Bakteriler kromozomal ve kromozomal olmayan DNA içerir. Kromozomal DNA, bakterilerin büyümesinde önemli bir rol oynar. Kromozomal olmayan DNA, bakteriyel hayatta kalma için gerekli genleri kodlamaz. Bir plazmid bir tür prokaryotik kromozomal olmayan DNA'dır. Bakterilere ek genetik avantajlar sağlayan küçük, dairesel çift zincirli DNA'dır. Transpozon, genom içindeki yeni pozisyonlara hareket edebilen bir DNA dizisidir. Bakterilerin hareketli genetik materyali olarak da bilinirler. Plazmid ve transpozon arasındaki temel fark, plazmid, bakteri içinde bağımsız olarak replike olan kromozomal olmayan bir DNA'dır süre transpozon, bakteri genomu içinde yer değiştiren ve kromozomun genetik dizisini değiştiren bir kromozomal DNA segmentidir.
İÇİNDEKİLER
1. Genel Bakış ve Temel Fark
2. Plazmid nedir
3. Transpozon nedir
4. Yan Yana Karşılaştırma - Plazmid vs Transpozon
5. Özet
Plazmid, prokaryotların kromozom dışı bir DNA'sıdır. Bakteri kromozomundan bağımsız olarak çoğaltabilir. Bir bakteri içinde birkaç plazmid olabilir. Plazmidler kapalı dairesel DNA parçalarıdır ve küçük boyutludurlar. Plazmid DNA, bakterinin hayatta kalması için gerekli olmayan birkaç gen taşır. Bununla birlikte, plazmidlerdeki bu genler, antibiyotik direnci, herbisit direnci, ağır metal toleransı, vb. Gibi bakterilere ek genetik avantajlar sağlar. F faktörü plazmidleri adı verilen özel plazmidler, cinsel üreme yöntemi olan bakteriyel konjugasyonda yer alır..
Plazmidler rekombinant DNA teknolojisi ve gen klonlamasında vektörler olarak kullanılır. Plazmidler, genetik mühendisliğinde rekombinant vektörler olarak kullanılmasını uygun hale getiren özel özelliklere sahiptir. Çoğaltma kaynağı, seçilebilir marker genleri, çift sarmallı doğa, küçük boyutlu ve çoklu klonlama bölgeleri içerirler. Araştırmacılar plazmid DNA'yı kolayca açabilir ve rekombinant DNA yapmak için istenen DNA fragmanlarını veya genleri plazmidlere ekleyebilir. Ek olarak, rekombinant plazmidin konakçı bakteriye dönüşümü diğer vektörlerden daha kolaydır.
Resim 01: Plazmidler
Bir transpozon, bakteriyel genom içinde translokasyon yapabilen bir DNA fragmanı veya dizisidir. Bunlar hareketli DNA dizileridir. Genomun yeni yerlerine taşınırlar. Bu hareketler bakteriyel genom dizisinde değişiklikler yaparak genetik bilgide önemli değişikliklere neden olur. Bakterilerde yeni genetik sekanslar oluşturmaktan sorumlu olan transposable genetik elementlerdir. Transpozonlar ilk olarak Barbara McClintock tarafından 1940'larda mısır ile yapılan deneylerle keşfedildi ve çalışması için Nobel Ödülü'ne layık görüldü..
Transpozonlara bazen atlama genleri denir, çünkü bu atlama dizileri genlerin transkripsiyonunu bloke edebilir ve bakterinin genetik materyalini yeniden düzenleyebilir. Ayrıca ilaç direncinin, plazmidler ve kromozomlar arasındaki antibiyotik direnç genlerinin hareketinden sorumludurlar..
Var iki tip transpozon taşımak ve yerleştirmek için kullandıkları mekanizmaya göre. Onlar sınıf I transpozon (retrotranspozonlar) ve sınıf II transpozon (DNA transpozonları). Sınıf I transpozonlarda 'kopyala ve yapıştır' mekanizması kullanılırken, Sınıf II transpozonlarda 'kes ve yapıştır mekanizması' kullanılır.
Transpozon bir plazmidden kromozoma veya iki plazmid arasında hareket edebilir. Bu hareketlerden dolayı, genler bakteri türleri arasında karıştırılır. Bu nedenle, transpozonlar genetik dizileri organizmalara ayırmak ve entegre etmek için genetik mühendisliğinde vektörler olarak kullanılır..
Resim 02: Bakteriyel DNA transpozonu
Plazmid ve Transpozon | |
Plazmid, bakterilerin küçük dairesel çift sarmallı kromozomal olmayan bir DNA'sıdır. | Transpozon, genom içinde yeni yerlere hareket edebilen bir DNA segmentidir.. |
Kendinden Çoğaltma | |
Plazmidler kromozomal DNA'dan bağımsız olarak replike olabilir. | Transpozonlar bağımsız olarak çoğalamaz. |
Kodlanmış Özel Özellikler | |
Plazmidler antibiyotik direnci ve virülans gibi çeşitli özellikler sağlar. | Transpozonlar özel özellikleri kodlamaz. |
Vektör Olarak Kullan | |
Plazmidler, rekombinant DNA yapmak için genetik mühendisliğinde vektörler olarak kullanılır. | Transpozonlar, insersiyonel mutajenez için genetik mühendisliğinde vektörler olarak da kullanılır. |
Sekanstaki Mutasyonlar ve Değişiklikler | |
Plazmidler önemli mutasyonlara neden olamaz ve genom dizisini ve boyutunu değiştiremez. | Transpozisyon önemli mutasyonlar oluşturabilir ve genom dizisini ve boyutunu değiştirebilir. |
Plazmid, bakterilerde yaygın olarak bulunan kromozom dışı bir DNA'dır. Bakteriyel kromozomal DNA'dan bağımsız olarak çoğalma yeteneğine sahiptir. Plazmidler bakterilere genetik avantajlar katan genler içerir. Bununla birlikte, plazmid DNA, bakterilerin hayatta kalması için gerekli değildir. Transpozonlar, bir yerden genom içinde yeni bir yere atlayan mobil genetik elementlerdir. Mutasyonlara neden olabilir ve genomun boyutunu ve sırasını değiştirebilirler. Bu, plazmid ve transpozon arasındaki farktır.
Referans:
1. Griffiths, Anthony JF. “Prokaryotik transpozonlar.” Genetik Analize Giriş. 7. baskı. ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi, 01 Ocak 1970. Web. 26 Nisan 2017
2. “Epizomlar, Plazmidler, Ekleme Dizileri ve Transpozonlar.” Mikrobiyoloji ve İmmünoloji Dünyası. Ansiklopedi.com, n.d. Ağ. 27 Nisan 2017
Görünüm inceliği:
1. “Plazmid (türkçe)” Kullanıcı: Spaully on English wikipedia - Commons Wikimedia üzerinden kendi çalışması (CC BY-SA 2.5)
2. “Kompozit transpozon” Jacek FH tarafından hazırlanmıştır - Image: Composite transposon.jpg (CC BY-SA 3.0) Commons Wikimedia üzerinden yapılmıştır.