RNASE A ve RNASE H Arasındaki Fark
Share
Temel Fark - RNASE A ve RNASE H
Ribonükleazlar, RNA'yı spesifik olarak daha küçük birimlere indirgeyen nükleazlardır. İki kategoriye ayrılabilirler; endoribonükleazlar ve ekzoribonükleazlar. Endoribonükleaz, tek sarmallı veya çift sarmallı RNA'yı parçalayabilen bir endonükleazdır. Bir RNA polinükleotid zinciri içindeki fosfodiester bağlarını ayırır. Örnekler RNase A, RNase III, RNase T1, RNase P ve RNase H'dir. Ekzoribonükleaz, RNA molekülünün 5'end veya 3'endinden terminal nükleotidleri çıkararak RNA'yı parçalayan bir eksonükleazdır. Örnekler RNase R, RNase II, RNase D ve RNase PH'dur. temel fark RNASE A ve RNASE H arasında RNase A, tek sarmallı RNA'yı özellikle küçük bileşenlere ayıran bir pankreatik ribonükleaz iken RNase H, hidrolitik mekanizma yoluyla RNA-DNA hibridindeki RNA'yı daha küçük birimlere ayıran spesifik olmayan bir enzimdir.
İÇİNDEKİLER
1. Genel Bakış ve Temel Fark
2. RNASE A nedir
3. RNASE H nedir
4. RNASE A ve RNASE H Arasındaki Benzerlikler
5. Yan Yana Karşılaştırma - Tablo Şeklinde RNASE A ve RNASE H
6. Özet
RNASE A nedir?
RNaz A, tek sarmallı RNA'nın 3 'ucunda eşlenmemiş sitozin ve urasil kalıntılarını spesifik olarak ayıran pankreatik bir ribonükleazdır. RNaz H, daha yüksek bir tuz konsantrasyonunda (0.3M veya daha yüksek NaCl konsantrasyonu) çalışır. Hidrolitik reaksiyon iki aşamadır. 2 ', 3' siklik monofosfat ara maddesi yoluyla 3 'fosforile edilmiş bir ürün oluşturur. Daha yüksek tuz konsantrasyonunda tek sarmallı RNA'ya özgü olmasına rağmen, düşük NaCl konsantrasyonunda (0.3M NaCl'den daha düşük) RNA-DNA hibridinde çift sarmallı RNA ve RNA'yı parçalayabilir..
Bruce Merrifield ilk önce bu enzimi sentezledi. RNaz A, moleküler araştırmalarda çok popüler bir enzimdir. Sığır pankreatik RNaz A, RNaz A'nın bir örneğidir. Ve laboratuvarda kullanılan en zorlu enzimlerden biridir. Bu enzimin aktivitesi için bir kofaktöre ihtiyacı yoktur. Yüksek ısıya dayanıklı bir enzimdir. RNaz A, doğru amino asit sekansının tespit edildiği ilk enzim ve üçüncü proteindir. Bu enzim 124 amino asit ve 12600da moleküler kütlesi ile çok küçüktür. Ve dört Histidin kalıntısı var (katalitik reaksiyona karışan 12 ve Onun 119).
Resim 01: RNase A
RNaz A, ham bir örnek kaynatılarak izole edilebilir. Kaynadığında, diğer tüm enzimler kalan RNaz A'yı bozar. RNaz A inanılmaz derecede stabil bir enzimdir. Bu enzim ribonükleaz inhibitör proteini, ağır metal ve üridin vanadat kompleksleri ile inhibe eder.
RNase H nedir?
RNaz H, hidrolitik reaksiyon yoluyla RNA-DNA hibridindeki RNA'yı parçalayabilen spesifik olmayan bir ribonükleaz enzimidir. RNaz H, bir RNA-DNA hibridindeki RNA'nın 3'-O-P bağını ayırır. Sonuçta 3'OH ve 5 'fosfat sonlandırılmış ürünler üretir. DNA replikasyonunda, yeni DNA zincirleri oluşturulduktan sonra RNA primerini çıkararak önemli bir rol oynar. Laboratuvar koşullarında, RNA-DNA hibridindeki RNA'yı spesifik olarak bozar, ancak DNA ve hibridize olmayan RNA'yı değil. Ve bu enzim genellikle cDNA sentezi sırasında ilk tamamlayıcı DNA zinciri oluşturulduktan sonra RNA şablonunu yok etmek için kullanılır.
Resim 02: RNase H
RNase H ayrıca nükleaz koruma analizlerinde de kullanılır. Poli A kuyruğunun mRNA'dan çıkarılmasına da dahil edilebilir. RNase H, hücrenin içindeki ve dışındaki kodlayıcı olmayan RNA'yı yok etme yeteneğine sahiptir. Metal iyonları, bu protein aktivitesi için kofaktörler olarak gereklidir. RNase H enzimini inhibe etmek için bir şelatör (EDTA) kullanılabilir.
RNASE A ve RNASE H Arasındaki Benzerlikler Nelerdir??
- Her ikisi de doğada protein.
- Her ikisi de endoribonükleazdır
- Her ikisi de RNA'yı parçalayabilir.
- Her ikisi de hidrolitik reaksiyonlar gerçekleştirir.
- Moleküler laboratuvarlar her ikisini de kullanır.
RNASE A ve RNASE H Arasındaki Fark Nedir??
RNASE A ve RNASE H | |
| RNase A, daha yüksek tuz konsantrasyonunda tek sarmallı RNA'nın eşlenmemiş sitozin ve urasil kalıntılarının 3 'ucunu spesifik olarak ayıran pankreatik bir ribonükleazdır. | RNaz H, hidrolitik reaksiyon yoluyla RNA-DNA hibridindeki RNA'yı parçalayabilen spesifik olmayan bir ribonükleaz enzimidir. |
| RNA Yarılmasının Doğası | |
| RNase A spesifik olarak tek sarmallı RNA'yı daha yüksek tuz konsantrasyonunda ayırır. | RNase H RNA-DNA hibridindeki RNA'yı ayırır. |
| Etkinlik İçin Eş Faktör Gerekliliği | |
| RNase A'nın aktivitesi için kofaktörlere ihtiyacı yoktur. | RNase H, aktivitesi için kofaktör olarak metal iyonlarına ihtiyaç duyar. |
| Protein Aktivitesinin İnhibitörleri | |
| Ribonükleaz inhibitörü proteini, ağır metal ve üridin vanadat kompleksleri RNAse A aktivitesini inhibe eder. | Bir şelatör (EDTA) RNaz H aktivitesini inhibe eder. |
| DNA Replikasyonunda RNA Primer Giderimi | |
| RNaz A, DNA replikasyonunda RNA primer giderimi için kullanılmaz. | RNase H, DNA replikasyonunda RNA primer giderimi için kullanılır |
| Tamamlayıcı DNA (C-DNA) Sentezinde DNA Şablonunun Çıkarılması | |
| RNaz A, tamamlayıcı DNA (C-DNA) sentezi sırasında RNA şablonunun çıkarılması için kullanılmaz. | RNase H, tamamlayıcı DNA (C-DNA) sentezi sırasında RNA şablonunun çıkarılması için kullanılır. |
| Oligo'ya (dt) Hibritlenmiş mRNA'da Poli-A-Kuyruğunun Çıkarılması | |
| RNaz A, oligo (dt) ile melezlenmiş mRNA'da "poli-A kuyruğunu" çıkarmak için kullanılmaz. | RNaz H, oligo (dt) ile melezlenmiş mRNA'da "poli-A kuyruğunu" çıkarmak için kullanılır |
özet - RNASE A ve RNASE H
Ribonükleazlar RNA'yı daha küçük birimlere ayırabilen nükleaz enzimleridir. Bunlar iki çeşittir; endoribonükleazlar ve ekzoribonükleazlar. Endoribonükleaz, tek sarmallı veya çift sarmallı RNA'yı parçalama yeteneğine sahip bir endonükleazdır. Ve bir RNA polinükleotid zinciri içindeki fosfodiester bağını ayırır. RNaz A ve RNaz H iki endoribonükleazdır. RNaz A, tek sarmallı RNA'nın 3 'ucundaki eşleşmemiş sitozin ve urasil kalıntılarını daha yüksek tuz konsantrasyonunda spesifik olarak ayıran pankreatik bir ribonükleazdır. RNaz H, hidrolitik reaksiyon yoluyla RNA-DNA hibridindeki RNA'yı parçalayabilen spesifik olmayan bir ribonükleaz enzimidir. Bu RNase A ve RNase H arasındaki farktır.
PDF'i indir RNASE A vs RNASE H
Bu makalenin PDF sürümünü indirebilir ve alıntı notuna göre çevrimdışı amaçlar için kullanabilirsiniz. Lütfen PDF sürümünü buradan indirin RNASE A ve RNASE H Arasındaki Fark
Referans:
1.Karuturi, Yazar Amrutha. “17 RNase A hakkındaki gerçekleri bilmeli” AG Blog, 22 Şubat 2017. Buradan ulaşabilirsiniz
2. “Ribonuclease.” Vikipedi, Wikimedia Vakfı, 5 Ocak 2018. Buradan erişebilirsiniz
Görünüm inceliği:
1.'RNase A'By Makine tarafından okunabilir yazar sağlanmamıştır. Vossman Commons Wikimedia aracılığıyla (telif hakkı taleplerine dayanarak). (CC BY-SA 2.5) aldı
2. 'RNase H fix' Makine tarafından okunabilir yazar sağlanmaz. Vossman Commons Wikimedia aracılığıyla (telif hakkı taleplerine dayanarak). (CC BY-SA 2.5) aldı
