T4 ve T7 DNA Ligazı Arasındaki Fark

Temel Fark - T4 ve T7 DNA Ligazı
 

DNA ligazı, moleküler biyoloji tekniklerinde kullanılan önemli bir enzimdir. Nükleotidler arasında fosfodiester bağları oluşturarak nükleotitleri birleştirmek için moleküler bir yapıştırıcı görevi görür. Fosfodiester bağları, şeker grubunun 3 'hidroksil ucu ile 5' uç fosfat grubu arasında oluşturulur. DNA ligazı, replikasyon sürecinde gecikmeli ipliğin Okazaki fragmanlarına katılmak için ve DNA onarım mekanizmaları sırasında hayati önem taşır ve laboratuvar ortamında ilgili gen genini vektör genomuna birleştirmek için klonlama deneyleri. Şu anda moleküler biyologlar tarafından kullanılan iki ana DNA ligaz vardır: T4 ve T7 DNA ligazları. T4 DNA ligazı, T4 bakteriyofajdan izole edilen ilk enzimlerden biridir. Daha küçük bir protein olan T7 DNA ligazı, T7 bakteriyofajdan izole edilen bir enzimdir. Bu, T4 ve T7 DNA ligazları arasındaki temel farktır.

İÇİNDEKİLER

1. Genel Bakış ve Temel Fark
2. DNA Ligazının Etkisi
3. T4 DNA Ligaz nedir
4. T7 DNA Ligaz nedir
4. T4 ve T7 DNA Ligazı Arasındaki Benzerlikler
5. Yan Yana Karşılaştırma - T4 ve T7 DNA Ligaz Tabular Formunda
6. Özet

DNA Ligazının Etkisi?

DNA ligasyonu üç aşamalı bir reaksiyonda gerçekleşir. İlk adım, AMP'nin lizin terminal yan zincir azotuna bağlı olduğu bir kovalent enzim-adenilat ara maddesi oluşturan ATP'nin alfa fosforuna bir nükleofilik saldırıdır. İkinci aşamada, 5'-fosfat sonlu DNA substratı tarafından enzim-adenilat fosforuna lizin salgılayarak ve DNA-adenilat oluşturarak bir nükleofilik saldırı meydana gelir. Son adımda, DNA-adenilat başka bir DNA zincirinin 3'-OH tarafından saldırıya uğrar, AMP'yi serbest bırakır ve polinükleotitlere katılır.

T4 DNA Ligaz nedir?

T4 Ligaz, Meselson, Weigle ve Kellenberger tarafından izole edilen ve tanımlanan ilk ligazdı ve üretilen ilk ticari ligazdı. T4 DNA ligazı, fosfodiester bağ oluşumunu katalize eden ATP'ye bağımlı bir enzimdir. 487 amino asit kalıntısına sahip tek bir polipeptit zinciridir ve yaklaşık 77 kDa'lık bir moleküler ağırlığa sahiptir. Aktivitesi için optimum pH, 7.5 - 8 aralığındadır..

Resim 01: T4 DNA Ligazı

T4 DNA Ligaz, adından da anlaşılacağı gibi, bakteriyofaj T4'te bulunur ve faj, enfeksiyonla birlikte enzimi ürettiğinde izole edilir -E. coli. Enzim, çift iplikli DNA duplekslerini künt uçlarla bağlar ve bağlanacak olan fragmanlar birbirine yakın olmalıdır.

T7 DNA Ligaz nedir?

T7 ligazı, T7 Bakteriyofaj tarafından üretilen 41 kDa proteindir ve enfekte edilerek izole edilir E. coli Hücreler. T7 ligazının ana işlevi, DNA dublekslerini fosfodiester bağları boyunca bağlamak ve klonlama deneyleri sırasında yakındaki DNA fragmanlarına katılmaktır. T7 DNA ligazı için optimum pH, 7.0 - 7.2 aralığındadır. T7 ligazı ATP'ye bağımlıdır. T7 DNA ligazları ayrıca transkripsiyon sırasında anormal konformasyonlara yol açarak DNA ve RNA melezlerini tavlayabilir; ancak, bu fenomen hala araştırma aşamasındadır. laboratuvar ortamında çalışmalar.

T4 ve T7 DNA Ligazı Arasındaki Benzerlikler Nelerdir??

• T4 ve T7 DNA Ligazı, DNA dublekslerini 3 'OH ucu ile DNA parçasının 5' fosfat ucu arasında fosfodiester bağ oluşumu yoluyla tavlayarak bir ligasyon reaksiyonuna katılır..
• Her iki enzim birbirine yakın olan künt uçlu DNA duplekslerini bağlar.
• Her iki enzim ATP'ye bağımlıdır.
• Bu enzimler enfekte edilerek izole edilir. E. coli belirli bakteriyofajlı hücreler.
• Her iki enzimin uygulamaları şunları içerir:
  • Moleküler klonlama - vektörle ilgilenilen geni bağlamak için
  • DNA onarımı - çift sarmallı nişleri onarmak için
  • In vitro DNA replikasyonu
  • Ligaz zincir reaksiyonu

T4 ve T7 DNA Ligazı Arasındaki Fark Nedir??

T4 ve T7 DNA Ligazı
T4 DNA Ligaz tipi bakteriyofaj T4'ten izole edilen DNA ligazı ve bitişik DNA fragmanlarının fosfodiester bağ oluşumu yoluyla lige edilmesinde rol oynar.	T7 DNA Ligaz tipi DNA ligazı bakteriyofaj T7'den izole edilir ve bitişik DNA fragmanlarının fosfodiester bağ oluşumu yoluyla ligasyonunda yer alır.
Proteinin Boyutu
T4 DNA ligazının boyutu 77 kDa - T7 DNA ligazına kıyasla daha büyüktür.	T7 DNA ligazının boyutu 41 kDa'dır.
Optimum pH
T4 DNA ligazını çalıştıran pH aralığı 7.5 - 8.0'dır.	T7 DNA ligazını çalıştıran pH aralığı 7.0 - 7.2'dir.

Özet - T4 vs T7 DNA Ligaz

DNA ligazları, ilgilenilen geni içeren rekombinant DNA moleküllerini üretmek için moleküler klonlamaya katılan önemli bir enzim sınıfıdır. Ligasyon reaksiyonu, enerjiyi kullanan bir reaksiyondur ve mevcut ligazları modüle ederek doğruluğu artırmak için yeni araştırmalar yapılmaktadır. T4 ve T7 DNA ligazları, moleküler biyolojik tekniklerde kullanılan iki tür önemli DNA ligaz enzimidir. T7 DNA ligazı, enfekte olmuş T4'ten izole edilen birincil ligaza dayanan bir araştırmanın sonucudur. E. coli. T7, daha küçük boyutu nedeniyle işlevini yerine getirirken daha fazla verimlilik ve doğruluk gösterir. Bu T4 ve T7 ligazı arasındaki farktır.

İndir T4 vs T7 DNA Ligaz PDF Versiyonu

Bu makalenin PDF sürümünü indirebilir ve alıntı notlarına göre çevrimdışı amaçlar için kullanabilirsiniz. Lütfen PDF sürümünü buradan indirin T4 ve T7 Ligase Arasındaki Fark.

Referanslar:

1. “DNA Ligazı, T4.” DNA Ligaz, T4 - Worthington Enzim Kılavuzu, Buradan bulunabilir. Erişim tarihi: 22 Ağu 2017.
2. Doherty, Aidan J., vd. “Bakteriyofaj T7 DNA Ligazı AŞIRI BASINÇ, ARITMA, KRİSTALİZASYON VE KARAKTERİZASYON.” Journal of Biological Chemistry, 10 Mayıs 1996, Burada bulunabilir. Erişim tarihi: 22 Ağu 2017.

Görünüm inceliği:

1. “Şekil 3. Atel Yardım Tek Telli mRNA-DNA T4 DNA Ligaz Ligasyonu.” (CC BY 3.0) Commons Wikimedia üzerinden