Ti ve Ri Plazmid Arasındaki Fark

Temel Fark - Ti vs Ri Plasmid
 

Agrobacterium taç safra hastalığı ve tüylü kök hastalığı dahil olmak üzere dikotiledonlu bitkilerde çeşitli hastalıklara neden olan bir bakteri cinsidir. Bu iki hastalık, bakterilerin plazmidlerinde (kromozomal olmayan DNA) bulunan genler tarafından kodlanır. Bakteriyel türler Agrobacterium tumerfaciens ayılar bir tümör indükleyen plazmid Bitkilerdeki taç safra hastalığından sorumlu olan (Ti plazmid). Agrobacterium rhizogenes limanları barındıran bir başka bakteridir kök indükleyici plazmid (Ri plazmid) bitkilerde tüylü kök hastalığından sorumludur. Ti ve Ri plazmidleri, bu bakteri cinsine özgü patojenik plazmidlerdir. Ti ve Ri plazmid arasındaki temel fark Ti plazmid taç safra hastalığına neden olan genlerle kodlanırken, Ri plazmid bitkilerde kıllı kök hastalığı genleriyle kodlanır. Bu patojenik plazmidler, DNA replikasyonu, virülans, T-DNA, opin kullanımı ve konjügasyondan sorumlu gen kümeleri içerir. Enfeksiyon sırasında, Agrobacterium plazmidin T-DNA (transfer DNA) bölgesini eksize eder ve hastalığa neden olmak için bitki genomu ile bütünleşir. Bu yetenek moleküler biyologlar tarafından genetik mühendisliğindeki bitkilere önemli genleri tanıtmak için kullanılır. bundan dolayı, Agrobacterium kimerik DNA'nın farklı bitki türlerine girişi için Biyoteknoloji ve Moleküler Biyolojide önemli bir araç olarak kabul edilir..

İÇİNDEKİLER
1. Genel Bakış ve Temel Fark
2. Ti Plazmid nedir
3. Ri Plazmid nedir
4. Yan Yana Karşılaştırma - Ti vs Ri Plasmid
5. Özet

Ti Plazmid nedir?

Tümör indükleyen plazmid (Ti plazmid) tarafından barındırılan daha büyük bir plazmiddir Agrobacterium tumerfaciens çok çeşitli dikot bitkilerinde taç safra hastalığına neden olmak. Taç safra hastalığı adı, bitki hormonları auxin ve sitokininlerin aşırı üretimi nedeniyle toprak yüzeyinin üzerindeki bitkilerin tepesinde büyük tümör benzeri şişliklerin (safralar) oluşması nedeniyle kullanılır. A. tumerfaciens. T-DNA bölgesi tümör indükleyen genleri içerir. Agrobacterium tumerfaciens bitkilere hasarlı bitki dokuları yoluyla, özellikle yaralar yoluyla girer ve plazmid DNA (T-DNA) kısmını hastalığa neden olan genlerle birlikte bitki hücrelerine aktarır. Bu T-DNA daha sonra bitki hücresi genomuna entegre olur ve kopyalar. Genlerin ekspresyonu tümör oluşumuna ve hücre metabolizmasında ilişkili değişikliklere neden olur. Taç safra hastalığı yaşlı bitkilere ciddi zarar vermez. Ancak fidanlık bitkilerinin kalitesini düşürür.

Bu benzersiz enfeksiyon modu nedeniyle, A. tumerfaciens transgenik bitkilerin üretimi için genetik mühendisliğinde bir araç olarak yaygın olarak kullanılmaktadır. Tümörü indükleyen genler baskılanır ve insektisite dirençli genler ve herbisite dayanıklı genler gibi istenen genler, rekombinant DNA teknolojisi kullanılarak Ti plazmidine sokulur veya yeniden birleştirilir ve bitki yetiştirme programlarında kullanılır. T-DNA'nın enfeksiyonu üzerine transfer edildiğinde A. tumerfaciens bitkiler, bitkiler doğal olarak istenen genlerin etkilerini elde eder. Bu nedenle, T-DNA'ya sokulan herhangi bir yabancı DNA, bu bakterinin doğal enfeksiyon süreci yardımıyla bitki hücresi genomlarına entegre edilebilir.

Resim 01: Ti plazmidi A. tumerfaciens

Ri Plazmid nedir?

Kök indükleyen plazmid (Ri Plazmid) bakteri tarafından taşınan bir plazmiddir A. rhizogenes.  Ri plazmid, dikot bitkilerinde tüylü kök hastalığı olarak adlandırılan hastalıktan sorumludur. Enfeksiyonu A. rhizogenes enfeksiyon bölgesinde veya yakınında yoğun kök salgılarına neden olur. Tüylü kök indükleyici genler Ri plazmidinin T-DNA bölgesinde bulunur. Ri plazmid, Ti plazmidine benzer daha büyük bir plazmittir. A. rhizogenes ayrıca RI plazmidinin T-DNA bölgesini bitki hücrelerine aktarabilir ve hastalıklara neden olmak için bitki hücresi makinelerini kullanarak kopyalar elde etmek için bitki hücresi genomu ile entegre olabilir. Dolayısıyla, Ri plazmidleri ayrıca bitki genetik mühendisliğinde önemli vektörler olarak hizmet eder.

Ti ve Ri Plasmid arasındaki fark nedir?

Ti vs Ri Plasmid
Ti plazmid, tarafından barındırılan dairesel ve daha büyük bir plazmittir bir. tumerfaciens	Ri plazmid, tarafından barındırılan dairesel ve daha büyük bir plazmiddir bir.rhizogenes
hastalık
Ti plazmid bitkilerde taç safra hastalığı genlerini kodlar	Ri plazmid, dikot bitkilerinde tüylü kök hastalığı genlerini kodlar.

Özet - Ti vs Ri Plasmids

Ti ve Ri plazmidleri, A. tumerfaciencs ve A. rhizogenes, sırasıyla. Ti plazmid, bitkilerde taç safra hastalığına neden olan tümör indükleyici genlere sahiptir. Ri plazmid, bitkilerde tüylü kök hastalığına neden olan kök indükleyici genlere sahiptir. Bu Ti ve Ri plazmidleri arasındaki temel farktır. Bu plazmidler, plazmid DNA'larının bir kısmını konakçı genomuna doğal olarak aktarabilmeleri nedeniyle bitki genetik mühendisliğinde vektörler olarak kullanılabilir. Gen kümeleri içerirler ve yaklaşık 200 kbp boyutlarındadırlar. Her plazmid benzersiz genler içerir.

Referanslar
1. Katsunori Suzuki, Katsuyuki Tanaka, Shinji Yamamoto, Kazuya Kiyokawa, Kazuki Moriguchi ve Kazuo Yoshida. 2. “Ti ve Ri Plazmidleri.” Springer. Springer Berlin Heidelberg, 01 Ocak 1970. Web. 21 Nisan 2017
3. Zupan, J. R. ve P. Zambryski. “T-DNA'nın Agrobacterium'dan bitki hücresine aktarılması.” Bitki Fizyolojisi. ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi, Nisan 1995. Web. 22 Nisan 2017

Görünüm inceliği:
1. “Ti plasmid” Mouagip tarafından Bu vektör grafik görüntüsü Adobe Illustrator ile oluşturulmuştur. - Commons Wikimedia üzerinden kendi çalışması (CC0)