Yatay ve Dikey Jel Elektroforezi Arasındaki Fark

Temel Fark - Yatay ve Dikey Jel Elektroforezi
 

Jel elektroforezi, DNA, RNA ve diğer proteinleri içeren karışımları ilgili yüklerine ve moleküler boyutlarına göre ayırmak için genetikte kullanılan bir laboratuvar tekniğidir. Bu yöntemde ayrılması gereken DNA, RNA veya proteinler, küçük gözenekler içeren bir jelden geçirilir. Moleküller bir elektrik alanı ile jelden geçirilir. Moleküller jelin gözeneklerinden geçer ve hareketin hızı, ilgili uzunlukları ile ters orantılıdır. Bu nedenle, daha düşük moleküler boyuta sahip moleküller, daha yüksek moleküler ağırlığa sahip moleküllerden daha hızlı hareket edecektir. Elektrik alanı, jelin iki ucundaki yük farkı ile üretilir. Bir uç pozitif yük, diğer uç negatif yük içerir. DNA ve RNA molekülleri negatif yüklü olduğundan, jelin pozitif yüklü ucuna doğru çekilirler. Jel elektroforezi iki farklı yöntem olabilir: yatay jel elektroforezi ve dikey jel elektroforezi. Yatay jel elektroforezinde, jel yatay bir yönde bulunur ve jel kutusunun içinde bulunan sürekli bir çalışma tamponuna batırılır. Dikey jel elektroforezinde, tampon sistemi dikey olarak yönlendirilir ve sırasıyla bir katot ve bir anot ile üstte ve altta bulunan iki bölme ile süreksizdir. Bu yatay ve dikey jel elektroforezi arasındaki temel farktır.

İÇİNDEKİLER

1. Genel Bakış ve Temel Fark
2. Yatay Jel Elektroforezi Nedir
3. Dikey Jel Elektroforezi Nedir
4. Yatay ve Dikey Jel Elektroforezi Arasındaki Benzerlikler
5. Yan Yana Karşılaştırma - Tablo Şeklinde Yatay ve Dikey Jel Elektroforezi
6. Özet

Yatay Jel Elektroforezi Nedir?

Yatay jel elektroforezi, DNA, RNA veya protein moleküllerinin ilgili moleküler boyutlarına ve yüklerine göre ayrılması için temel teoriyi kullanır. Bu teknikte, jel yatay bir yönde bulunur ve sürekli bir tampon içine batırılır. Agaroz jel, jel kutusunu iki bölmeye ayırmak için kullanılır. Jel kutusunun bir ucunda bir anot bulunurken diğer ucunda bir katot bulunur. Bir akım uygulandığında, bu teknikte kullanılan tampon bir yük gradyanı oluşturulmasına izin verir. Yük uygulandığında, jel ısınma eğilimindedir. Tampon ayrıca sıcaklığı optimum seviyelerde tutan bir soğutucu olarak da işlev görür. Çalışan tamponun devridaimi, bir pH gradyanının oluşumunu önler. Kesikli bir tampon sistemi yatay jel elektroforezinde kullanılamaz, çünkü jel sisteminin iki bölmesi çalışan tamponla bağlanır. Akrilamid, protein karışımlarını ayırmak için jel elektroforezi sırasında kullanılır.

Resim 01: Yatay Jel Elektroforezi

Yatay jel elektroforezinde, jel kutusu oksijene maruz kaldığı için akrilamid kullanılamaz. Oksijenin varlığı nedeniyle, akrilamidin polimerizasyonu inhibe edilir ve bu, jelin oluşumuna müdahale eder. Yatay jel elektroforezi, DNA ve RNA'nın ayrılmasında kullanılan zahmetsiz bir yöntemdir.

Dikey Jel Elektroforezi Nedir?

Dikey jel elektroforez tekniği, jel elektroforezinin birincil teorisine göre işlev görür, ancak yatay jel elektroforez yönteminden daha karmaşık olduğu düşünülmektedir. Bu teknikte süreksiz bir tampon kullanılır. Üst bölmede bir katot bulunur ve anot alt bölmede bulunur. Her bölmede bulunan elektrotlar gerekli elektrik alanını sağlar. Monte edilmiş iki cam plaka arasına ince bir jel tabakası dökülür. Bu nedenle, jelin üst kısmı üst odaya daldırılır ve jelin alt kısmı alttaki odaya daldırılır. Akım uygulandıktan sonra, tamponun küçük bir kısmı jel yoluyla üst odadan alt odaya hareket eder. Bu teknikte uygulanan akım dakika birimleridir.

Resim 02: Dikey Jel Elektroforezi

Dikey jel elektroforezinde tampon sadece jelden akar. Bu, ayırma aşaması sırasında voltaj gradyanının doğru kontrol edilmesini sağlar. Akrilamid jel kullanılabilir, çünkü bölmeler atmosferik oksijene maruz kalmaz. Akrilamid jelin daha küçük gözenek boyutu nedeniyle, daha yüksek bir çözünürlükle hassas ayırma elde edilebilir.

Yatay ve Dikey Jel Elektroforezi Arasındaki Benzerlikler Nelerdir??

• Her iki sistem de jel elektroforezinin temel teorisine göre çalışır.
• Her iki sistemde de gerekli elektrik alanını sağlamak için anot ve katot kullanılır.

Yatay ve Dikey Jel Elektroforezi Arasındaki Fark Nedir??

Yatay ve Dikey Jel Elektroforezi
Yatay Jel Elektroforezi, jelin yatay bir yönde bulunduğu bir jel elektroforez tekniğidir.	Dikey Jel Elektroforezi, jelin dikey olarak yönlendirildiği bir jel elektroforez tekniğidir.
Tampon
Yatay jel elektroforezi sürekli bir tampondan oluşur.	Çalışan jel, dikey jel elektroforezinde süreksizdir.
Akrilamid Kullanımı
Akrilamid, jel kutusu atmosferik oksijene maruz kaldığı için yatay jel elektroforezi için kullanılamaz.	Jel, iki ayrı odadan dolayı atmosferik oksijene maruz kalmadığından, dikey jel elektroforezi için akrilamid kullanılabilir.
fonksiyon
Yatay jel elektroforezi daha çok DNA ve RNA karışımlarının ayrılması için kullanılır, ancak proteinler için kullanılmaz.	Dikey jel elektroforezi, protein karışımlarını ayırmak için kullanılır.

Özet - Yatay - Dikey Jel Elektroforezi

Jel elektroforezi, DNA, RNA ve protein molekülleri içeren karışımların ayrılmasında yaygın olarak kullanılan laboratuvar tekniğidir. Jel elektroforezinin iki yöntemi vardır: yatay ve dikey jel elektroforezi. Yatay jel elektroforezinde, çalışan tampon dikey jel elektroforezinde süreklidir, süreksizdir. Bu, yatay ve dikey jel elektroforezi arasındaki farktır. Her iki sistem de jel elektroforezinin ortak prensibine göre çalışır.

Yatay ve Dikey Jel Elektroforezinin PDF Versiyonunu İndirin

Bu makalenin PDF sürümünü indirebilir ve alıntı notuna göre çevrimdışı amaçlar için kullanabilirsiniz. Lütfen PDF sürümünü buradan indirin Yatay ve Dikey Jel Elektroforezi Arasındaki Fark.

Referanslar:

1.Warren, Chad M., vd. “Yüksek Moleküler Ağırlıklı proteinlerin dikey agaroz jel elektroforezi ve elektroblotlanması.” Elektroforez, cilt. 24, hayır. 11, 2003, s. 1695-1702., Doi: 10.1002 / elps.200305392.
2. “Yatay ve Dikey Jel Sistemleri - Yatay Jel Sistemi.” Ulusal Teşhis, Buradan erişilebilir. Erişim tarihi: 28 Ağu 2017.

Görünüm inceliği:

1. “Jel elektroforez cihazı” Jeffrey M. Vinocur tarafından - Commons Wikimedia üzerinden kendi çalışması (CC BY 2.5)
2. “Proteinlerin Poliakrilamid jel elektroforezi” Bruxelles, Belçika'dan Jean-Etienne Minh-Duy Poirrier tarafından - Commons Wikimedia aracılığıyla 1D jel elektroforezinde (CC BY-SA 2.0) proteinler