SDS Sayfası ile Yerel Sayfa Arasındaki Fark

Temel Fark - SDS Sayfası ve Yerel Sayfa
 

SDS ve ana sayfa, Moleküler Biyolojide kullanılan iki tip poliakrilamid jel elektroforez tekniğidir. temel fark SDS Sayfası ile Native Page arasında, kullanılan poliakrilamid jelin türü. SDS'de denatüre edici bir jel kullanılır, bu nedenle moleküller moleküler ağırlıklarına göre ayrılır. Bunun aksine, Native Page sayfasında, denatüre edici olmayan jeller kullanılır.. Bu nedenle moleküller boyutlarına, yüklerine ve şekline göre ayrılır.

Poliakrilamid Jel Elektroforez (Sayfa), akrilamid monomerlerinin metilen bisakrilamid ile polimerize edilmesiyle hazırlanan bir jel kullanır. Poliakrilamid daha serttir ve agarozdan daha fazla ısıya dayanıklıdır. Poliakrilamid jeller, proteinlerin etkili bir şekilde ayrılmasını sağlayan daha küçük bir gözenek boyutuna sahiptir. SDS Sayfası ve Yerel Sayfa olmak üzere iki ana Sayfa ayarı türü vardır. SDS Sayfası veya Sodyum-Dodesil Sülfat Poliakrilamid jel elektroforezi proteinleri moleküler ağırlıklarına göre ayırır. Denatüre jelleri SDS'de kullanılır. Native Page, denatüre edici olmayan jeller kullanır ve proteinleri boyutlarına, yüklerine ve şekline göre ayırır (3D konformasyonu).

İÇİNDEKİLER

1. Genel Bakış ve Temel Fark
2. SDS Sayfası nedir
3. Yerel Sayfa Nedir
4. SDS Sayfası ile Yerel Sayfa Arasındaki Benzerlikler
5. Yan Yana Karşılaştırma - SDS Sayfası ve Yerel Sayfa ile Tablo Şeklinde
6. Özet

SDS Sayfası nedir?

SDS Page, proteinleri moleküler ağırlıklarına göre ayırmak için kullanılan en yaygın elektroforetik tekniktir. Jel, bir deterjan olan SDS (Sodyum dodesil sülfat) ilave edilerek yapılır. SDS proteinleri monomerlere dönüştürür. SDS anyonik bir deterjandır. Bu nedenle, geniş bir pH aralığında proteinlere net bir negatif yük ekler. Net negatif yük, protein molekülleri üzerine yük varyasyonu nedeniyle verildiğinde, kompleks yapılar parçalanır. Negatif yük nedeniyle, proteinler pozitif sona doğru çekilir. Böylece, moleküler ağırlığı düşük moleküller jel matrisi üzerinde daha hızlı hareket eder ve anodun yakınında gözlenirken, daha yüksek moleküler ağırlıklı proteinler kuyulara daha yakın gözlenir.

Şekil 01: SDS Sayfası

Polipeptit zincirine bağlanan SDS, nispi moleküler kütlesi ile orantılıdır. Bu nedenle, moleküler kütle SDS yoluyla da belirlenebilir. SDS Sayfa jellerinin boyanması bromofenol mavisi boyama ile yapılır. SDS sayfasının uygulamaları, nispi moleküler kütleyi tahmin etmek ve bir protein karışımındaki proteinlerin nispi bolluğunu belirlemek için kullanılabileceği daha geniş bir alana yayılmaktadır. SDS Sayfası ayrıca bir protein karışımındaki protein dağılımını belirlemek için de kullanılabilir. SDS Sayfası proteinleri saflaştırmak ve değerlendirmek için de uygulanır. Batı lekeleme ve hibridizasyon için bir ön prosedür olarak kullanılır, bu da protein haritalama ve tanımlama için kullanılır.

Yerel Sayfa Nedir?

Doğal Poliakrilamid jel elektroforezi (Native Page), denatüre edici olmayan bir jel kullanır. Bu nedenle, SDS veya başka herhangi bir denatüre edici ajan jel matrisine eklenmez. Native Page'da proteinlerin ayrılması, proteinin yüküne ve büyüklüğüne bağlıdır. Bu nedenle, proteinin hareketliliği proteinin yüküne ve büyüklüğüne bağlıdır.

Proteinin yükü amino asitlerin yan zincirlerine bağlıdır. Yan zincirler negatif yüklenirse, protein genel bir negatif yük alacaktır veya bunun tersi de geçerlidir. Proteinler, meydana gelen katlanma nedeniyle 3 boyutlu bir konformasyon sağlar. Disülfür bağları, hidrofobik etkileşimler ve Hidrojen bağları gibi proteinlerdeki çeşitli bağ türlerinden katlanma sonuçları. Bu nedenle, eğer doğal Sayfa nötr bir pH değerinde taşınırsa, proteinler proteinin moleküler şekline göre ayrılır. Bu nedenle, Native Page, proteinin yükündeki veya uyumundaki değişikliği tespit etmek için hassas bir teknik olarak kullanılabilir.

Yerli Sayfa'nın ana avantajı, Sayfa analizi için kullanılan proteinin Sayfa analizi sonrasında orijinal durumunda geri kazanılabilmesidir, çünkü işlem sırasında protein rahatsız edilmez. Native Page nispeten yüksek bir verim tekniğidir ve proteinin stabilitesi artar.

Şekil 02: Yerel Sayfa

Jel çalışması tamamlandıktan sonra, Native Page jeli bromofenol mavisi veya başka herhangi bir uygun boyama reaktifi ile lekelenerek görüntülenebilir. Native Page uygulamaları, insan rekombinant eritropoietin gibi glikoproteinleri içeren asidik proteinlerin ayrılmasını veya Sığır Serum Albumininde (BSA) bulunan proteinlerin tanımlanmasını içerir..

SDS Sayfası ile Yerel Sayfa Arasındaki Benzerlikler Nelerdir??

• Hem SDS Sayfası hem de Native Page sistemleri, jel matrisi olarak poliakrilamid jel kullanır.
• Her ikisi de proteinlerin ayrılması ve tanımlanması için kullanılır.
• Her ikisi de bileşikleri ayırmak için elektroforetik mobilite kullanır.
• Her ikisi de dikey veya yatay olarak yapılabilir (çalışma uzunluğu daha fazla olduğu için çoğunlukla dikey Sayfa ayarları olarak yapılır).
• Jel tankı, taraklar, güç kaynağı dahil elektroforez cihazı, her iki tekniğin çalışması için gereklidir.
• Jelin görüntülenmesi her iki teknikte de boyama yöntemleri ile yapılabilir..

SDS Sayfası ile Yerel Sayfa Arasındaki Fark Nedir??

SDS Sayfası ve Yerel Sayfa
SDS Sayfası veya Sodyum-dodesil sülfat Sayfası proteinleri moleküler ağırlıklarına göre ayırır ve denatüre edici bir jel kullanır..	Native Page, denatüre edici olmayan jeller kullanır ve proteinleri boyutlarına, yüklerine ve şekline göre ayırır (3D konformasyonu).
Jel Tipi
SDS sayfasında bir denatüre jel kullanılır.	Ana sayfada denatüre edici olmayan bir jel kullanılır.
SDS varlığı
SDS, SDS sayfasındaki numuneye negatif şarj uygulamak için deterjan olarak bulunur.	SDS yerel sayfada mevcut değil.
Ayırma Temeli
Proteinlerin ayrılması SDS sayfasındaki proteinin molekül ağırlığına bağlıdır.	Ayırma, ana sayfadaki protein molekülünün boyutuna ve şekline bağlıdır.
Proteinin Kararlılığı
SDS sayfasında proteinin stabilitesi düşük.	Protein stabilitesi ana sayfada yüksektir.
Orijinal Proteinin Geri Kazanımı
SDS sayfasında denatüre olduğu için mümkün değil.	Ana sayfada mümkün.

özet - SDS Sayfası ve Yerel Sayfa

SDS Sayfası ve Native Page, proteinleri ayırmak için kullanılan iki çeşit Poliakrilamid jel elektroforez tekniğidir. SDS Sayfası, SDS adı verilen bir deterjanla muamele edilir. SDS, proteine ​​genel bir negatif yük verir, bu da proteinin denatürasyonuna neden olur. Bu nedenle proteinler, moleküler ağırlıklarına göre ayrılır. Buna karşılık, Native Page tekniği herhangi bir denatürasyon ajanı kullanmaz. Böylece proteinler, boyutlarına veya şekline göre ayrılır. Bu, SDS sayfası ile yerel sayfa arasındaki farktır.

Referans:

1. “Poliakrilamid Jel Elektroforezinin Prensibi ve Yöntemi (SDS-PAGE).” Poliakrilamid Jel Elektroforezinin Prensibi ve Yöntemi (SDS-PAGE) | MBL Yaşam Sience -ASIA-. Burada mevcut
2. “Yerli Jeller.” İttifak Protein Laboratuvarları Biyofiziksel Karakterizasyon Hizmetleri. Burada mevcut  

Görünüm inceliği:

1.'SDS-PAGE Elektroforez: İngilizce Wikipedia'da Bensaccount, Commons Wikimedia üzerinden (CC BY 3.0)  
2- Commons Wikimedia üzerinden Ljubljana, Slovenya'dan (CC BY-SA 2.0) Blaz Nemec tarafından poliakrilamid jel elektroforezine bir örnek yükleyin.