ShRNA ve siRNA Arasındaki Fark

shRNA ve siRNA

RNA enterferansı (RNAi) sırasında, bir hedef genin ekspresyonu, yüksek özgüllük ve seçicilik ile düşürülür. RNAi doğal bir süreçtir ve karışan küçük RNA (siRNA) ve kısa saç tokası RNA (shRNA) ve iki fonksiyonlu shRNA'yı içerir. Günümüzde RNAi, kişiselleştirilmiş kanser terapisi için bir araç olarak yaygın olarak kullanılmaktadır. RNAi uygulamaları temel olarak kimyasal olarak sentezlenmiş çift sarmallı siRNA ve vektör bazlı shRNA molekülleri ile yapılır. Bu iki molekül benzer fonksiyonel sonuçlara sahip olmalarına rağmen, yapılarında farklılık gösterirler; bu nedenle, bu iki molekülün moleküler etki mekanizmaları, RNA yolları ve hedef dışı etkileri de farklıdır.

shRNA

shRNA, RNAi sırasında hedef gen ekspresyonunu susturmak için kullanılabilen sıkı bir saç tokası dönüşü yapan küçük RNA molekülünün bir dizisidir. ShRNA'nın ekspresyonu, bir virüs veya bakteri olabilen bir vektör veya plazmidlerin verilmesi ile elde edilir. Hücre çekirdeğinde sentezlenir ve daha sonraki işlemler için sitoplazmaya taşınırlar. Bu moleküller miRNA'nın benzer olgunlaşma yollarına sahiptir; dolayısıyla miRNA sentezi, shRNA sentezinin anlaşılması için zemin hazırlamıştır. RNA polimeraz II veya III, shRNA'yı RNA polimeraz II veya III promotörleri yoluyla transkripsiyon yapabilir. ShRNA'ların kullanımının avantajı, nispeten düşük bozunma ve devir hızına sahip olmalarıdır. Dezavantajı, bazı güvenlik sorunlarına neden olabilecek bir ifade vektörüne ihtiyaç duymasıdır..

siRNA

siRNA'lar, 20-25 baz çifti uzunluğunda çift sarmallı RNA molekülleridir. Bunlar RNAi yolunda herhangi bir geni tamamlayıcı nükleotit sekansı ile susturmak suretiyle gen supresyonu için kullanılır. Geçici etki nedeniyle siRNA'nın transfeksiyonu ile gen yıkımı genellikle başarısız olur; özellikle hızlı bölünen hücrelerde ve baskılama daha uzun sürmez. Bu sorunun üstesinden gelmek için siRNA, kısa bir saç tokası yapısı eklenerek modifiye edilir. Bu değiştirilmiş molekül daha sonra shRNA olarak bilinir. shRNA normal işlevine devam etmek için bir Dicer tarafından siRNA'ya dönüştürülmelidir.

ShRNA ve siRNA arasındaki fark nedir?

• siRNA'nın aksine, shRNA ekstra bir saç tokası yapısına sahiptir. shRNA, siRNA'nın modifiye edilmiş bir versiyonudur.

• shRNA bir ekspresyon vektörü gerektirirken siRNA gerektirmez.

• shRNA uzun süreli yıkım için kullanılabilirken siRNA sadece kısa süreli gen yıkım için kullanılabilir.

• siRNA'nın gen supresyonunun aksine, shRNA'nın supresyonu uzun ömürlüdür ve uygun bir viral vektör yoluyla sokulursa, kalıcı gen susturucu etkiler üretebilir.

• Dicer, normal işlevlerini yerine getirmek için shRNA'yı tekrar siRNA molekülüne dönüştürmek zorundadır..