VNTR ve STR Arasındaki Fark

Temel Fark - VNTR vs STR
 

DNA çalışmaları, filogenetik ilişkilerin anlaşılması ve belirlenmesinde, genetik hastalıkların teşhis edilmesinde ve organizmanın genomlarının haritalanmasında büyük fayda sağlar. DNA analizi ile ilişkili çeşitli teknikler, bilinmeyen bir DNA havuzunda belirli bir genin veya bir DNA sekansının tanımlanması için kullanılır. Genetik belirteçler olarak bilinirler. Genetik belirteçler, bireyler ve türler arasındaki genetik çeşitliliği tanımlamak için moleküler biyolojide kullanılır. Değişken sayıdaki tandem tekrarı (VNTR) ve kısa tandem tekrarı (STR), bireyler arasında polimorfizm gösteren iki tip genetik markördür. Her iki tip de ardışık tekrarlar olan kodlayıcı olmayan tekrarlayan DNA'dır. Kromozomlarda baştan ayağa düzenlenmiştir. VNTR, kısa nükleotit sekansının birkaç kez tekrarlandığı genomun bir bölümüdür. STR, yüzlerce iki ila on üç nükleotitten oluşan tekrar eden birimler olarak organize edilen genom içindeki DNA'nın başka bir bölümüdür. VNTR ve STR arasındaki temel fark, tekrar eden bir sekanstaki nükleotitlerin sayısıdır. Tekrarlayan VNTR üniteleri 10 ila 100 nükleotit içerirken, tekrarlayan STR ünitesi 2 ila 13 nükleotit içerir. VNTR ve STR adli araştırmalarda yaygın olarak kullanılmaktadır.

İÇİNDEKİLER

1. Genel Bakış ve Temel Fark
2. VNTR nedir 
3. STR nedir
4. VNTR ve STR Arasındaki Benzerlikler
5. Yan Yana Karşılaştırma - Tablo Şeklinde VNTR vs STR
6. Özet

VNTR nedir?

Bir tandem tekrarı, belirli bir kromozomal lokusta kafadan kuyruğa tekrarlanan kısa bir DNA dizisidir. Tandem tekrarında başka bir dizi veya nükleotit yoktur. Genomda birkaç çeşit tandem tekrar vardır. VNTR, aralarında 10 ila 100 nükleotit içeren tekrar birimlerine sahip olan bir tandem tekrar türüdür. VNTR bir tür mini uydudır. Bu tandem tekrarlar birçok kromozomda bulunabilir. İnsan genomu içine serpiştirilirler ve ağırlıklı olarak kromozomların subtelomerik bölgelerinde bulunurlar.

 VNTR'ler bireyler arasında art arda tekrarlanan polimorfizmi gösterir. Kromozomun belirli bir lokasyonundaki VNTR'nin uzunluğu, bu DNA bölümünde düzenlenen tekrar eden birimlerin sayısındaki değişiklik nedeniyle bireyler arasında oldukça değişkendir. Bu nedenle, VNTR bireylerin tanımlanmasında güçlü bir araç olarak kullanılabilir ve VNTR analizi genetik, biyoloji araştırması, adli tıp ve DNA parmak izi gibi birçok alanda kullanılır. VNTR'ler kemik iliği nakli engraftmanını ölçmek için kullanılan ilk genetik belirteçlerdir. VNTR'ler aynı zamanda adli tıpta DNA profillemesinde kullanılan ilk polimorfik belirteçlerdi.

Şekil 01: Altı kişide VNTR varyasyonu

VNTR analizi, kısıtlama fragman uzunluğu polimorfizmi ve ardından güney hibridizasyonu ile gerçekleştirilir. Bu nedenle, nispeten büyük bir DNA örneğine ihtiyaç duyar. VNTR profil yorumu da sorunludur. Bu sınırlamalar nedeniyle, adli genetikte VNTR kullanımı sınırlandırılmıştır ve yerini STR analizi almıştır..

STR nedir?

STR, birbiri ardına düzenlenmiş iki ila on üç nükleotid tekrar biriminden oluşan oldukça tekrarlayan bir DNA kesitidir. STR, VNTR'ye benzer. Ancak VNTR'den tekrar eden bir sekanstaki nükleotitlerin sayısından ve tekrarların sayısından farklıdır. STR bir tür mikro uydu.

Tekrarlanan birimlerin kesin sayısının ölçülmesinde yer alan STR analizi. STR'ler VNT'lere benzer şekilde bireyler arasında oldukça değişkendir. STR profilleri kişiden kişiye değişir. Bu nedenle, moleküler biyolojide STR analizi, iki veya daha fazla örnekten DNA'daki spesifik lokusları karşılaştırmak için kullanılır. Bu nedenle, STR'ler moleküler biyolojide güçlü genetik belirteçler olarak kabul edilir. Yüksek derecede polimorfizm ve nispeten kısa uzunlukları nedeniyle bireylerin tanımlanması için mükemmel bir araç sağlar..

Günümüzde, STR'ler adli genetikte en sık kullanılan analiz edilen polimorfizm aracıdır. Adli vakaların çoğu STR polimorfik analizini içerir. STR lokusları genom boyunca yayılır. Adli analizde kullanılabilecek kromozomlarda bulunan binlerce STR vardır. STR analizi, VNTR analizi gibi kısıtlama uzunluğu polimorfizmini içermez. STR analizi, kısıtlama enzimleriyle DNA'yı kesmez. DNA'ya istenen bölgeleri bağlamak için spesifik problar kullanılır ve PCR tekniği kullanılarak STR uzunlukları belirlenir.

Resim 02: Örnekler arasındaki STR değişimi

VNTR ve STR Arasındaki Benzerlikler Nelerdir??

• VNTR ve STR kodlamayan DNA'dır.
• İkisi de ardışık tekrarlar.
• Her ikisi de DNA bölümünün uzunluğundaki farktan dolayı bireyler arasında polimorfizm gösterir.
• Her ikisi de DNA parmak izi basımında ve adli tıp çalışmalarında güçlü genetik belirteçler olarak kullanılır.

VNTR ve STR Arasındaki Fark Nedir??

VNTR ve STR
VNTR, tandem bir şekilde tekrarlanan kısa bir nükleotit sekansına sahip kodlayıcı olmayan tekrarlayan bir DNA'dır.	STR, art arda düzenlenmiş iki ila on üç nükleotid tekrar biriminden oluşan oldukça tekrarlayan bir DNA kesitidir..
Boyut
VNTR'ler STR'lerden büyük.	STR'ler VNTR'lerden daha küçük.
Tekrar Dizisindeki Nükleotid Sayısı
VNTR'nin tekrar eden ünitesi 10 ila 100 nükleotit içerir.	STR'in tekrarlayan ünitesi 2 ila 13 nükleotit içerir.

Özet - VNTR vs STR

VNTR ve STR moleküler biyolojide, özellikle adli genetik alanında kullanılan iki güçlü genetik markördür. VNTR bir tür mini uydu ve STR bir mikro uydudır. VNTR ve STR kodlamasız, yüksek oranda tekrarlayan DNA'dır. Bunlar ardışık tekrarlardır. VNTR ve STR'nin genel yapısı aynıdır. Bununla birlikte, tekrarlanan sekanstaki nükleotitlerin sayısı ve uzunluğu farklıdır. VNTR, 10 ila 100 nükleotitten oluşan tekrarlayan dizilere sahiptir. STR, 2 ila 13 nükleotitten oluşan tekrarlayan dizilere sahiptir. Bu VNTR ve STR arasındaki farktır.

İndir VNTR vs STR PDF Versiyonu

Bu makalenin PDF sürümünü indirebilir ve alıntı notlarına göre çevrimdışı amaçlar için kullanabilirsiniz. Lütfen PDF sürümünü buradan indirin VNTR ve STR Arasındaki Fark.

Referanslar:

1. “Adli Genetik Bilimi.” CRG - Sorumlu Genetik Konseyi. N.p., n.d. Ağ. Burada bulabilirsiniz. 10 Temmuz 2017.
2. “STR analizi.” Vikipedi. Wikimedia Foundation, 22 Mart 2017. Web. Burada bulabilirsiniz. 10 Temmuz 2017.

Görünüm inceliği:

1. “D1S80Demo” PaleWhaleGail tarafından İngilizce Wikipedia (CC BY-SA 3.0) Commons Wikimedia üzerinden