Proteomik ve Metabolomik Arasındaki Fark

temel fark proteomik ve metabolomikler arasında proteomik bir organizmanın tüm proteinlerinin incelenmesidir, metabolomikler ise bir organizmanın tüm metabolitlerinin incelenmesidir.

Genomik, bir organizmanın genetik yapısının araştırılmasıdır. Proteomik ve metabolomikler, genomik ile ilgili iki omik bilimdir. Proteom, bir hücre veya organizmadaki tüm proteinleri ifade eder. Öte yandan metabolom, bir organizmanın tüm metabolitlerini ifade eder. Bu nedenle, proteom çalışması proteomik, metabolom çalışması metabolomiktir. Hem proteomik hem de metabolomikler hastalık teşhisinde ve organizmaların karakterizasyonu ve taranmasında önemlidir. Dahası, her ikisi de hücre biyolojisinin birçok yönünde, özellikle hücre sinyali, protein yıkımı ve üretimi ve translasyon sonrası modifikasyonda birbirine bağlıdır..

İÇİNDEKİLER

1. Genel Bakış ve Temel Fark
2. Proteomik nedir
3. Metabolomik nedir
4. Proteomik ve Metabolomik Arasındaki Benzerlikler
5. Yan Yana Karşılaştırma - Tablo Şeklinde Proteomik ve Metabolomikler
6. Özet

Proteomik Nedir?

Proteom, bir hücre, doku veya organizmadaki toplam protein tamamlayıcısıdır. Bu nedenle proteomik, bir organizmanın proteomunun incelenmesidir. Proteomikte proteinlerin farklı özellikleri analiz edilir. Bu nedenle proteomik esas olarak proteinlerin yapısı, yönelimi, fonksiyonları, protein etkileşimleri, modifikasyonları, uygulamaları ve önemine odaklanır. Bu nedenle günümüzde proteomik alanında birçok araştırma projesi yürütülmektedir..

İlk proteomik çalışmalar Escherichia coli'deki protein içeriğini tanımlamak için yapıldı. Toplam protein içeriğinin haritalanması iki boyutlu (2D) jeller kullanılarak yapıldı. Bu projenin başarısından sonra, bilim adamları kobay ve fare gibi hayvanlardaki toplam protein içeriğini karakterize etmeye devam ettiler. Günümüzde, insan protein haritalaması 2D jel elektroforezi kullanılarak yapılır.

Proteminlerin incelenmesinin birçok avantajı vardır, çünkü proteinler, proteinlerin katalizör özelliklerinden dolayı çoğu aktivitenin yöneten molekülleridir. Böylece, tüm proteinlerin incelenmesi bir organizmanın sağlık durumu hakkında bilgi sağlayabilir. Ayrıca, proteomik, genom açıklaması, hastalık tanımlama ve teşhis, deney sırasında protein ekspresyon çalışmaları yürütme ve protein modifikasyonları ve etkileşim çalışmaları vb..

Resim 01: Proteomik

Proteomik ile ilgili, toplam proteinin ekstraksiyonu, bunların 2D jel elektroforezi kullanılarak ayrılması, ekstrakte edilen proteinlerin Edmund'un sekanslama yöntemi veya kütle spektrometrisi gibi yöntemler kullanılarak sekanslanması ve proteinin yapısal ve fonksiyonel özelliklerinin analizi dahil olmak üzere farklı teknikler vardır. bilgisayar tabanlı yazılım ve biyoinformatik araçları.

Metabolomik nedir?

Metabolomik, bir hücre, doku veya organizmadaki tüm metabolitlerin incelenmesidir. Farklı gelişmiş analitik ve istatistiksel araçlar kullanılarak hücresel metabolitlerin tanımlanmasını ve miktarını içerir. Metabolomik, bir organizmanın metabolizması ile ilgili bilgileri ortaya çıkardığı için önemli bir çalışmadır..

Resim 02: Metabolomikler

Metabolik reaksiyonların substratlarını ve ürünlerini incelemek için metabolomikler, analitik bir platform olarak kütle spektrometrisini kullanır. Kütle spektrometrisi, hücrelerin veya dokuların gerçek biyokimyasal durumunu yansıtan metabolitler ve konsantrasyonları ile sonuçlanır. Bu nedenle metabolomikler, bir organizmanın moleküler fenotipinin en iyi temsili olarak düşünülebilir. Bunlara ek olarak, metabolomikler proteomiklerin bir uzantısı olarak düşünülebilir, çünkü çoğu metabolit protein olan enzimlerin aktiviteleri nedeniyle üretilir.

Proteomik ve Metabolomikler Arasındaki Benzerlikler Nelerdir??

• Proteomik ve metabolomikler, genomik ile ilgili iki omik bilimdir.
• Metabolomikler proteomiklerin bir uzantısı olarak düşünülebilir.
• Proteom ve metabolome birçok çalışma ile yakından ilişkilidir.

Proteomik ve Metabolomik Arasındaki Fark Nedir??

Proteomik, bir hücre veya organizma içinde proteinlerin yapıları ve işlevleri dahil olmak üzere geniş çaplı bir çalışmadır. Bu arada metabolomikler, belirli bir koşullar altında bir hücre, doku veya organizmadaki metabolit profillerinin incelenmesidir. Bu nedenle, proteomik ve metabolomikler arasındaki temel fark budur. Ayrıca, proteomik esas olarak tam bir protein setini ilgilendirirken, metabolomikler temel olarak peptidler, karbonhidratlar, lipitler, nükleosidler ve ekzojen bileşiklerin katabolik ürünleri gibi çeşitli küçük moleküller dahil olmak üzere tam metabolitlerle ilgilidir. Bu nedenle, bu proteomik ve metabolomikler arasındaki bir başka fark.

Aşağıdaki infografik, proteomik ve metabolomikler arasındaki farkı özetler.

Özet - Proteomik vs Metabolomik

Canlı organizmalar genomları, proteinleri ve metabolitleri kullanılarak incelenebilir. Genomik, proteomik ve metabolomik, sırasıyla bir hücrenin veya organizmanın genetik yapısını, proteinlerini ve metabolitlerini inceleyen üç alandır. Proteomik önemlidir çünkü hem genlerin hem de çevrenin dinamik bir yansımasıdır. Metabolomikler çok önemlidir, çünkü hücrelerin biyokimyasal reaksiyonunun mevcut durumunu veya bir organizmanın metabolik durumunu doğrudan yansıtır. Böylece, bu proteomik ve metabolomikler arasındaki farkı özetler.

Referans:

1. P, Surat. “Metabolom ve Proteom İlişkisi Nedir?” Haberler, 26 Şubat 2019, Burada mevcut.
2. Horgan, Richard P ve Louise C Kenny. “SAC Review 'Omic' Teknolojileri: Genomik, Transkriptomik, Proteomik ve Metabolomik.” Kadın Hastalıkları ve Doğum, John Wiley & Sons, Ltd (10.1111), 18 Temmuz 2011, Burada mevcut.

Görünüm inceliği:

1. “Proteomik” Xxl7441 tarafından İngilizce Wikibooks - en.wikibooks'tan Commons'a transfer. (Kamusal Alan) Commons Wikimedia üzerinden
2. “Metabolomik şema” Lmaps (tartışma) ile - Bu işi tamamen kendim (CC BY-SA 3.0) Commons Wikimedia aracılığıyla yarattım