Metabolitler, hücrelerdeki metabolik reaksiyonlarda yer alan küçük moleküllerdir. Metabolitler arasında metabolik ara maddeler, hormonlar, ikincil metabolitler, sinyal molekülleri, vb bulunur. Bunlar, hücrelerin biyokimyasal reaksiyonlarının işleyen molekülleridir. Biyolojik bir numunenin veya tek bir organizmanın tam bir metaboliti seti metabolom olarak bilinir. Metabolome, vücutta her saniyede değişen dinamik bir koleksiyon. Metabolomikler ve metabonomikler, bir organizmanın metabolomunun çalışması ile ilgili iki terimdir. Metabolomikler ve metabonomikler arasındaki temel fark metabolomikler normal endojen metabolizma hakkında daha fazla endişelidir ve hücresel veya organ düzeyinde metabolik profil oluşturma süre metabonomikler, metabolik profil oluşturmanın çevresel faktörler, hastalıklar, bağırsak mikroorganizmaları ve metabolik profil oluşturma gibi metabolizma bozukluklarının bilgisiyle genişletilmesi ile ilgilidir.. Metabolomikler esas olarak kütle spektrometrisi tarafından yönlendirilir ve metabonomikler metabolit analizi için NMR spektroskopisini kullanır.
İÇİNDEKİLER
1. Genel Bakış ve Temel Fark
2. Metabolomik nedir
3. Metabonomik nedir
4. Yan Yana Karşılaştırma - Metabolomikler ve Metabonomikler
5. Özet
Metabolomik, hücreler, biyoakışkanlar, dokular veya organizmalarda meydana gelen metabolik süreçlerin incelenmesidir. İyi analitik ve istatistiksel araçlar kullanılarak hücresel metabolitlerin tanımlanmasını ve miktarını içerir. Metabolomikler, bir organizmanın metabolizması hakkında bilgi ortaya çıkardığı için önemli bir çalışma olarak kabul edilir..
Metabolik reaksiyonların substratlarını ve ürünlerini incelemek için metabolomikler, analitik bir platform olarak kütle spektrometrisini kullanır. Kütle spektrometrisi, hücrelerin veya dokuların gerçek biyokimyasal durumunu yansıtan metabolit türlerini ve konsantrasyonlarını ortaya çıkarır. Bu nedenle metabolomikler, bir organizmanın moleküler fenotipinin en iyi temsilcisi olarak düşünülebilir. Metabolomikler, organizmaların küçük moleküllerinin omik bir teknolojisidir ve diğer omik çalışmalarla karşılaştırıldığında; metabolomikler çok önemlidir, çünkü hücrelerin biyokimyasal reaksiyonunun mevcut durumunu doğrudan yansıtır.
Metabolomikler ayrıca, aşağıdaki şekilde gösterildiği gibi protein olan enzimlerin aktiviteleri nedeniyle üretildikleri için proteomiklerin bir uzantısı olarak da düşünülebilir..
Şekil 01: Metabolomik şema
Metabonomikler, patofizyolojik stresler veya genetik modifikasyon ile ilişkili olarak belirli zamanlarda multiparametrik metabolik yanıtların kantitatif ölçümü olarak tanımlanır. Bu genellikle insan beslenmesi ve ilaçlara veya hastalıklara verilen cevaplarla ilgili yapılan çalışmalara uygulanır. Bu yaklaşıma Londra'daki Imperial College'da Jeremy Nicholson öncülük etti ve toksikoloji, hastalık teşhisi, beslenme, vb. Gibi bir dizi alanda kullanılmıştır. Tarihsel olarak, metabolizma sistem biyolojisinin kapsamını çalışmalara uygulamak için ilk yöntemlerden biriydi metabolizmanın.
Metabonomikler, metabolomiklerde münferit metabolik bileşiklerin tanımlanmasından ziyade biyokimyasal profillerin karşılaştırılmasıyla daha fazla ilgilidir. Bu nedenle, metabonomikler metabolomiklerin bir alt kümesi olarak tanımlanabilir. Esas olarak, farklı popülasyonların metabolik profillerinin hastalıklar, çevresel stresler, genetik modifikasyon, beslenme, ilaçlar vb. , vb.
Metabonomik çalışmalar hem hücre içi hem de hücre dışı metabolitleri ortaya çıkarır. Çok sayıda metaboliti aynı anda ve tekrar tekrar analiz etmek için yüksek verim teknikleri kullanır ve hücrelerin fizyolojik durumunun geçici olarak araştırılmasını sağlar. Ayrıca metabolitler ve organizmanın patolojik durumu arasındaki korelasyonu da ortaya koymaktadır. Metabonomik çalışmaları desteklemek için, yukarıdaki şekilde gösterildiği gibi birbirleriyle ilişkili oldukları için genomik ve proteomik kullanılabilir..
Metabolomik ve Metabonomik | |
Metabolomik, bir organizmanın metabolitlerinin tamamının incelenmesidir | Metabonomik, canlı sistemlerin patofizyolojik uyaranlara veya genetik modifikasyonlara geçici olarak multiparametrik metabolik cevaplarının nicel çalışmasıdır.. |
Asıl endişe | |
Metabolomikler, metabolik profil oluşturma ve hücrelerde bulunan bireysel metabolitleri tanımlama ile daha ilgilidir. | Metabonomikler, genetik modifikasyonlar, hastalıklar, çevresel stresler, patolojik uyaranlar, ilaçlar vb.İle ilişkili olarak popülasyonların metabolitlerini veya metabolik profillerini karşılaştırmakla daha ilgilidir.. |
Bilgi | |
Metabolomikler temel olarak endojen metabolizmaya odaklanır. | Metabonomikler endojen metabolizma ile sınırlı değildir. Diyet örüntüleri, toksinler, hastalık süreçleri vb.. |
Analitik Araçlar | |
Analitik temel platform olarak kütle spektrometrisi kullanır | Metabonomikler ana analitik platform olarak NMR spektroskopisini kullanır. |
Metabolom, bir hücrede veya bir organizmada bulunan metabolitler adı verilen küçük moleküllerin tamamını temsil eder. Metabolomik, metabolik profil oluşturmak için tüm metabolomun çalışmasıdır. Metabolomik, bilim adamlarının hücrenin veya organizmanın gerçek fizyolojik durumunu ölçmesini sağlar. Metabonomikler, canlı sistemlerin patofizyolojik uyaranlara ve genetik modifikasyonlara multarametrik metabolik tepkileri hakkında bilgi çıkarmaya uzanan metabolomiklerin bir parçasıdır. Metabonomikler sadece metabolomikler gibi bireysel metabolik profilleme ile ilgili değildir; metabolik profilleri çevresel stresler, hastalıklar, toksinler, vb. Bu nedenle, bazen bu ikisi metabolomik ve metabonomik arasındaki farkı dikkate almadan eş anlamlı olarak kabul edilir..
Referans:
1. Roessner, Ute ve Jairus Bowne. “Metabolomik ne demek oluyor.” Biyoteknikler - Metabolomiklerin anlamı nedir? N.p., Nisan 2009. Web. 24 Nisan 2017
2. Jeremy J. Ramsden (1). “Metabolomik ve Metabonomik.” Springer. Springer Londra, 01 Ocak 1970. Web. 25 Nisan 2017
Görünüm inceliği:
1. “Metabolomik şema” Lmaps (tartışma) - Commons Wikimedia üzerinden Kendi İşiniz (CC BY-SA 3.0)