temel fark VNTR ve prob arasında VNTR, genomda bir tandem tekrarı olarak ortaya çıkan kısa bir nükleotit sekansıdır; bir prob, radyoaktif olarak etiketlenebilen yapay olarak sentezlenen kısa bir DNA veya RNA sekansıdır.
VNTR değişken sayı ardışık tekrarını ifade eder. Genomda ardışık tekrarlarda organize edilen kısa bir nükleotit sekansıdır. VNTR'ler doğal olarak genomumuzda meydana gelir. Bir sonda yapay olarak sentezlenen kısa bir DNA veya RNA dizisidir. Hem prob hem de VNTR, nükleik asitler veya kısa nükleotit sekanslarıdır. Özellikle adli çalışmalarda olmak üzere farklı moleküler biyolojik tekniklerde muazzam kullanımları vardır. VNTR ve prob bazı benzerlikler ve farklılıklar paylaşmaktadır. Bu nedenle, makale VNTR ve prob arasındaki farkı vurgulamaya çalışır..
1. Genel Bakış ve Temel Fark
2. VNTR nedir
3. Prob nedir
4. VNTR ve Prob Arasındaki Benzerlikler
5. Yan Yana Karşılaştırma - Tablo Şeklinde VNTR vs Prob
6. Özet
VNTR, genomumuzda bir tandem tekrarı olarak var olan kısa bir nükleotit dizisidir. VNTR'ler birçok kromozomda bulunur. Ayrıca, farklı kişilerin VNTR'lerinde tekrar sayısı farklı olduğundan, VNTR'ler farklı kişiler arasında uzunluklardan farklıdır. Temel olarak, ebeveynlerinden miras kalan alellerden kaynaklanmaktadır. Bu nedenle, VNTR'leri esas olarak ebeveyn tanımlamaları (kalıtım) veya kişisel amaçlar için kullanıyoruz. Benzer şekilde, bunları genetik, adli tıp, biyolojik araştırma ve DNA parmak izinde de kullanmak mümkündür. Bu nedenle, VNTR moleküler biyolojide önemli bir araçtır.
Resim 01: VNTR
Kalıtımda, VNTR verilerini iki temel ilke kullanarak analiz ederiz: kalıtım uyumu ve kimlik uyumu. Kalıtım eşleşmesi sırasında, bireyin her ebeveyninki ile eşleşen bir aleli olmalıdır. Kimlik eşleştirme sırasında, her iki VNTR aleli de genomun belirli bir yerinde bulunmalıdır.
Moleküler biyoloji bağlamında, bir sonda 100 ila 1000 baz uzunluğunda yapay olarak sentezlenmiş bir DNA veya RNA fragmanıdır. Bu probları radyoaktif olarak etiketleyebiliriz. Bu nedenle, bunları, probun dizisini tamamlayıcı olan hedef nükleotid dizilerini tespit etmede kullanıyoruz. Numuneye prob eklediğimizde, hibridizasyon tamamlayıcı sekanslar veya hedef sekanslar ile gerçekleşir ve hedef sekansları tanımlamamızı kolaylaştırır. Problar radyoaktivite taşıdığından, bunları kolayca tespit edebiliriz.
Resim 02: Prob
Adli bilimlerde, kısa tandem tekrar bölgelerinin tespiti, kısıtlama fragman uzunluğu polimorfizmleri ve DNA parmak izi gibi DNA profilleme tekniklerinde probları yaygın olarak kullanıyoruz.
VNTR, bir örnekte hedef dizileri tespit etmek için yapay olarak sentezlenen kısa bir DNA veya RNA dizisi iken, tandem tekrarları olarak organize edilen genomun bir bölgesidir. Yani, bu VNTR ve prob arasındaki temel farktır. Ayrıca, VNTR ve prob arasındaki önemli bir fark, VNTR'lerin aksine, probları radyoaktif olarak etiketleyebilmemizdir..
Dahası, VNTR'ler çoğunlukla ebeveyn tanımlamaları gerçekleştirirken sondalar, sonda sekansını tamamlayıcı olan DNA veya RNA numunelerindeki hedef nükleotit sekanslarının saptanmasına yardımcı olur. Bu nedenle, bu aynı zamanda VNTR ve prob arasında önemli bir farktır.
Aşağıdaki infografik, VNTR ve prob arasındaki fark hakkında daha fazla bilgi sunar.
VNTR ve probun yaygın kullanımı, adli çalışmalar ve DNA parmak izi gibi moleküler analiz teknikleridir. Her ikisi de değişken uzunluklardan oluşur. Bununla birlikte, VNTR ve prob arasındaki temel fark, bir VNTR'nin ardışık tekrarlarla düzenlenmiş genomun bir bölgesi olması, bir probun ise radyoaktif olarak etiketlenebilen bir DNA veya RNA fragmanı olmasıdır. Dahası, genomda VNTR'ler bulunur. Ancak, problar yapay olarak sentezlenir ve DNA veya RNA numunelerindeki probtaki sekansı tamamlayıcı olan hedef nükleotit sekanslarını saptamak için radyoaktif olarak etiketlenebilir. Bu nedenle, bu VNTR ve prob arasındaki farkın özeti.
1. “Değişken Tandem Tekrar Sayısı (VNTR) ve Bakteriyel Epidemiyolojide Uygulaması.” Bilim Uyarısı: Dergi, Buradan erişilebilir.
2. “DNA Probu.” Nature News, Nature Publishing Group, Buradan ulaşabilirsiniz.
1. “D1S80Demo” PaleWhaleGail tarafından İngilizce Wikipedia (CC BY-SA 3.0) Commons Wikimedia üzerinden
2. Commons Wikimedia üzerinden “Moleküler İşaretler” (CC BY-SA 3.0)