Tüm Genom Sekanslama ve Eksom Sekanslama Arasındaki Fark

temel fark tüm genom dizilimi ve ekzom dizilimi arasında tüm genom dizilemesi bir organizmanın tüm genomunu dizilerken, ekzom dizilemesi bir organizmanın sadece ekzomunu veya protein kodlayan genlerini diziler.

Sekanslama, belirli bir DNA molekülündeki nükleotitlerin kesin sırasını belirleyen bir tekniktir. Sadece dört bazın doğru sırasını yansıtır; bir DNA fragmanında adenin (A), guanin (G), sitozin (C) ve timin (T). Sanger sekanslama, yeni nesil sekanslama, vb.Gibi çeşitli sekanslama yöntemleri vardır. Ayrıca, bir organizmanın tam genomu (tüm genom sekanslama) veya sadece genomdaki protein kodlayıcı genler (ekzom sekanslama) sekanslamaya tabi tutulabilir..

İÇİNDEKİLER

1. Genel Bakış ve Temel Fark
2. Bütün Genom Sekanslama Nedir
3. Ekzom Sekanslama Nedir
4. Tüm Genom Sekanslama ve Eksom Sekanslama Arasındaki Benzerlikler
5. Yan Yana Karşılaştırma - Tüm Genom Sekanslama vs Exom Sekanslama Tabular Formunda
6. Özet

Tüm Genom Sekanslama Nedir?

İnsan genomu yaklaşık üç milyar baz çift DNA içerir. Tüm genom dizilemesi, bir organizmanın tam genomunu dizileyen bir yöntemdir. Bu nedenle, tüm genom dizilemesinde, eksomlar, intronlar, interjenik uzaylar, vb. Dahil olmak üzere DNA moleküllerinin tüm koleksiyonu üzerinde durulmaktadır. Dahası, tüm genom dizileme dizileri sadece çekirdeğin içinde bulunan genomu değil, aynı zamanda mitokondriyal DNA'yı da içerir..

Şekil 01: Tüm Genom Dizileme

Bu sekanslama için hazırlanırken, ilk adım tüm DNA'yı çıkarmaktır. Daha sonra ekstrakte edilen DNA, uygun bir sekanslama yöntemi kullanılarak sekanslama prosedürüne tabi tutulur. Elde edilen sekansları analiz ederek, bir biyoinformatik aracı kullanarak, nadir görülen hastalıkları, kanseri, bulaşıcı hastalıkları vb..

Ekzom Sekanslama Nedir?

Exome, genomun yaklaşık% 1.5'ini içeren genomun bir parçasıdır ve eksonların toplanmasıdır. Eksonlar, mRNA'ya ve daha sonra nihai protein ürününe kopyalanan sekanslardır. Bu nedenle, ekzom dizilemesi, genomdaki tüm protein kodlayıcı dizileri diziler. Egom dizilimi genetik bozuklukları ortaya çıkarır çünkü genetik bozuklukların çoğu protein kodlayan genlerin mutasyonları nedeniyle ortaya çıkar. Bu nedenle, genetik bozuklukların teşhis süreçleri, hastalığı teşhis etmek için sıklıkla bir yöntem olarak ekzom dizilimi kullanır. Ayrıca, genetik test için tüm genom dizileme uygulaması ile karşılaştırıldığında, egzom dizilemenin kullanılması daha az zaman alır ve daha ucuzdur.

Resim 02: Egome Sekanslama

Ekzom sekanslamada, ilk önce sadece toplam DNA'dan protein kodlayan sekansların seçilmesi gerekir. İnsanların yaklaşık 180000 protein kodlayıcı diziye sahip olduğuna dikkat edin. Daha sonra ekzom, yüksek verimli bir sekanslama yöntemi kullanılarak sekanslanır.

Tüm Genom Sekanslama ve Eksom Sekanslama Arasındaki Benzerlikler Nelerdir??

• Tüm Genom Sekanslama ve Exome Sekanslama iki sekanslama uygulamasıdır.
• Her iki yöntem de, her iki yöntemde de nükleotit sekansının doğru sırasının belirlenmesinde faydalıdır.
• Ayrıca, biyoinformatik her iki teknikte de verileri analiz etmeye yardımcı olur.

Tüm Genom Sekanslama ve Exome Sekanslama Arasındaki Fark Nedir??

Tüm genom dizilemesi bir organizmanın genomunun tüm DNA'sını dizilerken, ekzom dizilimi sadece genomdan protein kodlayan dizileri diziler. Bu nedenle, bu tüm genom dizilimi ve ekzom dizilimi arasındaki temel farktır. Ayrıca, her iki yöntem de nükleotit sekansının doğru sırasını belirlemek için yaygın olarak kullanılmasına rağmen, tüm genom sekanslaması ekzom sekanslamasından daha maliyetli ve zaman alıcıdır.

Aşağıdaki infografik, tüm genom dizilimi ve ekzom dizilemesi arasındaki farkı tablolar..

Özet - Tüm Genom Sekanslama vs Eksom Sekanslama

Sekanslama, bir DNA fragmanındaki bazların kesin sırasını ortaya çıkarır ve ya tam genom sekanslama veya ekzom sekanslama olabilir. Burada, tüm genom dizilemesi bir organizmanın tam genomunu dizilerken, ekzom dizilimi sadece genomdaki protein kodlayıcı dizileri diziler. Uygulamalarını göz önünde bulundurarak, tüm genom dizilimi, tüm genomda tek nükleotid varyasyonları, delesyonları, eklemeler, vb. Gibi genetik sapmaların analiz edilmesinde yardımcı olurken, ekzom dizilemesi genetik hastalıkların saptanmasında yardımcı olmaktadır. Bu nedenle, bu tüm genom dizilimi ve ekzom dizilimi arasındaki farktır.

Referans:

1. “Tüm-Genom ve Tüm-Ekzom Sekanslama ve Hedeflenen Sekans Panelleri.” Healio, SLACK A.Ş. Burada mevcut  
2. “Tüm Ekzom Sekanslama ve Tüm Genom Sekanslama Nedir? - Genetik Ev Referansı - NIH. ” ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi, Ulusal Sağlık Enstitüleri. Burada mevcut  

Görünüm inceliği:

1. ”Tüm genom av tüfeği sıralamasına karşı Hiyerarşik av tüfeği sıralaması” Commins, J., Toft, C., Fares, M. A. (CC BY-SA 2.5) Commons Wikimedia üzerinden  
2. ”Egome Sekanslama İş Akışı 1a” SarahKusala tarafından - Commons Wikimedia üzerinden kendi çalışması, (CC BY 3.0)