Virüsler, sadece canlı bir organizmanın içinde çoğalan küçük bulaşıcı parçacıklardır. Hayvanlar, bitkiler ve bakteriler de dahil olmak üzere hemen hemen tüm canlı organizmaları enfekte edebilirler. Protein kapsidleri ve DNA veya RNA genomundan oluşan mikroskopik parçacıklardır. Virüsün genomu DNA veya RNA, tek sarmallı veya çift sarmallı, dairesel veya doğrusal olabilir. Baltimore sınıflandırma sistemine göre virüsler sahip oldukları genom tipine göre yedi gruba ayrılabilir. Retrovirüs ve bakteriyofaj iki önemli virüs kategorisidir. Retrovirüs ve bakteriyofaj arasındaki temel fark, retrovirüs, pozitif içeren bir virüs grubudur. tek sarmallı RNA genomunu algılar ve DNA'nın bir ara maddesi yoluyla çoğaltabilir süre bakteriyofaj, DNA veya RNA genomu içeren bakteri enfeksiyonu olan bir virüstür.
İÇİNDEKİLER
1. Genel Bakış ve Temel Fark
2. Retrovirüs nedir
3. Bakteriyofaj Nedir
4. Yan Yana Karşılaştırma - Retrovirüs vs Bakteriyofaj
5. Özet
Retrovirüs, pozitif anlamda tek sarmallı bir RNA genomuna sahip olan bir viral gruptur. Ters transkriptaz adı verilen bir enzim içerirler ve çoğalmaları bir DNA ara maddesi yoluyla gerçekleşir. Çoğaltma sırasında bir ara DNA üretimi bu virüs grubuna özgüdür.
Enfeksiyon sırasında retrovirüsler, viral partikülün dış yüzeyinde bulunan spesifik glikoproteinlerden konakçı hücre ile bağlanır. Hücre zarıyla kaynaşırlar ve konakçı hücreye girerler. Konak hücre sitoplazmasına nüfuz ettikten sonra retrovirüs, ters transkriptaz enzimini kullanarak genomunu çift sarmallı DNA'ya kopyalar. Yeni DNA, integraz adı verilen bir enzim kullanılarak konakçı hücre genomuna dahil olur. Enfeksiyon meydana gelmesine rağmen, konakçı hücre entegrasyondan sonra viral DNA'yı tanıyamaz. Bu nedenle, konakçı genom replikasyonu sırasında viral genom çoğalır ve viral partiküllerin yeni kopyalarını yapmak için gerekli proteinleri üretir..
İnsan immün yetmezlik virüsü (HIV) ve insan T hücresi lösemi virüsü (HTLV) yaygın insan retrovirüsleridir. HIV hastalık AID'lerine neden olur ve HTLV lösemiye neden olur.
Viral genomu konakçı organizmalara sokmadaki doğal yetenekleri nedeniyle, retrovirüsler gen dağıtım sistemlerinde kullanılır ve Moleküler Biyolojide değerli araştırma araçları olarak kabul edilir..
Şekil 01: HIV replikasyonu
Bir bakteriyofaj (faj), belirli bir bakteri içinde enfekte olan ve yayılan bir virüstür. Bakterisidal ajan olarak hareket ettikleri için bakteri yiyen olarak da bilinirler. Bakteriyofajlar 1915'te Frederick W. Twort tarafından keşfedildi ve 1917'de Felix d'Herelle tarafından bakteriyofajlar olarak adlandırıldı. Bunlar dünyadaki en bol virüs. Ayrıca bir genom ve bir protein kapsidinden oluşurlar. Bakteriyofaj genomu DNA veya RNA olabilir. Ancak bakteriyofajların büyük çoğunluğu çift zincirli DNA virüsleridir..
Bakteriyofajlar bir bakteriye veya belirli bir bakteri grubuna özgüdür. Bakteri suşu veya enfekte ettikleri türler ile adlandırılırlar. Örnek olarak, enfekte olan bakteriyofajlar E coli coliphage denir. Bakteriyofajlarda farklı şekiller vardır. Bakteriyofajların sahip olduğu en yaygın şekil baş ve kuyruk şeklidir..
Bakteriyofajlar çoğalmak için konakçı hücreye bulaşmalıdır. Yüzey reseptörlerini kullanarak bakteri hücre duvarına sıkıca yapışırlar ve genetik materyallerini konakçı hücreye enjekte ederler. Bakteriyofajlar, litik ve lizojenik döngü adı verilen iki tip enfeksiyona maruz kalabilir. Fajın türüne bağlıdır. Litik döngüde, bakteriyofajlar bakterileri enfekte eder ve konakçı bakteri hücresini lizis ile hızla öldürür. Lizojenik döngüde, viral genetik materyal bakteriyel genom veya plazmidlerle bütünleşir ve konakçı bakteri içinde konakçı bakterisini öldürmeden birkaç ila bin nesil boyunca bulunur..
Fajların moleküler biyolojide çeşitli uygulamaları vardır. Antibiyotiklere dirençli patojenik bakteri suşlarını tedavi etmek için kullanılırlar. Hastalık teşhisinde spesifik bakterileri tanımlamak için de kullanılabilirler.
Resim 02: Bakteriyofaj enfeksiyonu
Retrovirüs ve Bakteriyofaj | |
Retrovirüs, tek zincirli bir RNA genomu içeren bir virüs grubudur. | Bakteriyofaj, bakterileri enfekte eden ve çoğaltan bir virüstür. |
Ters Transkriptaz Varlığı | |
Retrovirüs, ters transkriptaz adı verilen enzimi içerir. | Bakteriyofaj ters transkriptaz içermez. |
Ters Transkripsiyon Oluşumu | |
Viral replikasyon sırasında ters transkripsiyon meydana gelir | Viral replikasyon sırasında ters transkripsiyon oluşmaz. |
DNA Aramaddesi Üretimi | |
Retrovirüsler genomun ara DNA kopyasını üretir. | Bakteriyofaj DNA ara maddesi üretmez. |
Retrovirüs ve bakteriyofaj iki tür virüstür. Retrovirüs, bir ara DNA yoluyla çoğalan pozitif anlamda tek sarmallı RNA genomuna sahip bir virüs grubudur. Bakteriyofaj, bakterilere saldıran ve bakteriyel çoğaltma mekanizmaları kullanarak çoğalan bir virüstür. Bakteriyofajlar biyosferde en bol bulunan virüslerdir ve DNA veya RNA genomlarına sahip olabilirler. Bu retrovirüs ve bakteriyofaj arasındaki farktır.
Referanslar:
1. Tabut, John M. “Retrovirüslerin Biyolojideki Yeri.” Retrovirüsler. ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi, 01 Ocak 1997. Web. 05 Nisan 2017
2. Gelderblom, Hans R. “Virüslerin Yapısı ve Sınıflandırılması.” Tıbbi Mikrobiyoloji. 4. baskı. ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi, 01 Ocak 1996. Web. 05 Nisan 2017
3. Hatfull, Graham F. ve Roger W. Hendrix. "Bakteriyofajlar ve Genomları." Virolojide güncel görüş. ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi, 01 Ekim 2011. Web. 05 Nisan 2017
4. Tabut, John M. “Retroviral Enfeksiyona Bağışıklık Tepkisi.” Retrovirüsler. ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi, 01 Ocak 1997. Web. 05 Nisan 2017
Görünüm inceliği:
“Hiv gross” Çeviren: Raul654 - Aslen GFDL image'dan: Hiv gross german.png, (CC BY-SA 3.0) Commons Wikimedia üzerinden
“Faj genomunu bakteriyel hücreye enjekte ediyor” GrahamColm tarafından Commons Wikimedia üzerinden İngilizce Wikipedia (CC BY-SA 3.0)