Lac vs Trp Operon
Operon, prokaryotlarda özel bir gen hizalamasıdır. Bir operonda, belirli bir fonksiyon için gereken tüm genleri hizalar. Bu kuruluş, tek bir destekleyicinin belirli bir işleve katılan tüm genleri etkinleştirmesine, devre dışı bırakmasına ve düzenlemesine izin verir. Bu yapı nedeniyle, operon prokaryotik gen ekspresyonunun fonksiyonel birimi olarak adlandırılır. Lac operon ve Trp operon, E.coli bakteriyel genomunda ve diğer birçok bakteride bulunan iki operondur. Bu operonlar farklı fonksiyonları kontrol eder. Operon, prokaryotik gen ekspresyonunun fonksiyonel birimidir.
Lac Operon
Lac operon, E.coli bakterilerinde laktoz taşınmasından ve metabolizmasından sorumlu gen kümesidir. Operonun bir promotör bölgesi ve lac Z, lac Y, lac A ve lac I genleri vardır. Operon laktoz varlığı ile aktive edilir. Lac Z, lac Y, lac A beta galaktosidaz, laktoz geçirgenliği ve tiyogalaktosid transasetilaz enzimleri üretir.
Geçirgenlik enzimi laktozun hücreye girmesine izin verir ve beta galaktosidaz laktozu glikoz ve galaktoza hidrolize eder. Transasetilaz, substratları fonksiyonelleştirmek için kullanılır. Daha fazla tercih edilen bir substrat mevcutsa veya laktoz yoksa, lak I aktif hale gelir. Bu bir allolaktoz bağlayıcı protein üretir. Alloktoz varlığında, baskılayıcı protein molekülleri allolaktoz moleküllerine bağlanır. Bu, transkripsiyonun bozulmadan devam etmesini sağlar. Laktozun yokluğunda, bu protein, lak operonu bloke eden ve durduran gen transkripsiyonunun promotör bölgesine (kontrol ünitesi) bağlanır. Bu olduğunda, laktoz geçirgenliği veya beta galaktosidaz üretilmez. Bu nedenle laktoz katabolizması durdurulur.
Trp Operon
Trp operon ayrıca tek bir promoter tarafından kontrol edilen bir genler kümesidir. Bu operon Trp sentezi için gerekli olan tüm genleri içerir. Trp olarak yaygın bir şekilde kısaltılmış triptofan alışılmadık bir amino asittir. Operon, toplu olarak triptofan sentetazı kodlayan trp E, trp D, trp C, trp B ve trp A'dan oluşur; triptofan üreten enzim.
Trp operon ayrıca gerektiğinde bir baskılayıcı üreten trp R içerir. Triptofan varlığında, bastırıcı yapısını aktif forma değiştirdiği ve promotör bölgesine bağlı olduğu için bu operon devre dışı kalır. Triptofanın yokluğunda, baskılayıcı protein, promotör bölgesinden salınır veya promotör bölgesine bağlanamayan inaktif konformasyondadır ve böylece sonuç olarak genlerin transkripsiyonu triptofan yapımına başlar. Lak operonun aksine bu operon triptofan varlığında deaktive edilir, bu mekanizma “olumsuz baskıcı geri bildirim mekanizması”.
Lac operon ve Trp operon arasındaki fark nedir?
• Lak operon bir şekerin katabolik süreciyle ilişkilidir, ancak Trp operon bir amino asidin anabolik işleminde yer alır.
• Lak operon laktoz varlığında aktive olur, ancak Trp operon triptofan varlığında deaktive olur.
• Lac operon üç yapısal gen ve bir baskılayıcı genden oluşur, ancak Trp operon beş yapısal gen ve bir baskılayıcı genden oluşur..
• Lac operon “zayıflama” mekanizması kullanmaz, ancak Trp operon “zayıflama” mekanizması kullanır.