Akış yukarı ve akış aşağı DNA arasındaki fark

Temel Fark - Memba vs Memba DNA
 

Akış yukarı ve akış aşağı DNA arasındaki farkı anlamak için DNA'nın bileşimi ve yapısı hakkında genel bir bilgiye sahip olmak önemlidir. DNA polinükleotid zincirlerinden oluşur. Nükleotidler, polinükleotid zincirleri oluşturan yapı taşlarıdır ve her bir nükleotit, üç bileşenden oluşur: beş karbonlu şeker, azotlu bir baz ve bir fosfat grubu. Bir fosfat grubu ve bir OH grubu, bir nükleotid içinde sırasıyla şeker molekülünün 5 'pozisyon karbonuna ve 3' pozisyon karbonuna bağlanır. Nükleotidler, bir nükleotidin 5 'fosfat grubu ile bitişik nükleotidin 3' OH grubu arasında oluşan fosfodiester bağlarıyla birleştirilir. Bir polinükleotid zincirinde bir serbest 5 'fosfat grubu varsa, 5' ucu olarak atanır; eğer serbest 3 'OH grubuna sahipse, 3' ucu olarak atanır. Bu nedenle, DNA zincirleri genellikle polinükleotid zincirlerinin uç konumlarına göre 5 've 3' uçlarına sahiptir. DNA ayrıca çift sarmallı form olarak bulunur. İki iplik birbirine paraleldir. Bu nedenle DNA'nın 5 'ila 3' yönüne ve 3 'ila 5' yönüne doğru ilerleyen iki ipliği vardır. Akış yukarı ve akış aşağı DNA, 5 'ila 3' mRNA dizisinin transkripsiyonu ve sentezine atıfta bulunarak belirtilir. DNA, transkripsiyon başlatma bölgesinden kodlayıcı ipliğin 5 ucuna doğru kabul edilirse, yukarı akış DNA'sı olarak bilinir. DNA'nın transkripsiyon başlatma bölgesinden kodlayıcı iplikçikten 3 'ucuna doğru olduğu düşünülürse, akış aşağı DNA olarak bilinir. Bu, yukarı akış ve aşağı akış DNA arasındaki temel farktır.

İÇİNDEKİLER
1. Genel Bakış ve Temel Fark
2. Memba DNA'sı nedir
3. Akış aşağı DNA nedir
4. Yan Yana Karşılaştırma - Memba vs Memba DNA
5. Özet

Memba DNA'sı nedir?

Bir gen, bir organizmanın DNA'sında bulunan yapısal ve fonksiyonel bir birim kalıtımdır. Bir protein oluşturma talimatları ile saklanır. Gen, bir DNA molekülünün spesifik bir bölgesine sahiptir. Gerektiğinde, bir mRNA zincirinin sentezi yoluyla bir proteine ​​transkripte olur ve çevirir. Normal olarak, genin bir kodlayıcı şeridi 5 'ila 3' yönünde ilerler. Kopyalandığında, 5 'ila 3' aynı yönde bir mRNA ipliği üretir. Transkripsiyon sırasında, 3 'ila 5' antisens ipliği şablon ipliği olarak kullanılır ve mRNA sentezini başlatır. Gende bir transkripsiyon başlatma bölgesi vardır. Transkripsiyon başlama bölgesine referansla, kodlayıcı ipliğin 5 'ucuna doğru DNA bölgesi, yukarı akım DNA olarak bilinir. Genin bir promotörü normalde DNA'nın yukarı akış bölgesinde bulunur. Ökaryotik genlerde, TATA kutuları, promotör proksimal elemanları ve genin yukarısındaki bölgede güçlendiriciler bulunur. Genin akış yukarı bölgesi negatif sayılarla belirtilir. Bir genin yukarı akış DNA'sı transkripsiyon için çok önemlidir.

Akış aşağı DNA nedir?

Transkripsiyon başlama bölgesi, bir genin +1 noktası olarak bilinir. Kodlama ipliğinin +1 noktasından 3 'ucuna doğru DNA bölgesi, akış aşağı DNA olarak bilinir. Başka bir deyişle, genin akış aşağısı transkripsiyon başlatma bölgesinden şablon ipliğinin 5 'ucuna doğrudur. Bu nedenle, bir gen bölgesinin akış aşağı DNA'sı, transkripsiyonel birim ve terminatör dizisi gibi diğer dizileri içerir. Destekleyici, bir genin aşağı akış dizisini etkileyebilir. Bir genin aşağı akış kısmına pozitif sayılarla değinilmektedir. Bir genin aşağı akış DNA'sı, protein ürününü veren gerçek bölgedir.

Şekil 01: Akış Yukarı ve Akış Aşağı DNA

Upstream ve Downstream DNA arasındaki fark nedir?

Akış yukarı ve akış aşağı DNA
Transkripsiyon başlatma bölgesinden kodlama sekansının 5 'ucuna doğru DNA bölgesi, yukarı akım DNA olarak bilinir.	Transkripsiyon başlatma bölgesinden kodlama zincirinin 3 'ucuna doğru DNA bölgesi, aşağı akım DNA olarak bilinir.
Elementler
Destekleyiciler ve güçlendiriciler, yukarı akış DNA'sında bulunur	Transkripsiyon ünitesi ve terminatör sekansları, aşağı akım DNA'sında bulunur.
Numaralama
Memba bölgesindeki nükleotidlere negatif sayılar	Nükleotidler pozitif sayılarla ifade edilir.
fonksiyon
Bu bölge transkripsiyonu düzenlemek ve başlatmak için gerekli elementler içerir	Bu bölge bir protein üretmek ve transkripsiyonu sonlandırmak için talimatlar içerir

Özet - Memba vs Memba DNA

Bir RNA dizisinin yukarı ve aşağı akışını tanımlamak kolaydır. Referans bölgesi ile ilgili olarak, RNA dizisinin 5 'ucuna doğru olan bölge, yukarı akış RNA olarak bilinirken, 3' ucuna doğru olan bölge, aşağı akım RNA olarak bilinir. Bununla birlikte, DNA'da her iki yönde 5 'ila 3' ve 3 'ila 5' boyunca uzanan iki iplikçik vardır. Bu nedenle, yukarı ve aşağı DNA arasındaki fark karmaşıktır. Bu nedenle, bir genin transkripsiyonuna referansla ayrılır. Transkripsiyon başlatma bölgesinden sense ipliğin 5 ucuna doğru DNA bölgesi, yukarı akış DNA olarak bilinirken, transkripsiyon başlatma bölgesinden sense ipliğin 3 'ucuna doğru aşağı akım DNA olarak bilinir. DNA'nın yukarı ve aşağı akışları arasındaki fark budur..

Referanslar:
1. Rhee, Amy C., Benjamin H. Somerlot, Neeta Parimi ve Jonatha M. Gott. “Physarumediting sitelerinin akış yukarı ve akış aşağı sekansları için farklı roller.” RNA. Cold Spring Harbor Laboratuvarı Yayınları, Eylül 2009. Web. 18 Mart 2017

Görünüm inceliği:
1. Barbosa, Cristina, Isabel Peixeiro ve Luísa Romão. “Memba Açık Okuma Çerçeveleri ve İnsan Hastalıkları ile Gen İfade Düzenlemesi.” PLOS Genetiği. Halk Kütüphanesi, n.d. Ağ. 18 Mart 2017.