Oksidatif ve Oksidatif Olmayan Deaminasyon Arasındaki Fark

temel fark oksidatif ve oksidatif olmayan deaminasyon arasında oksidatif deaminasyon, amino grubu amino asitlerin oksidasyonu yoluyla gerçekleşirken oksidatif olmayan deaminasyon, oksidasyon dışındaki reaksiyonlar yoluyla gerçekleşir.

Deaminasyon, adından da anlaşılacağı gibi, bir amin grubunun herhangi bir molekülden çıkarılmasıdır. Bunlar deaminaz enzimleri tarafından katalize edilen kimyasal reaksiyonlardır. Vücudumuzda, bu tip reaksiyonlar karaciğerde ve bazen böbrekte de görülür (örn: böbreklerde glutamatın deaminasyonu). Orada çıkarılan amin grubu amonyağa dönüşür ve vücudumuzdan atılır. Ayrıca, deaminasyon reaksiyonları olarak gerçekleşen dört ana reaksiyon vardır; oksidasyon, indirgeme, hidroliz ve molekül içi reaksiyonlardır. Bunlardan, oksidasyon hariç, diğer reaksiyonlar oksidatif olmayan reaksiyonlardır..

İÇİNDEKİLER

1. Genel Bakış ve Temel Fark
2. Oksidatif Deaminasyon Nedir?
3. Oksidatif Olmayan Deaminasyon Nedir?
4. Yan Yana Karşılaştırma - Tablo Formunda Oksidatif ve Nonoksidatif Deaminasyon
5. Özet

Oksidatif Deaminasyon Nedir??

Oksidatif deaminasyon, bir amin grubunun oksidasyon yoluyla bir molekülden uzaklaştırılması işlemidir. Bu tip reaksiyonlar büyük ölçüde karaciğer ve böbrekte görülür. Amin gruplarından alfa-keto asitlerin ve diğer bazı oksitlenmiş ürünlerin üretilmesini içerir. Bu reaksiyon amino asitlerin katabolizmasında çok önemlidir. Amino asitlerden katabolize bir ürün oluşturur. bu reaksiyonun yan ürünü, toksik bir yan ürün olan amonyaktır. Burada, amin grubu amonyağa dönüşür. Ve sonra, bu amonyak üre haline dönüşür ve vücudumuzdan atılır.

Resim 01: Glutamatın Oksidatif Deaminasyonu

Çoğu zaman, glutamik asit veya glutamat bu tür reaksiyonların ana reaktanıdır. Çünkü glutamik asit, hücrelerimizde meydana gelen birçok transaminasyon reaksiyonunun son ürünüdür. Ayrıca, bu reaksiyonda yer alan enzim glutamat dehidrojenazdır. Bu enzim bir amino grubunun bir alfa-keto asit grubuna transferini katalize eder. Ayrıca, bu tip reaksiyonlarda rol oynayan başka bir enzim daha vardır. Oksijen ilavesi ile deaminasyonu katalizleyen monoamin oksidaz enzimidir.

Oksidatif Olmayan Deaminasyon Nedir??

Oksidatif olmayan deaminasyon, bir amin grubunun oksidasyon dışındaki farklı reaksiyonlar yoluyla bir molekülden uzaklaştırılması işlemidir. Biz buna oksidasyon olmadan “doğrudan deaminasyon” diyoruz. Bu reaksiyonlar indirgeme, hidroliz ve molekül içi reaksiyonları içerir. Bununla birlikte, bu reaksiyon amino asitlerden toksik yan ürün amonyak üretimini de içerir. Dahası, bu tip reaksiyonlara giren en yaygın amino asitler serin, treonin, sistein ve histidindir. Benzer şekilde, bu reaksiyonda yer alan en yaygın enzimler dehidratazlar, liyazlar ve amid hidrolazlardır..

Resim 02: Oksidatif Olmayan Deaminasyona Giren Serin

İndirgeme deaminasyonu, amin grubunun bir yağ asidine indirgenmesi yoluyla meydana gelir. Hidrolitik deaminasyon, amin grubunun hidroksi asit grubuna dönüştürülmesini içerir. Molekül içi reaksiyondan, amin grubu doymamış bir yağ asidi grubuna dönüşür. Bir örnek olarak, dehidrataz enzimleri serin'i piruvat ve amonyağa dönüştürebilir ve ayrıca treonini alfa-ketobutirat ve amonyağa dönüştürebilir.

Oksidatif ve Oksidatif Olmayan Deaminasyon Arasındaki Fark Nedir??

Deaminasyon, bir amin grubunun bir molekülden çıkarılmasıdır. Böylece, deaminasyonda, amin grubu, maruz kaldığı reaksiyon tipine bağlı olarak farklı başka ürünlere dönüşür. Oksidatif ve oksidatif olmayan deaminasyon arasındaki temel fark, oksidatif deaminasyonun amino grubu amino asitlerin oksidasyonu yoluyla, oksidatif olmayan deaminasyonun oksidasyon dışındaki reaksiyonlarla gerçekleşmesidir. Bu farktan dolayı, bu işlemlerde yer alan kimyasal reaksiyonlar da birbirinden farklıdır. Yani, oksidatif deaminasyon oksidasyonu içerirken, oksidatif olmayan deaminasyon indirgeme, hidroliz veya moleküller arası reaksiyonları içerir. Ayrıca, oksidatif ve oksidatif olmayan deaminasyon arasındaki bir diğer önemli fark, bu reaksiyonlarda yer alan enzimlerdir. Yani, glutamat dehidrojenaz ve monoamin oksidaz oksidatif sürece dahil olurken, dehidratazlar, liyazlar ve amid hidrolazlar enzimler olarak oksidatif olmayan sürece dahil olur.

Aşağıdaki infografik, oksidatif ve oksidatif olmayan deaminasyon arasındaki farkı tablo şeklinde özetlemektedir.

Özet - Oksidatif ve Nonoksidatif Deaminasyon

Deaminasyon, bir amin grubunun deaminasyonu yoluyla amonyağın serbest bırakılmasıdır. İki ana tip oksidatif ve oksidatif olmayan deaminasyon vardır. Oksidatif olmayan deaminasyon, indirgeme, hidroliz ve moleküller arası reaksiyonlar gibi oksidasyon dışındaki reaksiyonları içerir. Bu nedenle, oksidatif ve oksidatif olmayan deaminasyon arasındaki temel fark, oksidatif deaminasyonun amino grubu amino asitlerin oksidasyonu yoluyla gerçekleşmesi, oksidatif olmayan deaminasyonun oksidasyon dışındaki reaksiyonlarla gerçekleşmesidir..

Referans:

1. “Oksidatif Deaminasyon.” Vikipedi, Wikimedia Foundation, 24 Nisan 2018. Buradan erişebilirsiniz 
2. Ahmed, Minhaz. “TRANSDEAMİNASYON VE DEAMİNASYON.” LinkedIn SlideShare, 24 Nisan 2014. Buradan ulaşabilirsiniz 

Görünüm inceliği:

1. ”Oksidatif deaminasyon” Tomas Drab - Commons Wikimedia üzerinden kendi çalışması, (Public Domain)  
2. Commons Wikimedia üzerinden “Serin” (CC BY-SA 3.0)