Prob ve Primer Arasındaki Fark

Temel Fark - Prob ve Primer
 

Moleküler prob, DNA veya RNA'daki tamamlayıcı sekansları tanıyan ve hedef sekansın tanımlanmasına izin veren küçük bir DNA veya RNA fragmanıdır. Primer, DNA sentezi için bir başlangıç ​​noktası görevi gören küçük bir DNA veya RNA esnemesidir. Primerler ve problar, şablon DNA'nın veya hedef DNA'nın tamamlayıcı nükleotitleri ile hibridize olur. Bununla birlikte, prob ve primer arasındaki temel fark DNA replikasyonu için primerler, numune DNA'sındaki spesifik sekansların saptanması için problar gereklidir.

İÇİNDEKİLER
1. Genel Bakış ve Temel Fark
2. Prob nedir
3. Astar nedir
4. Yan Yana Karşılaştırma - Probe vs Primer
5. Özet

Prob nedir?

Prob, numunedeki hedef DNA veya RNA'yı moleküler hibridizasyon yoluyla tespit etmek için kullanılan küçük bir DNA veya RNA fragmanıdır. Onlar olarak da bilinir moleküler belirteçler. Probun uzunluğu değişebilir (100 ila 1000 baz) ve prob nükleotitleri, hedef sekansın bir kısmını tamamlar. Tespit kolaylığı için problar radyoaktif izotoplarla veya floresan boyalar veya antikorlarla etiketlenir. Problar, hedef sekansın tamamlayıcı bazlarına bağlanır ve numunedeki hedef DNA veya RNA'nın varlığını ortaya çıkarır. Probları etiketlemenin iki ana yöntemi vardır: etiketleme ve nick çevirisi. Problar DNA probları, RNA probları, cDNa probları ve sentetik oligonükleotit probları dahil olmak üzere farklı tiplere ayrılır ve farklı teknikler kullanılarak hazırlanırlar.

Problar, viroloji, adli patoloji, babalık testi, DNA parmak izi, genetik hastalıkların tespiti, RFLP, moleküler sitogenetik gibi birçok mikrobiyal ve moleküler alanda önemli araçlardır., yerinde hibridizasyon vb..

Şekil 01: FISH'de patojen tespiti için kullanılan floresan etiketli prob

Astar Nedir?

Primer, DNA sentezi için bir başlatıcı görevi gören kısa bir DNA veya RNA parçasıdır. DNA polimeraz enzimi, primer sekansının 3 'OH grubuna nükleotitler ekler ve şablon DNA'yı tamamlayıcı yeni ipliği sentezler. Primerler 18 ila 20 nükleotid uzunluğunda çok kısa fragmanlardır. Laboratuvarda kimyasal olarak sentezlenirler. laboratuvar ortamında DNA amplifikasyonu (PCR). Primerler, kullanıcı tarafından tasarlandıkları için herhangi bir nükleotit sekansına sahip olabilir. Bunlar, şablon DNA'nın tamamlayıcı bazları ile eşleşecek şekilde sentezlenir. Bu nedenle, herhangi bir nükleotit sekansına sahip olabilir. DNA polimerazı önceden var olan bir DNA parçası olmadan yeni DNA sentezleyemediğinden, primerler DNA replikasyonu için son derece önemlidir. PCR için primer tasarlarken, aşağıdaki hususların dikkate alınması gerekir:

• Primerler, yükseltmek isteyen DNA'nın yan ucuna tamamlayıcı nükleotidleri içermelidir.
• Astarların erime sıcaklığı 55 - 65 arasında olmalıdır ⁰C
• G ve C içeriği% 50 ila 60 arasında olmalıdır.

PCR'de, örnek DNA'nın her iki telini de kopyalamak için ileri ve geri olarak iki primer kullanılır. Primerler, PCR ve DNA sekanslama gerçekleştirmek için yaygın olarak kullanılır.

Resim 02: PCR'de primer tavlama

Probe ve Primer arasındaki fark nedir?

Prob ve Astar
Prob, bir örnekte moleküler hibridizasyon ile hedef sekansın varlığını tespit etmek için kullanılan küçük bir DNA / RNA fragmanıdır.	Primer, DNA replikasyonu için bir başlangıç ​​noktası görevi gören küçük bir DNA veya RNA esnemesidir..
fonksiyon
Bu, DNA veya RNA örneğinde spesifik bir sekansın varlığını tespit eder.	Bu DNA sentezi için bir başlangıç ​​noktası görevi görür.
uzunluk
Uzunluk 100-1000 baz aralığında olabilir	Uzunluk genellikle yaklaşık 18-20 bazdır
Tamamlayıcı Sıra ile Bağlama
Prob, hedef sekansın tamamlayıcı bazları ile melezleşir	Primer, DNA zincirlerinin tamamlayıcı bazları ile tavlanır.
etiketleme
Problar tespit kolaylığı için etiketlenmiştir	Astarlar genellikle etiketlenmez
PCR'de kullanım
Problar PCR'de kullanılmaz	Primerler PCR'de kullanılır

Özet - Probe vs Primer

Prob, numunedeki bir hedef sekansı tespit etmek için tamamlayıcı nükleotitlerle hibritlenebilen küçük bir DNA veya RNA sekansı fragmanıdır. Problar, hedef sekansın varlığını görmek için radyoaktif, immünolojik veya floresan olarak etiketlenir. Primer, başlangıç ​​noktası olarak hareket eden çok küçük bir DNA veya RNA parçasıdır. laboratuvar ortamında DNA amplifikasyonu. DNA polimeraz, 3 'OH grubu primerini tanımlar ve kalıba tamamlayıcı yeni bir ipin yapımını başlatır. Problar ve primerler, tamamlayıcı nükleotitlerle hibridize edilerek benzer şekilde çalışır. Bu nedenle, prob ve primer arasındaki temel fark onların temel fonksiyonudur..

Referans:
1. ”Astar (moleküler biyoloji).” Vikipedi. Wikimedia Foundation, 02 Şubat 2017. Web. 01 Mart 2017.
2. ”Hibridizasyon probu.” Vikipedi. Wikimedia Foundation, 30 Aralık 2016. Web. 01 Mart 2017
3. ”Astar (moleküler biyoloji).” Primer (moleküler biyoloji) - ScienceDirect Konular. N.p., n.d. Ağ. 01 Mart 2017

Görünüm inceliği:
1. “Bakteriyel Patojen Tanımlaması için BALIK” Pepetps Togopiç Ivan Akira Magnus ManskeTimothy W. Ford - (CC BY-SA 3.0) Commons Wikimedia üzerinden
2. “Primers RevComp Melted2” Richard Wheeler (Zephyris) tarafından - Commons Wikimedia üzerinden kendi çalışması (CC BY-SA 3.0)