Organizmalar kromozomal DNA'ya ve kromozom dışı DNA'ya sahiptir. Kromozomal DNA, kalıtım bilgisini içeren genetik materyalin büyük bir kısmını oluşturur. Kromozom dışı DNA organizmalar için de önemlidir; prokaryotlarda ekstrakromozomal DNA, antibiyotik direnci, çeşitli ağır metallere direnç ve makromolekül parçalanması gibi özel genlere sahiptir. Plazmid ve epizom, organizmaların iki tür kromozom dışı DNA'sıdır. Plazmidler kapalı, dairesel ve çift zincirli bakterilerin DNA'sıdır. Epizom, organizmaların sahip olduğu nispeten daha büyük bir kromozom dışı DNA türüdür. Plazmid ve epizom arasındaki temel fark, plazmidler bakteriyel kromozomal DNA ile entegre olamaz süre epizomlar kromozomal DNA ile bütünleşebilir.
İÇİNDEKİLER
1. Genel Bakış ve Temel Fark
2. Plazmid nedir
3. Epizom nedir
4. Yan Yana Karşılaştırma - Plasmid vs Episome
5. Özet
Plazmid, küçük dairesel bir çift sarmallı DNA'dır. Bakteriler, ekstra kromozomal materyalleri olarak plazmidleri içerir. Plazmidler, kromozomlarla bağlantı kurmadan kendi kendini kopyalama özelliğine sahiptir. Kendi kopyaları ve bakımları için gerekli olan genleri veya bilgileri taşırlar. Dolayısıyla bağımsız DNA olarak kabul edilirler.
Plazmidlerin boyutu çok küçüktür. Bakterilerin içinde kapalı daireler olarak bulunurlar. Plazmidler esansiyel bakteri genlerini içerir. Bu genler, antibiyotik direnci, makromoleküllerin bozulması, ağır metal toleransı ve bakteriyosin üretimi gibi bakteriler için yararlı olan özel özellikleri kodlar..
Plazmidler Moleküler biyolojide vektörler olarak muazzam bir kullanıma sahiptir. DNA'nın çift sarmallı doğası, antibiyotik direnç genleri, kendini kopyalama yeteneği ve özel kısıtlama bölgeleri, plazmidleri rekombinant DNA teknolojisinde vektör molekülleri olarak daha uygun hale getiren önemli özelliklerdir. Plazmidlerin izole edilmesi ve konakçı bakterilere dönüşmesi kolaydır.
Resim 01: Plazmidler
Epizom, bir süre bağımsız bir DNA olarak ve başka bir zaman organizmanın genomik DNA'sına entegre bir form olarak bulunabilen kromozom dışı bir genetik materyal parçasıdır. Epizomlar esansiyel olmayan genetik elemanlar olarak kabul edilir. Çoğunlukla konakçının dışında bir virüs veya başka bir bakteriden kaynaklanırlar. Konakçı organizmaya girebilir ve kromozom dışı DNA olarak var olabilir ve daha sonra genomik DNA ile bütünleşebilir ve çoğaltabilir. Entegre olmayan birimler olarak var olurlarsa, konakçı hücre tarafından tahrip olurlar. Entegre olursa, epizomların yeni kopyaları üretilecek ve yavru hücrelere de aktarılacaktır..
Epizomlar, daha büyük boyutlarından dolayı plazmidlerden ayırt edilebilir. Bazı örnekler arasında sokma sekansları, bakteri F faktörü ve bazı virüsler bulunur.
Resim 02: Epizomlar
Plazmid ve Epizom | |
Plazmid, bakterilerin küçük, dairesel, çift zincirli bir kromozom dışı DNA molekülüdür. | Epizom, plazmidlerden daha büyük bir tür kromozom dışı DNA'dır. |
Kendi kendini çoğaltma yeteneği | |
Kendini çoğaltma için gerekli bilgileri içerir. | Kendini çoğaltma için bilgi içermiyor. |
Kromozomal DNA ile bağlantı | |
Bakterilerin kromozomal DNA'sı ile bağlantı kuramazlar. | Kromozomal DNA ile entegre edilebilirler. |
Özel Gen Kodlaması | |
Plazmidlerde bulunan bazı genler, antibiyotik direnci, ağır metal toleransı vb.Gibi bakterilere özel özellikler sağlar.. | Epizomlar özel genler içermez. F plazmid sadece F faktörü DNA içerir. |
Vektör Olarak Kullan | |
Plazmidler vektör olarak kullanılır. | Epizomlar vektör olarak kullanılmaz. |
Epizom ve plazmid, bakterilerin kromozom dışı DNA'sı olarak işlev görür. Plazmidler, antibiyotik direnci vb. Gibi özel özelliklere sahip, kendi kendini kopyalayan küçük dairesel DNA molekülleridir. Plazmidler, rekombinant DNA teknolojisinde vektörler olarak kullanılır. Plazmidler bakteri kromozomuna entegre olamaz. Epizom, bakterilerin başka bir kromozom dışı DNA türüdür. Çoğaltma sırasında bakteri kromozomlarına entegre edilebilir ve yavru hücrelere geçebilirler. Plazmidlerin daha fazla baz çifti içerdiklerinden daha büyüktürler. Bu, plazmidler ve epizomlar arasındaki farktır.
Referanslar:
1. Abbas, Wasim. “Epızomlar.” Dna, Kromozom, Genetik ve Konak - JRank Makaleleri. N.p., n.d. Ağ. 08 Nisan 2017
2. Couturier, M., F. Bex, P.L. Bergquist ve W.K. Maas. “Bakteriyel plazmidlerin tanımlanması ve sınıflandırılması.” Mikrobiyolojik İncelemeler. ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi, Eylül 1988. Web. 08 Nisan 2017
3. Bennett, P. M. “Plazmid kodlanmış antibiyotik direnci: bakterilerde antibiyotik direnç genlerinin elde edilmesi ve aktarılması.” İngiliz Farmakoloji Dergisi. Nature Publishing Group, Mart 2008. Web. 08 Nisan 2017