temel fark çekirdek algılama ile çekirdek söndürme arasında çekirdek algılama, bakteriler tarafından birbirleriyle iletişim kurmak ve hücre popülasyon yoğunluklarını algılamak için kullanılan bir gen ekspresyon düzenleme mekanizmasıdır. Çekirdek söndürme, çekirdek algılamasına karşı çalışan ve virülans gen ekspresyonunu durduran bir bakteri mekanizmasıdır..
Bakteriler birbirleriyle iletişim kurmak için farklı mekanizmalar kullanırlar. Bu iletişim mekanizmaları nüfus yoğunluklarını hissetmelerine ve fizyolojik süreçlerinin çoğunu düzenlemelerine yardımcı olur. Çekirdek algılama, bakteriler tarafından yoğun olarak kullanılan bu tür bir mekanizmadır. Yetersayı algılama, sadece iletişimi kolaylaştırır ve nüfus yoğunluğunu algılamakla kalmaz, aynı zamanda bakterilerin insan gibi diğer konakçılara karşı patojenitesini korumada da büyük rol oynar. Ancak, çekirdek algılama mekanizmaları bakteriyel enfeksiyonların kontrolünde sorunludur. Bir çözüm olarak, çekirdek söndürme kullanılabilir. Çekirdek söndürme, bakterilerin çekirdek algılamasını engeller ve patojenik genlerin ifadesini kapatır.
1. Genel Bakış ve Temel Fark
2. Çekirdek Algılama nedir
3. Çekirdek Söndürme Nedir
4. Çekirdek Algılama ve Çekirdek Söndürme Arasındaki Benzerlikler
5. Yan Yana Karşılaştırma - Quorum Sensing vs Quorum Quenching Tabular Formunda
6. Özet
Çekirdek algılama, bakteriler tarafından kullanılan bir gen düzenleme mekanizmasıdır. Bu mekanizmayı bakteriyel hücrelerle iletişim kurmak ve kendi popülasyon yoğunluklarını algılamak için kullanırlar. Nüfus yoğunluğunu algılamak için otoindüktörler olarak bilinen küçük moleküller üretir ve salgılarlar. Bu yöntemi kullanarak, virülans genlerinin ekspresyonunu düzenlerler. Ayrıca, otomatik indüktörler küçük difüze edilebilir sinyal molekülleridir, özellikle N-asil-homoserin laktonlardır (AHL). Virülans genlerinin ekspresyonunu tetiklerler.
Şekil 01: Çekirdek Algılama
Yetersayı algılama, bakterilerin birçok fizyolojik aktivitesi için önemlidir. Çekirdek algılama molekülleri simbiyoz, virülans, yetkinlik, konjugasyon, antibiyotik üretimi, motilite, sporülasyon, azot fiksasyonu ve biyofilm oluşumu vb..
Ayrıca, çekirdek algılama hem gram-negatif hem de gram-pozitif bakterilerde yaygındır. Ancak, otomatik moleküller olarak farklı moleküller salgılarlar. Gram-negatif bakteriler, asillenmiş homoserin laktonlar yoluyla çekirdek algısına aracılık ederken gram-pozitif bakteriler, işlenmiş oligo-peptidler aracılığıyla aracılık eder.
Çekirdek söndürme, bakterinin çekirdek algılama mekanizmasına karşı çalışan doğal bir bakteri mekanizmasıdır. Çekirdek algılama, bakterilerin virülans genlerini ifade etmesine yardımcı olduğunda, çekirdek söndürme bunu engeller. Bu nedenle, çekirdek söndürme, patojenik bakterilerde virülans gen ifadesini kapatan bir mekanizmadır. Çekirdek söndürmede bakteriler, çekirdek algılama moleküllerini parçalamak için enzimler ve kimyasal inhibitörler üretir. Oto indüktörlerin bozulması üzerine bakteriler, çekirdek algılama kabiliyetlerini kaybeder. Bu nedenle, çekirdek söndürme bir patojenin hücre yoğunluğunu algılama ve virülan ekspresyonu tetikleme yeteneğini devre dışı bırakma veya azaltma yeteneğini bozar..
Resim 02: Çekirdek Söndürme
Çekirdek söndürme, çekirdek yöntemini çeşitli yöntemlerle durdurur. Sinyal enzimlerini inaktive eder veya sinyal moleküllerini taklit eden ve reseptörlerini bloke eden moleküller sağlar. Ayrıca, söndürme enzimleri sinyal moleküllerini bozar veya çekirdek algılama sinyallerini değiştirir.
Çekirdek söndürme doğal bir mekanizma olduğundan, mikrobiyal hastalıkları önlemek için bir yaklaşım olarak geliştirilebilir. Bakteriyel iletişim, bakteriyel enfeksiyonların önemli bir yönüdür. Bu nedenle, çekirdek söndürme bakteriyel iletişimi engellemek ve böylece bakteriyel hastalıkları önlemek için umut verici bir çözüm olacaktır. Böylece, çekirdek söndürme basitçe bir anti-virülans biçimi olarak tanımlanabilir..
Çekirdek algılama, bakterilerin birbirleriyle iletişim kurmak ve nüfus yoğunluklarını hissetmek için kullandıkları bir süreçtir. Buna karşılık, çekirdek söndürme, bakterilerin çekirdek algılamasını bozmak için kullandıkları bir süreçtir. Yani, bu çekirdek algılama ile çekirdek söndürme arasındaki temel farktır.
Ayrıca, çekirdek algılama ve çekirdek söndürme arasındaki bir diğer önemli fark, bakterilerin çekirdek algılamasında otoindüktörleri veya çekirdek algılama sinyallerini salması, bakterilerin çekirdek söndürmede enzimler ve çekirdek algılama inhibitörleri üretmesidir..
Aşağıdaki infografik, çekirdek algılama ve çekirdek söndürme arasındaki fark açısından daha fazla karşılaştırma sağlar.
Çekirdek algılama ve çekirdek söndürme, bakterilerde yer alan iki doğal mekanizmadır. Yetersayı algılama, bakteriler arasındaki iletişimi ve popülasyon yoğunluklarını algılamayı kolaylaştırır. Otoindüktör adı verilen küçük moleküller aracılığıyla oluşur. Bakteriler için önemli bir süreçtir, çünkü simbiyoz, virülans, yetkinlik, konjugasyon, antibiyotik üretimi, motilite, sporülasyon, azot fiksasyonu ve biyofilm oluşumu vb. Çekirdek algılamayı bozar ve virülans gen ekspresyonunu kapatır. Bu nedenle, bir anti-virülans mekanizmasıdır. Yani, bu çekirdek algılama ile çekirdek söndürme arasındaki farkın özeti.
1. Miller, MB ve BL Bassler. “Bakterilerde Çekirdek Algılama.” Mikrobiyoloji Yıllık İncelemesi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi, 2001, Buradan erişebilirsiniz.
2. Chen, Fang, vd. “Çekirdek Söndürme Enzimleri ve Çekirdek Algılama Bağımlı Enfeksiyonunu Engellemek için Sinyal Moleküllerinin Bozulmasında Uygulanması.” Uluslararası Moleküler Bilimler Dergisi, MDPI, 26 Ağustos 2013,.
3. Catherine ve diğ. “Çekirdek Söndürme: Doğada Rol ve Uygulanan Gelişmeler.” OUP Academic, Oxford University Press, 1 Ekim 2015, Burada mevcut.
1. “Quorum quenching” BQUB13 tarafından Cizquierdo - Commons Wikimedia üzerinden kendi çalışması (CC BY-SA 3.0)
2. “Gram Negatif Hücrenin Çekirdek Algılaması” Gluckma2 tarafından - Commons Wikimedia üzerinden kendi çalışması, (CC BY-SA 4.0)