İntegral Proteinler ve Çevresel Proteinler
Proteinler, bir veya daha fazla polipeptit zincirinden oluşan makro moleküller olarak kabul edilir. Polipeptit zincirleri, peptit bağları ile birbirine bağlanan amino asitlerden oluşur. Bir proteinin birincil yapısı amino asit dizisi ile belirlenebilir. Bazı genler birçok proteini kodlar. Bu genler amino asit dizisini belirler, böylece birincil yapılarını belirler. İntegral ve periferik proteinler, oluşumlarından dolayı 'plazma membran proteinleri' olarak kabul edilir. Bu proteinler genellikle bir hücrenin dış çevre ile etkileşime girme yeteneğinden sorumludur.
Tamamlayıcı protein
İntegral proteinler esas olarak plazma zarının fosfolipit çift tabakasına tamamen veya kısmen daldırılmış olarak bulunur. Bu proteinlerin üzerinde hem polar hem de polar olmayan bölgeler vardır. Polar olmayan bölgeler içine gömülü iken kutup başları iki tabakanın yüzeyinden çıkıntı yapar. Genellikle sadece polar olmayan bölgeler, fosfolipitlerin yağ asidi kuyruklarıyla hidrofobik bağlar yaparak plazma zarının hidrofobik çekirdeği ile etkileşime girer..
Tüm zarı iç yüzeyden dış yüzeye uzanan integral proteinlere transmembran proteinleri denir. Transmembran proteinlerde, lipit tabakasından çıkan her iki uç polar veya hidrofilik bölgelerdir. Orta bölgeler polar değildir ve yüzeylerinde hidrofobik amino asitlere sahiptir. Üç tip etkileşim, bu proteinlerin lipit iki tabakasına gömülmesine yardımcı olur, yani fosfolipid moleküllerinin kutup başları ile iyonik etkileşimler, fosfolipid moleküllerinin hidrofobik kuyrukları ile hidrofobik etkileşimler ve belirli lipitler, glikolipidler veya oligosakkarit bölgeleri ile spesifik etkileşimler.
Periferik Protein
Periferik proteinler (ekstrinsik proteinler) fosfolipitlerin iki tabakasının en iç ve dış kısımlarında bulunur. Bu proteinler plazma zarına ya doğrudan fosfolipitlerin iki tabakalı kutup başları ile etkileşimler yoluyla ya da dolaylı olarak integral proteinlerle etkileşimler yoluyla bağlanır. Bu proteinler toplam membran proteinlerinin yaklaşık% 20-30'unu oluşturur.
Periferik proteinlerin çoğu, membranın en iç yüzeyinde veya sitoplazmik yüzeyinde bulunur. Bu proteinler, ya yağ zincirleri ile kovalent bağlar yoluyla ya da bir oligosakkarit yoluyla fosfolipitlere bağlı kalır.
İntegral ve Periferik Protein arasındaki fark nedir?
• Periferik proteinler plazma membranının yüzeyinde meydana gelirken, integral proteinler plazma membranının lipit tabakasına tamamen veya kısmen daldırılmış halde bulunur..
• Periferik proteinler lipit iki tabakasına gevşek bir şekilde bağlanır ve iki fosfolipit tabakası arasındaki hidrofobik çekirdek ile etkileşime girmez. Buna karşılık, integral proteinler sıkıca bağlanır ve plazma zarının hidrofobik çekirdeği ile doğrudan etkileşime girer. Bu nedenlerden dolayı, integral protein ayrışması periferik proteinlerden daha zordur.
• Periferik proteinleri plazma zarından izole etmek için hafif tedaviler kullanılabilir, ancak entegre proteinlerin izolasyonu için hafif tedaviler yeterli değildir. Hidrofobik bağları kırmak için deterjanlar gereklidir. Böylece, integral proteinler plazma zarından izole edilebilir.
• Bu iki proteinin plazma zarından izole edilmesinden sonra, periferik proteinler nötr sulu tamponlarda çözülebilirken, integral proteinler nötr sulu tamponlarda veya agregalarda çözülemez.
• Periferik proteinlerden farklı olarak, integral proteinler çözündürüldüğünde lipit ile ilişkilidir.
• Periferik proteinlerin örnekleri, eritrosit spektrumu, mitokondrinin sitokrom C ve ATP-ase ve elektroplaks membranlarındaki asetilkolinesterazdır. İntegral proteinlere örnek olarak zara bağlı enzimler, ilaç ve hormon reseptörleri, antijen ve rodopsin verilebilir..
• İntegral proteinler yaklaşık% 70'i temsil ederken periferik proteinler plazma membran proteinlerinin kalan kısmını temsil eder.