temel fark insersiyon ve replasman vektörleri arasında insersiyon vektörü orta uzunlukta yabancı DNA ekleme kabiliyetine sahipken, replasman vektörü daha büyük uzunluklarda yabancı DNA barındırma yeteneğine sahiptir.
Faj vektörleri, klonlama için kullanılan bakteriyofajlardır. İki tür faj vektörü vardır; bunlar ekleme vektörü ve değiştirme vektörüdür. Ayrıca, tüm faj vektörleri esansiyel olmayan genlerden oluşur. Bununla birlikte, yeni yabancı DNA eklerini kolaylaştırmak için bu genlerin fajlardan uzaklaştırılması gerekir..
1. Genel Bakış ve Temel Fark
2. Ekleme Vektörleri nedir
3. Değiştirme Vektörleri nedir
4. Ekleme ve Değiştirme Vektörleri Arasındaki Benzerlikler
5. Yan Yana Karşılaştırma - Tablo Şeklinde Ekleme ve Değiştirme Vektörleri
6. Özet
Her şeyden önce, sokma vektörü lambda klonlama vektörlerinin en basit şeklidir. Aslında, isteğe bağlı DNA pozisyonunda vektör genomu içine sokulan benzersiz bir kısıtlama alanına sahip bir faj vektörü türüdür. Ayrıca, faj DNA'sı çıkarılmadan kalır. Faj DNA'sının bu şekilde çıkarılmaması, vektör içinde klonlanacak eklerin (yabancı DNA) boyutunu azaltır. Ayrıca, bu vektörler cDNA klonlama ve ekspresyonunda faydalıdır. GT10, GT11 ve Zap bu vektörün örnekleridir.
Resim 01: Lambda Faj
Ekleme vektörü tek bir tanıma bölgesinden oluşur. Bu vektörün birincil işlevi ökaryotik mRNA dizilerinden türetilen cDNA kütüphaneleri geliştirmektir. Ayrıca, yalnızca 05-11 kb arasında değişen yabancı DNA uzunluklarını barındırabilir. Ayrıca, yabancı DNA'nın sokulması için eşsiz bir bölünme alanına sahiptir..
Yedek vektör veya ikame vektör "Bir" faj DNA'sının bir orta "dolgu parçası" bölgesinin çıkarılmasından geliştirilen bir faj vektörü türüdür. Arzu edilen yabancı DNA eki, faj DNA'sının yerini alır.
Şekil 02: Değiştirme Vektörü
Değiştirme vektörleri EMBL4 ve Charon40 gibi genomik kütüphanelerin oluşturulmasında önemlidir. Bu vektörler, 08-24kb uzunluklar arasında değişen daha geniş bir yabancı DNA uzunluğunu barındırabilir. Dolgu bölgesi ayrıca faj vektörünü bakteriyel bir konakçı içinde yaşayamaz hale getiren bir genden oluşur..
Ekleme ve Değiştirme Vektörleri | |
İnsersiyon vektörü, isteğe bağlı DNA bölgesinde faj genomu içine sokulmuş bir kısıtlama bölgesi olan bir faj vektörü türüdür.. | Değiştirme vektörü, faj DNA'sının bir orta 'dolgu fragmanı' bölgesinin çıkarılmasından geliştirilen bir faj vektörü türüdür. |
Kesici Uç Parçalarının Boyutu | |
05-11 kb uzunluk | 08-24 kb uzunluk |
Dolgu Parçası | |
Dolgu parçası yok | Dolgu parçası yabancı bir parça ile değiştirilir |
fonksiyon | |
CDNA kitaplıkları oluşturmak için önemli | Genom kütüphaneleri oluşturmada önemli |
Örnekler | |
GT10, GT11 ve Zap bunlara örnektir | EMBL4 ve Charon40 bunlara örnektir |
Bölünme Sitesi | |
Eşsiz bir bölünme bölgesi mevcut | Bölünme bölgesi litik döngü için gerekli olmayan genleri içerir |
Hem ekleme hem de değiştirme vektörleri iki tip faj vektörüdür. Her iki vektör de yeni yabancı DNA eklerinin yerleşmesini kolaylaştıran kısıtlama bölgelerine sahiptir. Yerleştirme vektörleri cDNA kitaplıkları oluşturmada önemlidir, yedek vektörler genomik kitaplıklar oluşturmada önemlidir. Ayrıca insersiyon vektörleri, orta uzunlukta DNA insertleri barındırır. Ancak ikame vektörleri, daha uzun uzunluklarda yabancı DNA eklerini barındırabilir. Genel olarak, bu ekleme ve değiştirme vektörleri arasındaki temel farktır.
1. Hasty, P, vd. “Yerleştirme Vektör Hedeflemesine Karşı Ekleme Verimliliği Farklı Kromozomal Konumlarda Değişir.” Moleküler ve Hücresel Biyoloji, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi, Aralık 1994,.
2. “Lambda Ekleme Vektörleri.” Biyoloji 335 Ders Notları - Lambda Vektörler, Burada bulunabilir.
3. “Değiştirme Vektörü.” Değiştirme Vektör - Değiştirme Vektör için Moleküler Biyoloji Terminolojisi - GenScript, burada bulabilirsiniz.
1. “Lambda faj” Lizanne Koch - Commons Wikimedia üzerinden ChemBioDraw (Public Domain) ile kendi çalışması