Benzonase ve DNase Arasındaki Fark

Temel Fark - Benzonase vs DNase

Nükleik asitlerin bozulması birçok moleküler biyoloji tekniği için önemlidir. Rekombinant DNA teknolojisinde, istenmeyen DNA ve RNA fragmanlarından kurtulmak için yaygın olarak kullanılır. Nükleik asit bozucu enzimlere Nükleazlar denir ve bunlar gerekli fonksiyona bağlı olarak farklı tiplerde olabilir. DNA'yı parçalayan nükleazlar DNazlar olarak bilinir, RNA'yı parçalayanlar ise RNazlar olarak bilinir. Bu enzimler çoğunlukla laboratuvar ortamında deneyler nerede içinde nitro saf DNA, RNA veya proteinleri izole etmek için moleküler testler yapılır. Benzonazlar hem DNA'yı hem de RNA'yı parçalayan bir nükleaz türüdür, DNazlar sadece DNA'yı parçalar. Bu Benzonase ve DNase arasındaki temel farktır.

İÇİNDEKİLER

1. Genel Bakış ve Temel Fark
2. Benzonaz nedir
3. DNase nedir
4. Benzonaz ve DNase Arasındaki Benzerlikler
5. Yan Yana Karşılaştırma - Tablolar Formunda Benzonase vs DNase
6. Özet

Benzonase nedir?

Benzonase genetik olarak tasarlanmış bir endonükleazdır. Serratia marcescens. Bu enzim, E. coli endüstriyel ölçekte barındırır. Benzonaz, çift sarmallı DNA, doğrusal DNA, dairesel DNA ve tek sarmallı RNA'yı parçalayabilir. Bu yüzden Benzonase ticari olarak önemlidir. Benzonaz enzimi, iki özdeş disülfür bağı ile 245 özdeş amino asit, ~ 30 kDa alt birimine sahip bir protein dimeridir. Benzonaz, nükleik asitleri 5 'ucunda ayırır ve serbest 5' uçlu fragmanlarla sonuçlanır. Benzonaz, nükleik asitleri herhangi bir sekansta klivaj edebilir, ancak GC açısından zengin bölgeleri tercih eder.

Benzonase -20'de saklanır ⁰C. Enzim aktivitesi için optimum pH'ın 8.0 - 9.2 olduğu bulunmuştur. Benzonaz'ın uygulamaları arasında, Benzonase'in bağlı nükleik asitleri ve nükleik asit kontaminantlarının rekombinant protein preparasyonlarından çıkarıldığı protein 2D jel elektroforezi için numune hazırlama yer alır. Ayrıca protein ekstraktlarının viskozitesini azaltmak ve bir hücre karışımındaki hücrelerin kümelenmesini önlemek için kullanılır.

DNase nedir?

DNaz, sadece çift sarmallı DNA'yı parçalayabilen bir nükleaz, hidrolitik enzimdir. İki ana DNaz türü vardır: DNase I ve DNase II. DNase I, 5 'serbest uçlu polinükleotidler üretmek için çift sarmallı DNA'nın yarılmasına katılır. DNase II, 3 'serbest uçlu veya çıkıntılı polinükleotit ipliklerini üretmek için çift iplikçikli DNA'nın parçalanmasında rol oynar.

DNaz I

DNaz I, 7.0 - 8.0 arasındaki optimum pH'da çalışır. Enzim aktivitesi, Ca içeren birçok iyonik kofaktöre bağlıdır.²⁺, Mg²⁺ veya Mn²⁺. Mg aktivitesi²⁺ ve Mn²⁺ DNaz I'in işlevine karar verir. Mg varlığında²⁺, DNaz I her dsDNA ipliğini bağımsız olarak ayırır. Bu rastgele bir şekilde gerçekleşir. Aksine, Mn varlığında^2+, enzim her iki DNA şeridini de yaklaşık aynı yerde ayırır. Bu bölünme iki tip DNA fragmanı üretilmesine neden olacaktır; künt uçlu bir tip ve bir veya iki nükleotit çıkıntılı başka bir tip.

Resim 02: DNaz

DNaz II

DNase II, 4.5-5.0 optimum pH değerinde çalışır ve DNase I'e benzer şekilde aktivitesi için iki değerlikli metal iyonları gereklidir. DNase II mekanizmasının üç ana adımdan oluştuğu bilinmektedir..

DNA omurgasında birden fazla tek iplik kopması indüklenir.
Asitte çözünür nükleotitler ve oligonükleotitler üretilir.
Son aşamada doğrusal olmayan hiperkromik kayma meydana gelir.

DNaz enziminin ana inhibitörleri arasında metal şelatörler, geçiş metalleri ve Sodyum dodesil sülfat ve β - merkaptoetanol gibi kimyasallar bulunur..

DNaz'ın ana uygulamaları DNA içermeyen RNA ekstraktlarının ve protein ekstraktlarının hazırlanmasını ve in vitro transkripsiyon deneyleri sırasında şablon DNA'nın çıkarılmasını içerir..

Benzonase ve DNase arasındaki benzerlikler nelerdir?

Her ikisi de hidrolitik enzimlerdir.
Her ikisi de nükleaz.
Her ikisi de nükleik asitlerin fosfodiester bağlarını parçalayarak katılır.
Her ikisi de enzimin aktivitesini korumak için optimum pH ve depolama sıcaklıkları gerektirir.
Enzimlerin inhibitörleri arasında kenetleme maddeleri, geçiş metalleri ve deterjan kimyasalları bulunur..
Uygulamalar esas olarak yüksek saflıkta DNA, RNA ve protein ekstraktları elde etmeye odaklanmıştır..
Her iki enzim de genetik mühendisliği ile üretilebilir.

Benzonase ve DNase arasındaki fark nedir?

Benzonase vs DNase
Benzonaz, çift zincirli DNA, doğrusal DNA, dairesel DNA ve RNA'yı parçalayabilen bir enzimdir.	DNaz, çift sarmallı DNA'yı parçalayabilen bir enzimdir.
Enzim Substratı
Hem DNA hem de RNA benzonaz için substratlardır.	DNA, DNase için substrattır.
yapı
Benzonaz'ın optimum pH aralığı 7.0 -8.0'dır	DNase I'in optimum pH aralıkları 7.0 - 8.0 ve DNase II 4.5 - 5.0.

Özet - Benzonase vs DNase

Nükleaz enzimleri moleküler biyoloji ve genetik mühendisliği açısından farklı deneysel prosedürlerde yaygın olarak kullanılmaktadır. Benzonaz ve DNaz iki tip nükleazdır. Benzonaz, hem DNA'nın hem de RNA'nın parçalanmasında rol oynarken DNase, çift zincirli DNA'nın yarılmasında rol oynar. Bu, benzonaz ve DNaz arasındaki temel farktır. Şu anda, bu nükleaz türlerinin her ikisi de maksimum üretim için optimize edilmiş daha yüksek kaliteli enzimler veren rekombinant DNA teknolojisi ile üretilmektedir..

Benzonase vs DNase PDF Versiyonunu İndir

Bu makalenin PDF sürümünü indirebilir ve alıntı notuna göre çevrimdışı amaçlar için kullanabilirsiniz. Lütfen PDF sürümünü buradan indirin Benzonase ve DNase Arasındaki Fark

Referanslar:

1. “Sığır pankreas D5025'ten deoksiribonükleaz I.” Sigma-Aldrich, Buradan ulaşılabilir. Erişim tarihi: 19 Eylül 2017.
2. “Deoksiribonükleaz II.” Deoksiribonükleaz II - Worthington Enzim Kılavuzu, Burada bulunabilir. Erişim tarihi: 19 Eylül 2017.

Görünüm inceliği:

1. ”DNA aşırı duyarlı bölge” Wang Y-M, Zhou P, Wang L-Y, Li Z-H, Zhang Y-N, et al. - Wang Y-M, Zhou P, Wang L-Y, Li Z-H, Zhang Y-N, et al. (2012) HeLa S3 Hücrelerinde DNaz I Aşırı Duyarlı Yer Dağılımı ile Gen Ekspresyonu Arasındaki Korelasyon. PLOS ONE 7 (8): e42414. doi: 10.1371 / journal.pone.0042414 (CC BY-SA 2.5) Commons Wikimedia üzerinden

Bilim ve Doğa