genel / Bazal ve Özel. Genel transkripsiyon faktörleri, transkripsiyon sırasında başlangıç öncesi kompleksin oluşumunda rol oynar, oysa spesifik transkripsiyon faktörleri DNA'nın kendisinde güçlendirici veya baskılayıcı olarak hareket eden bölgelerdir. Genel transkripsiyon faktörleri protein bazlıdır ve tüm ökaryotlar için gereklidir. Çok çeşitli değildir ve tekdüze moleküller olarak kalır. Spesifik bir transkripsiyon faktörü büyük ölçüde değişebilir ve bireylerin genetik yapısına bağlıdır. Genel ve spesifik transkripsiyon faktörleri arasındaki fark budur..
Bu makalenin PDF sürümünü indirebilir ve alıntı notuna göre çevrimdışı amaçlar için kullanabilirsiniz. Lütfen PDF sürümünü buradan indirin Genel ve Özel Transkripsiyon Faktörleri Arasındaki Fark
1.Pulverer, Bernd. “Diziye Özgü DNA Bağlayıcı transkripsiyon faktörleri.” Doğa Haberleri, Doğa Yayın Grubu. Burada mevcut
2. “Transkripsiyon Faktörleri - Genlere Özgü Faktörler Transkripsiyon Hızlarını Farklı Şekilde Artırır.” DNA, Bind, Promoter ve Bind - JRank Makaleleri. Burada mevcut
3. Orfanidler, G, vd. “RNA polimeraz II'nin genel transkripsiyon faktörleri.” Genler ve Geliştirme, Cold Spring Harbor Lab. Burada mevcut
1. 'Hazırlık kompleksi' ArneLH tarafından - Commons Wikimedia üzerinden kendi çalışması, (CC BY-SA 3.0)
2. 'Gen ekspresyon regülasyonunda transkripsiyon faktörünün rolü' Philippe Hupé tarafından - Emmanuel Barillot, Laurence Calzone, Philippe Hupé, Jean-Philippe Vert, Andrei Zinovyev, Kanser Chapman ve Hall / CRC Matematiksel ve Hesaplamalı Biyoloji, 2012 Hesaplamalı Sistem Biyolojisi, (CC BY-SA 3.0) Commons Wikimedia üzerinden