DNA, hücre bölünmesi ile iki yavru hücreye bölünmek için bir hücre tarafından gereklidir. DNA, DNA replikasyonu ile çoğaltılır. Bu nedenle, yüksek oranda sarılı spiral DNA'yı çoğaltmak için özel bir mekanizma olmalıdır. Topoizomeraz, DNA'yı belirli bir noktada kesebilen ve DNA bükülmesini çözen ve DNA süpercoil doğasını hafifleten bir enzimdir. DNA'nın sarılmasına ve çözülmesine katılan enzimdir. DNA'nın sarım problemi, çift sarmallı DNA'nın iç içe yapısı nedeniyle ortaya çıkar. DNA ikiye katlanmış ipliklerinde oluşturulan bu tip topolojik problemler topoizomerazlar ile düzeltilebilir. Genellikle DNA fosfat omurgasını bir ya da her iki ipliği keser ve DNA süpercoil yapısının açılmasına izin verir. Daha sonra DNA omurgası tekrar kapatılır. Bakteriyel ve insan topoizomerazları benzer mekanizmalara sahiptir. Topoizomeraz I ve II, süper sarmal DNA ile başa çıkma yöntemleridir. Topoizomeraz I, çift sarmallı DNA'da bir sarmal keser ve işlevi için ATP gerekmez. Öte yandan Topoizomeraz II, DNA'daki her iki ipliği de keser ve aktivitesi için ATP'ye ihtiyaç duyar. Bu temel fark Topoizomeraz I ve II arasında.
1. Genel Bakış ve Temel Fark
2. Topoizomeraz Nedir I
3. Topoizomeraz Nedir II
4. Topoizomeraz I ve II Arasındaki Benzerlikler
5. Yan Yana Karşılaştırma - Tablo Formunda Topoizomeraz I ve II
6. Özet
Topoizomeraz I, DNA süper-sargısının düzenlenmesini içeren bir enzim sınıfıdır. Tek sarmallı kopmalar oluşturarak ve DNA sarmallarını kümeleyerek DNA'daki süper sargıyı yönetirler. Rolleri DNA replikasyonu ve transkripsiyonu için son derece önemlidir. Bunlar ayrıca tip IA ve tip IB olarak alt gruplara ayrılır. Tip IA topoizomerazlara prokaryotik topoizomerazlar I denir. Diğer taraftan, tip IB topoizomerazlara ökaryotik topoizomerazlar I denir. Tip IA ve tip IB topoizomerazlar fonksiyonel olarak farklıdır. Prokaryotik topoizomeraz I sadece negatif DNA süpercoillerini yeniden yaşayabilir. Ve ökaryotik topoizomeraz pozitif DNA süpercoilleri ekleyebilirim, ayrıca replikasyondan sonra kızı kromozomunun DNA'sını ayırırlar ve bu DNA'yı gevşetirler.
Resim 01: Topoizomeraz I ve II
E.coli topoizomeraz I, karboksi terminaline yakın tetrasistein motiflerinde üç Zn (II) atomu olan bir holoenzimdir. Ağırlığı 97 kDa'dır. Topoizomeraz I, bazı olağandışı özelliklere sahiptir. DNA'nın topolojik yeniden düzenlenmesini katalizlemek için ATP hidrolizine gerek yoktur. Topoizomeraz I'in mevcut özelliği, tamamen işlevsel bir monomerdir, karmaşık DNA topolojik yeniden düzenlemelerini içeren enzimlerin çoğu oligomeriktir..
DNA düğümlerini ve süper bobinlerini yönetmek için, tip II topoizomeraz her iki DNA ipliğini aynı anda keser. Bu aktivite için ATP hidrolizine ihtiyaçları vardır. Tip II topoizomeraz dairesel DNA'nın bağlantı sayısını ± 2 olarak değiştirir. Tipik olarak Tip II A ve Tip IIB olmak üzere iki kategoriye ayrılırlar..
Resim 02: Topoizomeraz II
Tipler II Bir topoizomeraz, bakteriyel DNA girazı, ökaryotik topoizomeraz II, ökaryal viral topoizomeraz alfa ve beta ve topoizomeraz IV'ü içerir. Tip II B topoizomerazlar arasında arkeada bulunan topoizomeraz VI ve yüksek bitkilerde bulunan topoizomeraz VI bulunur. Topoizomeraz II'nin işlevi, bir DNA çift sarmalının her iki telini de keser ve içinden başka bir kırılmamış DNA sarmalı geçirir. Son olarak, kesilen uçlar tekrar düşürülür. Topoizomeraz II için inhibitör molekülleri, Hu-331, ICRF-193 ve mitindomid olarak bulunabilir..
Topoizomeraz I vs Topoizomeraz II | |
Tip I topoizomeraz, tek iplikçik kopmalarına ve düşmeye neden olarak DNA'nın süper sarılma derecesini değiştiren bir enzimdir. | Tip II topoizomeraz, çift zincirin kopmasına ve düşmesine neden olarak DNA'nın süper sarılma derecesini değiştiren bir enzimdir. |
ATP Hidrolize | |
Topoizomeraz I işlevi için ATP hidrolizine ihtiyaç duymaz. | Topoizomeraz II'nin işlevi için ATP hidrolizine ihtiyacı olmalıdır. |
DNA Kırma | |
Topoizomeraz I tek iplikçik kopması yapar. | Topoizomeraz II çift iplik kopuyor. |
yapı | |
Topoizomeraz I bir monomerdir. | Topoizomeraz II bir heterodimerdir. |
Dairesel DNA'nın Bağlanma Sayısının Değiştirilmesi | |
Topoizomeraz I, dairesel DNA'nın bağlantı sayısını katı 1 veya 1 (n) katları ile değiştiriyor. | Topoizomeraz II, dairesel DNA'nın bağlantı sayısını ± 2 birim değiştiriyor. |
Topoizomerazlar, DNA'nın sarılması veya çözülmesinde rol oynayan enzimlerdir. DNA süpercoillerini rahatlatırlar ve DNA replikasyonu ve transkripsiyonunu kolaylaştırırlar. Bu enzimler aşağıdakiler gibi hemen hemen tüm organizmalarda bulunabilir; insanlar, bakteriler, yüksek bitkiler, diğer bakteriler ve arkeler. Topolojik DNA yeniden düzenlemeleri topoizomerazlarla yapılır. Topoizomeraz I'in fonksiyonu için ATP hidrolizine gerek yoktur. Topoizomeraz I, DNA'da tek ipliği keser. Öte yandan topoizomeraz II, DNA'daki her iki ipliği de keser ve işlevleri veya aktiviteleri için ATP'ye ihtiyaç duyar. Daha sonra DNA omurgasındaki bu kesikler tekrar kapatılır. Bakteriyel ve insan topoizomerazları doğada benzer mekanizmalara sahiptir. Bu Topoizomeraz I ve II arasındaki farktır.
Bu makalenin PDF sürümünü indirebilir ve alıntı notuna göre çevrimdışı amaçlar için kullanabilirsiniz. Lütfen PDF sürümünü buradan indirin. Topoizomeraz I ve II Arasındaki Fark
1.Topoizomeraz I. Burada bulunabilir
2. “Tip II topoizomeraz.” Wikipedia, Wikimedia Foundation, 6 Kasım 2017. Buradan erişebilirsiniz
3. “Tip I topoizomeraz.” Vikipedi, Wikimedia Foundation, 28 Kasım 2017. Buradan erişebilirsiniz
1. 'Topoizomeraz İnhibitörü' Vtvu tarafından - Commons Wikimedia üzerinden kendi çalışması, (CC BY-SA 3.0)
2.'2rgr 'Coachwd tarafından İngilizce Wikipedia'da (CC BY-SA 3.0) Commons Wikimedia üzerinden